RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567015.5

UTP4-208, Transcript of UTP4, small subunit processome component, human

TSL 2

Gene UTP4, Length 690 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UTP4-208	ENST00000567015	LRIT2	A6NDA9	550 aa		11.16	□□□□□ -0.62
UTP4-208	ENST00000567015	NCF1B	A6NI72	391 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
UTP4-208	ENST00000567015		A6NL46	340 aa		11.16	□□□□□ -0.62
UTP4-208	ENST00000567015	SYCE1L	A8MT33	242 aa		11.16	□□□□□ -0.62
UTP4-208	ENST00000567015	NCF1C	A8MVU1	366 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
UTP4-208	ENST00000567015	SGK494	L7N484	410 aa		11.16	□□□□□ -0.62
UTP4-208	ENST00000567015	FFAR3	O14843	346 aa		11.16	□□□□□ -0.62
UTP4-208	ENST00000567015	GPR42	O15529	346 aa		11.16	□□□□□ -0.62
UTP4-208	ENST00000567015	NDUFS4	O43181	175 aa		11.16	□□□□□ -0.62
UTP4-208	ENST00000567015	JRK	O75564	520 aa		11.16	□□□□□ -0.62
UTP4-208	ENST00000567015	ACSL3	O95573	720 aa		11.16	□□□□□ -0.62
UTP4-208	ENST00000567015	STATH	P02808	62 aa		11.16	□□□□□ -0.62
UTP4-208	ENST00000567015	ALPP	P05187	535 aa		11.16	□□□□□ -0.62
UTP4-208	ENST00000567015	SERPINA7	P05543	415 aa		11.16	□□□□□ -0.62
UTP4-208	ENST00000567015	HEXB	P07686	556 aa		11.16	□□□□□ -0.62
UTP4-208	ENST00000567015	COL6A2	P12110	1019 aa		11.16	□□□□□ -0.62
UTP4-208	ENST00000567015	NCF1	P14598	390 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
UTP4-208	ENST00000567015	CD22	P20273	847 aa		11.16	□□□□□ -0.62
UTP4-208	ENST00000567015	SOX11	P35716	441 aa		11.16	□□□□□ -0.62
UTP4-208	ENST00000567015	AGTR2	P50052	363 aa		11.16	□□□□□ -0.62
UTP4-208	ENST00000567015	RHAG	Q02094	409 aa		11.16	□□□□□ -0.62
UTP4-208	ENST00000567015	BMPR2	Q13873	1038 aa		11.16	□□□□□ -0.62
UTP4-208	ENST00000567015	NAA30	Q147X3	362 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
UTP4-208	ENST00000567015	PCBP2	Q15366	365 aa	Known RBP eCLIP	11.16	□□□□□ -0.62	3e-12	■■■■■ 48
UTP4-208	ENST00000567015	PDK4	Q16654	411 aa		11.16	□□□□□ -0.62
UTP4-208	ENST00000567015	NADK2	Q4G0N4	442 aa		11.16	□□□□□ -0.62
UTP4-208	ENST00000567015	SLC6A19	Q695T7	634 aa		11.16	□□□□□ -0.62
UTP4-208	ENST00000567015	TIFAB	Q6ZNK6	161 aa		11.16	□□□□□ -0.62
UTP4-208	ENST00000567015	TRMT10C	Q7L0Y3	403 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
UTP4-208	ENST00000567015	ABHD13	Q7L211	337 aa		11.16	□□□□□ -0.62
UTP4-208	ENST00000567015	VN1R5	Q7Z5H4	357 aa		11.16	□□□□□ -0.62
UTP4-208	ENST00000567015	IFT20	Q8IY31	132 aa		11.16	□□□□□ -0.62
UTP4-208	ENST00000567015	LAS2	Q8IYD9	372 aa		11.16	□□□□□ -0.62
UTP4-208	ENST00000567015	PRSS58	Q8IYP2	241 aa		11.16	□□□□□ -0.62
UTP4-208	ENST00000567015	CNPY4	Q8N129	248 aa		11.16	□□□□□ -0.62
UTP4-208	ENST00000567015	KRT78	Q8N1N4	520 aa		11.16	□□□□□ -0.62
UTP4-208	ENST00000567015	PPP4R1	Q8TF05	950 aa		11.16	□□□□□ -0.62
UTP4-208	ENST00000567015	KCTD4	Q8WVF5	259 aa		11.16	□□□□□ -0.62
UTP4-208	ENST00000567015	ESAM	Q96AP7	390 aa		11.16	□□□□□ -0.62
UTP4-208	ENST00000567015	PAFAH2	Q99487	392 aa		11.16	□□□□□ -0.62
UTP4-208	ENST00000567015	BARD1	Q99728	777 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
UTP4-208	ENST00000567015	WDR77	Q9BQA1	342 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
UTP4-208	ENST00000567015	TUBB6	Q9BUF5	446 aa		11.16	□□□□□ -0.62
UTP4-208	ENST00000567015	EFCAB11	Q9BUY7	163 aa		11.16	□□□□□ -0.62
UTP4-208	ENST00000567015	RIC8B	Q9NVN3	520 aa		11.16	□□□□□ -0.62
UTP4-208	ENST00000567015	WWOX	Q9NZC7	414 aa		11.16	□□□□□ -0.62
UTP4-208	ENST00000567015	CD274	Q9NZQ7	290 aa		11.16	□□□□□ -0.62
UTP4-208	ENST00000567015	FETUB	Q9UGM5	382 aa		11.16	□□□□□ -0.62
UTP4-208	ENST00000567015	NFU1	Q9UMS0	254 aa		11.16	□□□□□ -0.62
