RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522111.2

TRNP1-201, Transcript of TMF1-regulated nuclear protein 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRNP1, Length 1,958 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNP1-201ENST00000522111 SH3BP4Q9P0V3 963 aa25.95■■□□□ 1.74
TRNP1-201ENST00000522111 PILRAQ9UKJ1 303 aa25.95■■□□□ 1.74
TRNP1-201ENST00000522111 PRORSD1PA6NEY8 169 aa25.94■■□□□ 1.74
TRNP1-201ENST00000522111 NME4O00746 187 aa25.94■■□□□ 1.74
TRNP1-201ENST00000522111 P2RX6O15547 441 aa25.94■■□□□ 1.74
TRNP1-201ENST00000522111 PCSK2P16519 638 aa25.94■■□□□ 1.74
TRNP1-201ENST00000522111 CNR2P34972 360 aa25.94■■□□□ 1.74
TRNP1-201ENST00000522111 DPY19L1Q2PZI1 675 aa25.94■■□□□ 1.74
TRNP1-201ENST00000522111 ADPRMQ3LIE5 342 aa25.94■■□□□ 1.74
TRNP1-201ENST00000522111 TMEM35AQ53FP2 167 aa25.94■■□□□ 1.74
TRNP1-201ENST00000522111 CPTPQ5TA50 214 aa25.94■■□□□ 1.74
TRNP1-201ENST00000522111 C6orf163Q5TEZ5 329 aa25.94■■□□□ 1.74
TRNP1-201ENST00000522111 ZNF793Q6ZN11 406 aa25.94■■□□□ 1.74
TRNP1-201ENST00000522111 INPP5KQ9BT40 448 aa25.94■■□□□ 1.74
TRNP1-201ENST00000522111 GAREM1Q9H706 876 aa25.94■■□□□ 1.74
TRNP1-201ENST00000522111 MYNNQ9NPC7 610 aa25.94■■□□□ 1.74
TRNP1-201ENST00000522111 SLC6A13Q9NSD5 602 aa25.94■■□□□ 1.74
TRNP1-201ENST00000522111 A0A1B0GTQ1 180 aa25.93■■□□□ 1.74
TRNP1-201ENST00000522111 FAM86C2PA6NEL3 165 aa25.93■■□□□ 1.74
TRNP1-201ENST00000522111 TMPRSS11DO60235 418 aa25.93■■□□□ 1.74
TRNP1-201ENST00000522111 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
TRNP1-201ENST00000522111 GFERP55789 205 aa25.93■■□□□ 1.74
TRNP1-201ENST00000522111 C21orf58P58505 322 aa25.93■■□□□ 1.74
TRNP1-201ENST00000522111 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
TRNP1-201ENST00000522111 PWP1Q13610 501 aa25.93■■□□□ 1.74
TRNP1-201ENST00000522111 CCDC6Q16204 474 aa25.93■■□□□ 1.74
TRNP1-201ENST00000522111 DUOXA1Q1HG43 343 aa25.93■■□□□ 1.74
TRNP1-201ENST00000522111 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP25.93■■□□□ 1.74
TRNP1-201ENST00000522111 SLC15A3Q8IY34 581 aa25.93■■□□□ 1.74
TRNP1-201ENST00000522111 ZBTB44Q8NCP5 570 aa25.93■■□□□ 1.74
TRNP1-201ENST00000522111 HIPK4Q8NE63 616 aa25.93■■□□□ 1.74
TRNP1-201ENST00000522111 OR8K5Q8NH50 307 aa25.93■■□□□ 1.74
TRNP1-201ENST00000522111 STARD8Q92502 1023 aa25.93■■□□□ 1.74
TRNP1-201ENST00000522111 SEMA6CQ9H3T2 930 aa25.93■■□□□ 1.74
TRNP1-201ENST00000522111 REEP4Q9H6H4 257 aa25.93■■□□□ 1.74
TRNP1-201ENST00000522111 SERHLQ9NQF3 203 aa25.93■■□□□ 1.74
TRNP1-201ENST00000522111 CMTM6Q9NX76 183 aa25.93■■□□□ 1.74
TRNP1-201ENST00000522111 ANKMY1Q9P2S6 941 aa25.93■■□□□ 1.74
TRNP1-201ENST00000522111 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
TRNP1-201ENST00000522111 DFNA5O60443 496 aa25.93■■□□□ 1.74
TRNP1-201ENST00000522111 GSNP06396 782 aa25.93■■□□□ 1.74
TRNP1-201ENST00000522111 SLC35G6P0C7Q6 338 aa25.93■■□□□ 1.74
TRNP1-201ENST00000522111 ME2P23368 584 aa25.93■■□□□ 1.74
TRNP1-201ENST00000522111 OR1D5P58170 312 aa25.93■■□□□ 1.74
TRNP1-201ENST00000522111 FOXM1Q08050 763 aa25.93■■□□□ 1.74
TRNP1-201ENST00000522111 DEFB110Q30KQ9 67 aa25.93■■□□□ 1.74
TRNP1-201ENST00000522111 TRIM61Q5EBN2 209 aa25.93■■□□□ 1.74
TRNP1-201ENST00000522111 FAM71E1Q6IPT2 247 aa25.93■■□□□ 1.74
TRNP1-201ENST00000522111 NANOGP8Q6NSW7 305 aa25.93■■□□□ 1.74
