RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534610.5

ATG13-222, Transcript of autophagy related 13, humanhuman

TSL 5

Gene ATG13, Length 1,655 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG13-222ENST00000534610 ANXA6P08133 673 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG13-222ENST00000534610 GRIA3P42263 894 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG13-222ENST00000534610 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
ATG13-222ENST00000534610 PLIN5Q00G26 463 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG13-222ENST00000534610 TGM3Q08188 693 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG13-222ENST00000534610 CCNIQ14094 377 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG13-222ENST00000534610 OR4F3Q6IEY1 312 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG13-222ENST00000534610 IKBIPQ70UQ0 350 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG13-222ENST00000534610 WDR5BQ86VZ2 330 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG13-222ENST00000534610 OOSP2Q86WS3 158 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG13-222ENST00000534610 NUDT13Q86X67 352 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG13-222ENST00000534610 PLD3Q8IV08 490 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG13-222ENST00000534610 MFSD9Q8NBP5 474 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG13-222ENST00000534610 WDR48Q8TAF3 677 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG13-222ENST00000534610 C16orf78Q8WTQ4 265 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG13-222ENST00000534610 NUDT8Q8WV74 236 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG13-222ENST00000534610 ZUFSPQ96AP4 578 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG13-222ENST00000534610 PPM1MQ96MI6 270 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG13-222ENST00000534610 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
ATG13-222ENST00000534610 ECSITQ9BQ95 431 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG13-222ENST00000534610 DUSP26Q9BV47 211 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG13-222ENST00000534610 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
ATG13-222ENST00000534610 ZMYND15Q9H091 742 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG13-222ENST00000534610 REEP4Q9H6H4 257 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG13-222ENST00000534610 MYNNQ9NPC7 610 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG13-222ENST00000534610 HRASLS2Q9NWW9 162 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG13-222ENST00000534610 CMTM6Q9NX76 183 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG13-222ENST00000534610 SH3BP4Q9P0V3 963 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG13-222ENST00000534610 SLAMF8Q9P0V8 285 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG13-222ENST00000534610 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
ATG13-222ENST00000534610 ADAM29Q9UKF5 820 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG13-222ENST00000534610 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG13-222ENST00000534610 PCM1Q15154 2024 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG13-222ENST00000534610 RFXANKO14593 260 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG13-222ENST00000534610 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
ATG13-222ENST00000534610 AQP9O43315 295 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG13-222ENST00000534610 GMNNO75496 209 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG13-222ENST00000534610 GNSP15586 552 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG13-222ENST00000534610 UGT2B7P16662 529 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG13-222ENST00000534610 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
ATG13-222ENST00000534610 BCL6P41182 706 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG13-222ENST00000534610 FNTBP49356 437 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG13-222ENST00000534610 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
ATG13-222ENST00000534610 ARFIP1P53367 373 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG13-222ENST00000534610 STXBP1P61764 594 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
ATG13-222ENST00000534610 MS4A2Q01362 244 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG13-222ENST00000534610 LIPEQ05469 1076 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG13-222ENST00000534610 SLC34A1Q06495 639 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG13-222ENST00000534610 MAP7Q14244 749 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG13-222ENST00000534610 UGT8Q16880 541 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG13-222ENST00000534610 SLC5A12Q1EHB4 618 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG13-222ENST00000534610 DUOXA1Q1HG43 343 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG13-222ENST00000534610 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
ATG13-222ENST00000534610 ZNF425Q6IV72 752 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG13-222ENST00000534610 ZFP1Q6P2D0 407 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG13-222ENST00000534610 SPATA24Q86W54 205 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG13-222ENST00000534610 DHFR2Q86XF0 187 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG13-222ENST00000534610 FAM20CQ8IXL6 584 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG13-222ENST00000534610 FAM156AQ8NDB6 213 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG13-222ENST00000534610 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
ATG13-222ENST00000534610 TNIP2Q8NFZ5 429 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG13-222ENST00000534610 OR7A2PQ8NGA2 310 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG13-222ENST00000534610 C1orf216Q8TAB5 229 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG13-222ENST00000534610 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
ATG13-222ENST00000534610 ANKRD27Q96NW4 1050 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG13-222ENST00000534610 OR2A14Q96R47 310 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG13-222ENST00000534610 THUMPD3Q9BV44 507 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
ATG13-222ENST00000534610 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
ATG13-222ENST00000534610 ALG2Q9H553 416 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG13-222ENST00000534610 S100A14Q9HCY8 104 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG13-222ENST00000534610 ATP6V1HQ9UI12 483 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG13-222ENST00000534610 PRSS51A0A1B0GVH4 220 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG13-222ENST00000534610 GABRR3A8MPY1 467 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG13-222ENST00000534610 PLPP1O14494 284 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG13-222ENST00000534610 ACOT8O14734 319 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG13-222ENST00000534610 NVLO15381 856 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
ATG13-222ENST00000534610 YY2O15391 372 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG13-222ENST00000534610 MAP3K7O43318 606 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG13-222ENST00000534610 TNFSF14O43557 240 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG13-222ENST00000534610 MAPK12P53778 367 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG13-222ENST00000534610 TAS2R50P59544 299 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG13-222ENST00000534610 RGS1Q08116 209 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG13-222ENST00000534610 DMWDQ09019 674 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG13-222ENST00000534610 RABL3Q5HYI8 236 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG13-222ENST00000534610 LRIF1Q5T3J3 769 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG13-222ENST00000534610 OR4C11Q6IEV9 310 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG13-222ENST00000534610 CAMKMTQ7Z624 323 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG13-222ENST00000534610 PAQR7Q86WK9 346 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG13-222ENST00000534610 C1orf210Q8IVY1 113 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG13-222ENST00000534610 KIAA2013Q8IYS2 634 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG13-222ENST00000534610 NATD1Q8N6N6 113 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG13-222ENST00000534610 CREB3L4Q8TEY5 395 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG13-222ENST00000534610 COQ8BQ96D53 544 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG13-222ENST00000534610 THAP11Q96EK4 314 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG13-222ENST00000534610 PANX1Q96RD7 426 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG13-222ENST00000534610 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
ATG13-222ENST00000534610 PCDHGB4Q9UN71 923 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG13-222ENST00000534610 R4GN57 208 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG13-222ENST00000534610 DNAH14Q0VDD8 3507 aa14.67□□□□□ -0.06
ATG13-222ENST00000534610 LRIT2A6NDA9 550 aa14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29 ms