RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461017.1

RABGEF1-206, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene RABGEF1, Length 711 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-206ENST00000461017 GALNT16Q8N428 558 aa6.61□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 TEX9Q8N6V9 391 aa6.61□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 RHEBL1Q8TAI7 183 aa6.61□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 UBTD2Q8WUN7 234 aa6.61□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 UCN3Q969E3 161 aa6.61□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 MS4A6EQ96DS6 147 aa6.61□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 PHF21BQ96EK2 531 aa6.61□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 POM121Q96HA1 1249 aa6.61□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 IMMP1LQ96LU5 166 aa6.61□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 NPAS2Q99743 824 aa6.61□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 NT5DC2Q9H857 520 aa6.61□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF160Q9HCG1 818 aa6.61□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 ANKHQ9HCJ1 492 aa6.61□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 MKKSQ9NPJ1 570 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa6.61□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 NECTIN3Q9NQS3 549 aa6.61□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 SEMA3GQ9NS98 782 aa6.61□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 GPRC5BQ9NZH0 403 aa6.61□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 TMEM216Q9P0N5 145 aa6.61□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP6.61□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF180Q9UJW8 692 aa6.61□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 MKL2Q9ULH7 1088 aa6.61□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 CDC14AQ9UNH5 594 aa6.61□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 CLDN16Q9Y5I7 305 aa6.61□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 SLC22A7Q9Y694 548 aa6.61□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 V9GYY5 206 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 SPTA1P02549 2419 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 A0A1W2PQ72 361 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 GOLGA8RI6L899 631 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 K7EPI3 171 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 RTCAO00442 366 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 PEX12O00623 359 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 E2F3O00716 465 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 OR7A17O14581 309 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 CLGNO14967 610 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 MAN1A2O60476 641 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 B4GALT2O60909 372 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 ETHE1O95571 254 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 HPP00738 406 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 TGFB1P01137 390 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 HEXBP07686 556 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 SERPINA6P08185 405 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 SLC35G6P0C7Q6 338 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 ITGAMP11215 1152 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 TSPAN8P19075 237 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 GRK3P35626 688 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 XCR1P46094 333 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 PIK3CGP48736 1102 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 SERPINB8P50452 374 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 SERPINB9P50453 376 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 BTN3A2P78410 334 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 TLE1Q04724 770 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP6.6□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 PCDH1Q08174 1060 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 AIMP2Q13155 320 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 MYBPC3Q14896 1274 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP6.6□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 PDK4Q16654 411 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 ADPRMQ3LIE5 342 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 TUBB8Q3ZCM7 444 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 XKR6Q5GH73 641 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 CRB2Q5IJ48 1285 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 B3GNTL1Q67FW5 361 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 TIFABQ6ZNK6 161 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 GOLGA7Q7Z5G4 137 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 CA13Q8N1Q1 262 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 TEX19Q8NA77 164 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 PLPP5Q8NEB5 264 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 CATSPER1Q8NEC5 780 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 TRPV3Q8NET8 790 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 OR52B6Q8NGF0 335 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 OR2W6PQ8NHA6 318 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 CCT6BQ92526 530 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 FER1L6-AS2Q96M78 137 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 CDK15Q96Q40 435 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 F2RL3Q96RI0 385 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 CSF3RQ99062 836 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 SORBS1Q9BX66 1292 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 MS4A8Q9BY19 250 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF700Q9H0M5 742 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 TSPYL1Q9H0U9 437 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 RHBGQ9H310 441 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 OR51B5Q9H339 312 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 PRDM7Q9NQW5 492 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 GPR83Q9NYM4 423 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGEF1-206ENST00000461017 XPR1Q9UBH6 696 aa6.6□□□□□ -1.35
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