TRNP1-201ENST00000522111 PRMT9Q6P2P2 845 aa25.93■■□□□ 1.74
TRNP1-201ENST00000522111 TRIM40Q6P9F5 258 aa25.93■■□□□ 1.74
TRNP1-201ENST00000522111 OR2L5Q8NG80 312 aa25.93■■□□□ 1.74
TRNP1-201ENST00000522111 NCSTNQ92542 709 aa25.93■■□□□ 1.74
TRNP1-201ENST00000522111 TGM7Q96PF1 710 aa25.93■■□□□ 1.74
TRNP1-201ENST00000522111 MAP3K3Q99759 626 aa25.93■■□□□ 1.74
TRNP1-201ENST00000522111 DUSP26Q9BV47 211 aa25.93■■□□□ 1.74
TRNP1-201ENST00000522111 SLC6A16Q9GZN6 736 aa25.93■■□□□ 1.74
TRNP1-201ENST00000522111 RMND5AQ9H871 391 aa25.93■■□□□ 1.74
TRNP1-201ENST00000522111 NANOGQ9H9S0 305 aa25.93■■□□□ 1.74
TRNP1-201ENST00000522111 FAM60AQ9NP50 221 aa25.93■■□□□ 1.74
TRNP1-201ENST00000522111 VAPAQ9P0L0 249 aa25.93■■□□□ 1.74
TRNP1-201ENST00000522111 KLHL3Q9UH77 587 aa25.93■■□□□ 1.74
TRNP1-201ENST00000522111 KLK4Q9Y5K2 254 aa25.93■■□□□ 1.74
TRNP1-201ENST00000522111 PCDH15Q96QU1 1955 aa25.92■■□□□ 1.74
TRNP1-201ENST00000522111 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa25.92■■□□□ 1.74
TRNP1-201ENST00000522111 MAP3K7O43318 606 aa25.92■■□□□ 1.74
TRNP1-201ENST00000522111 ATP6V1G2O95670 118 aa25.92■■□□□ 1.74
TRNP1-201ENST00000522111 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
TRNP1-201ENST00000522111 RGS1Q08116 209 aa25.92■■□□□ 1.74
TRNP1-201ENST00000522111 ZNF528Q3MIS6 628 aa25.92■■□□□ 1.74
TRNP1-201ENST00000522111 GTDC1Q4AE62 458 aa25.92■■□□□ 1.74
TRNP1-201ENST00000522111 ZNF385BQ569K4 471 aa25.92■■□□□ 1.74
TRNP1-201ENST00000522111 WASHC2DQ5SRD0 308 aa25.92■■□□□ 1.74
TRNP1-201ENST00000522111 ABHD17CQ6PCB6 329 aa25.92■■□□□ 1.74
TRNP1-201ENST00000522111 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP25.92■■□□□ 1.74
TRNP1-201ENST00000522111 OR8J2Q8NGG1 315 aa25.92■■□□□ 1.74
TRNP1-201ENST00000522111 ZCCHC10Q8TBK6 192 aa25.92■■□□□ 1.74
TRNP1-201ENST00000522111 MIEF2Q96C03 454 aa25.92■■□□□ 1.74
TRNP1-201ENST00000522111 QRFPRQ96P65 431 aa25.92■■□□□ 1.74
TRNP1-201ENST00000522111 KCNC2Q96PR1 638 aa25.92■■□□□ 1.74
TRNP1-201ENST00000522111 CGREF1Q99674 301 aa25.92■■□□□ 1.74
TRNP1-201ENST00000522111 ASXL3Q9C0F0 2248 aa25.91■■□□□ 1.74
TRNP1-201ENST00000522111 HCRTR1O43613 425 aa25.91■■□□□ 1.74
TRNP1-201ENST00000522111 FKBP9O95302 570 aa25.91■■□□□ 1.74
TRNP1-201ENST00000522111 FURINP09958 794 aa25.91■■□□□ 1.74
TRNP1-201ENST00000522111 CDKN2CP42773 168 aa25.91■■□□□ 1.74
TRNP1-201ENST00000522111 WNT3P56703 355 aa25.91■■□□□ 1.74
TRNP1-201ENST00000522111 MTPNP58546 118 aa25.91■■□□□ 1.74
TRNP1-201ENST00000522111 STXBP1P61764 594 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
TRNP1-201ENST00000522111 MUM1Q2TAK8 710 aa25.91■■□□□ 1.74
TRNP1-201ENST00000522111 FAM180BQ6P0A1 224 aa25.91■■□□□ 1.74
TRNP1-201ENST00000522111 CLECL1Q8IZS7 167 aa25.91■■□□□ 1.74
TRNP1-201ENST00000522111 RERGQ96A58 199 aaPredicted RBP25.91■■□□□ 1.74
TRNP1-201ENST00000522111 TMEM125Q96AQ2 219 aa25.91■■□□□ 1.74
TRNP1-201ENST00000522111 ITCHQ96J02 903 aa25.91■■□□□ 1.74
TRNP1-201ENST00000522111 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
TRNP1-201ENST00000522111 SMOC1Q9H4F8 434 aa25.91■■□□□ 1.74
TRNP1-201ENST00000522111 DDX31Q9H8H2 851 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
TRNP1-201ENST00000522111 MIEF1Q9NQG6 463 aa25.91■■□□□ 1.74
TRNP1-201ENST00000522111 ABCD2Q9UBJ2 740 aa25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.6 ms