UTP4-208	ENST00000567015	MYO18B	Q8IUG5	2567 aa		11.15	□□□□□ -0.62
UTP4-208	ENST00000567015		A0A087WUV0	522 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
UTP4-208	ENST00000567015	NSG1	A0A0A6YYJ2	146 aa		11.15	□□□□□ -0.62
UTP4-208	ENST00000567015	CLEC18A	A5D8T8	446 aa		11.15	□□□□□ -0.62
UTP4-208	ENST00000567015	MAGEB17	A8MXT2	336 aa		11.15	□□□□□ -0.62
UTP4-208	ENST00000567015	C4orf51	C9J302	202 aa		11.15	□□□□□ -0.62
UTP4-208	ENST00000567015		K7EPI3	171 aa		11.15	□□□□□ -0.62
UTP4-208	ENST00000567015	CLGN	O14967	610 aa		11.15	□□□□□ -0.62
UTP4-208	ENST00000567015	CHST10	O43529	356 aa		11.15	□□□□□ -0.62
UTP4-208	ENST00000567015	DNAJB6	O75190	326 aa		11.15	□□□□□ -0.62
UTP4-208	ENST00000567015	RDH16	O75452	317 aa		11.15	□□□□□ -0.62
UTP4-208	ENST00000567015	PRR35	P0CG20	571 aa		11.15	□□□□□ -0.62
UTP4-208	ENST00000567015	ZNF888	P0CJ79	500 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
UTP4-208	ENST00000567015	C8orf89	P0DMQ9	161 aa		11.15	□□□□□ -0.62
UTP4-208	ENST00000567015	ICAM2	P13598	275 aa		11.15	□□□□□ -0.62
UTP4-208	ENST00000567015	ITGA3	P26006	1051 aa		11.15	□□□□□ -0.62
UTP4-208	ENST00000567015	GCA	P28676	217 aa		11.15	□□□□□ -0.62
UTP4-208	ENST00000567015	TYK2	P29597	1187 aa		11.15	□□□□□ -0.62
UTP4-208	ENST00000567015	SERPINB8	P50452	374 aa		11.15	□□□□□ -0.62
UTP4-208	ENST00000567015	ALDH18A1	P54886	795 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
UTP4-208	ENST00000567015	IRF9	Q00978	393 aa		11.15	□□□□□ -0.62
UTP4-208	ENST00000567015	LAPTM5	Q13571	262 aa		11.15	□□□□□ -0.62
UTP4-208	ENST00000567015	DOC2A	Q14183	400 aa		11.15	□□□□□ -0.62
UTP4-208	ENST00000567015	SLBP	Q14493	270 aa	Known RBP eCLIP	11.15	□□□□□ -0.62
UTP4-208	ENST00000567015	SETDB1	Q15047	1291 aa		11.15	□□□□□ -0.62
UTP4-208	ENST00000567015	RBBP5	Q15291	538 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
UTP4-208	ENST00000567015	DEFB134	Q4QY38	66 aa		11.15	□□□□□ -0.62
UTP4-208	ENST00000567015	TECRL	Q5HYJ1	363 aa		11.15	□□□□□ -0.62
UTP4-208	ENST00000567015	AGAP7P	Q5VUJ5	663 aa		11.15	□□□□□ -0.62
UTP4-208	ENST00000567015	H3F3C	Q6NXT2	135 aa		11.15	□□□□□ -0.62
UTP4-208	ENST00000567015	ADGRD1	Q6QNK2	874 aa		11.15	□□□□□ -0.62
UTP4-208	ENST00000567015	CLEC18B	Q6UXF7	455 aa		11.15	□□□□□ -0.62
UTP4-208	ENST00000567015	CPEB2	Q7Z5Q1	589 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
UTP4-208	ENST00000567015	PARP9	Q8IXQ6	854 aa		11.15	□□□□□ -0.62
UTP4-208	ENST00000567015	KBTBD2	Q8IY47	623 aa		11.15	□□□□□ -0.62
UTP4-208	ENST00000567015	SUPV3L1	Q8IYB8	786 aa	Known RBP eCLIP	11.15	□□□□□ -0.62
UTP4-208	ENST00000567015	PLD6	Q8N2A8	252 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
UTP4-208	ENST00000567015	TMEM151A	Q8N4L1	468 aa		11.15	□□□□□ -0.62
UTP4-208	ENST00000567015	CLEC18C	Q8NCF0	446 aa		11.15	□□□□□ -0.62
UTP4-208	ENST00000567015	ZCCHC10	Q8TBK6	192 aa		11.15	□□□□□ -0.62
UTP4-208	ENST00000567015	TM9SF4	Q92544	642 aa		11.15	□□□□□ -0.62
UTP4-208	ENST00000567015	GAL3ST3	Q96A11	431 aa		11.15	□□□□□ -0.62
UTP4-208	ENST00000567015	TBC1D20	Q96BZ9	403 aa		11.15	□□□□□ -0.62
UTP4-208	ENST00000567015	C8orf44	Q96CB5	159 aa		11.15	□□□□□ -0.62
UTP4-208	ENST00000567015	MS4A6E	Q96DS6	147 aa		11.15	□□□□□ -0.62
UTP4-208	ENST00000567015	AGAP4	Q96P64	663 aa		11.15	□□□□□ -0.62
UTP4-208	ENST00000567015	QRFPR	Q96P65	431 aa		11.15	□□□□□ -0.62
UTP4-208	ENST00000567015	YIPF2	Q9BWQ6	316 aa		11.15	□□□□□ -0.62
UTP4-208	ENST00000567015	NPL	Q9BXD5	320 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
UTP4-208	ENST00000567015	KLHL31	Q9H511	634 aa		11.15	□□□□□ -0.62
UTP4-208	ENST00000567015	ZBTB20	Q9HC78	741 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62

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