RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000285243.6

ANKRD40-201, Transcript of ankyrin repeat domain 40, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ANKRD40, Length 4,184 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40-201ENST00000285243 NUP133Q8WUM0 1156 aa22.76■■□□□ 1.23
ANKRD40-201ENST00000285243 TRIM35Q9UPQ4 493 aa22.76■■□□□ 1.23
ANKRD40-201ENST00000285243 ACSBG1Q96GR2 724 aa22.76■■□□□ 1.23
ANKRD40-201ENST00000285243 PTPRTO14522 1441 aa22.75■■□□□ 1.23
ANKRD40-201ENST00000285243 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
ANKRD40-201ENST00000285243 PTPRCP08575 1304 aa22.75■■□□□ 1.23
ANKRD40-201ENST00000285243 EXOC5O00471 708 aa22.74■■□□□ 1.23
ANKRD40-201ENST00000285243 PDCP20941 246 aa22.74■■□□□ 1.23
ANKRD40-201ENST00000285243 ATP2B2Q01814 1243 aa22.74■■□□□ 1.23
ANKRD40-201ENST00000285243 LRP2BPQ9P2M1 347 aa22.74■■□□□ 1.23
ANKRD40-201ENST00000285243 ARHGEF5Q12774 1597 aa22.74■■□□□ 1.23
ANKRD40-201ENST00000285243 RAB3GAP1Q15042 981 aa22.74■■□□□ 1.23
ANKRD40-201ENST00000285243 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa22.74■■□□□ 1.23
ANKRD40-201ENST00000285243 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP22.74■■□□□ 1.23
ANKRD40-201ENST00000285243 HYPKQ9NX55 129 aa22.74■■□□□ 1.23
ANKRD40-201ENST00000285243 SPC24Q8NBT2 197 aa22.73■■□□□ 1.23
ANKRD40-201ENST00000285243 PLA2R1Q13018 1463 aa22.73■■□□□ 1.23
ANKRD40-201ENST00000285243 RAI14Q9P0K7 980 aa22.73■■□□□ 1.23
ANKRD40-201ENST00000285243 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
ANKRD40-201ENST00000285243 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
ANKRD40-201ENST00000285243 ANKRD44Q8N8A2 993 aa22.73■■□□□ 1.23
ANKRD40-201ENST00000285243 UGGT1Q9NYU2 1555 aa22.72■■□□□ 1.23
ANKRD40-201ENST00000285243 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
ANKRD40-201ENST00000285243 TTC21AQ8NDW8 1320 aa22.72■■□□□ 1.23
ANKRD40-201ENST00000285243 UQCRHLA0A096LP55 91 aa22.72■■□□□ 1.23
ANKRD40-201ENST00000285243 DTNBO60941 627 aa22.72■■□□□ 1.23
ANKRD40-201ENST00000285243 UQCRHP07919 91 aa22.72■■□□□ 1.23
ANKRD40-201ENST00000285243 GUCY1B3Q02153 619 aa22.72■■□□□ 1.23
ANKRD40-201ENST00000285243 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
ANKRD40-201ENST00000285243 TRIM5Q9C035 493 aa22.72■■□□□ 1.23
ANKRD40-201ENST00000285243 LGR6Q9HBX8 967 aa22.72■■□□□ 1.23
ANKRD40-201ENST00000285243 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
ANKRD40-201ENST00000285243 ABCC1P33527 1531 aa22.72■■□□□ 1.23
ANKRD40-201ENST00000285243 RAB11FIP3O75154 756 aa22.71■■□□□ 1.23
ANKRD40-201ENST00000285243 RBM25P49756 843 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
ANKRD40-201ENST00000285243 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
ANKRD40-201ENST00000285243 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa22.71■■□□□ 1.23
ANKRD40-201ENST00000285243 RHPN1Q8TCX5 695 aa22.71■■□□□ 1.23
ANKRD40-201ENST00000285243 HOXC9P31274 260 aa22.71■■□□□ 1.23
ANKRD40-201ENST00000285243 IL13P35225 146 aa22.71■■□□□ 1.23
ANKRD40-201ENST00000285243 TBX22Q9Y458 520 aa22.71■■□□□ 1.23
ANKRD40-201ENST00000285243 GOLIM4O00461 696 aa22.7■■□□□ 1.22
ANKRD40-201ENST00000285243 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
ANKRD40-201ENST00000285243 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
ANKRD40-201ENST00000285243 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
ANKRD40-201ENST00000285243 TDO2P48775 406 aa22.7■■□□□ 1.22
ANKRD40-201ENST00000285243 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP22.69■■□□□ 1.22
ANKRD40-201ENST00000285243 C19orf44Q9H6X5 657 aa22.69■■□□□ 1.22
ANKRD40-201ENST00000285243 FLT4P35916 1363 aa22.69■■□□□ 1.22
ANKRD40-201ENST00000285243 IKQ13123 557 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
ANKRD40-201ENST00000285243 DCTPP1Q9H773 170 aa22.69■■□□□ 1.22
ANKRD40-201ENST00000285243 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
ANKRD40-201ENST00000285243 ME1P48163 572 aa22.69■■□□□ 1.22
ANKRD40-201ENST00000285243 HAND2P61296 217 aa22.69■■□□□ 1.22
ANKRD40-201ENST00000285243 SART3Q15020 963 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
ANKRD40-201ENST00000285243 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa22.69■■□□□ 1.22
ANKRD40-201ENST00000285243 ECHDC1Q9NTX5 307 aa22.69■■□□□ 1.22
ANKRD40-201ENST00000285243 STK38Q15208 465 aa22.68■■□□□ 1.22
ANKRD40-201ENST00000285243 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa22.68■■□□□ 1.22
ANKRD40-201ENST00000285243 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
ANKRD40-201ENST00000285243 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa22.68■■□□□ 1.22
ANKRD40-201ENST00000285243 CCDC192P0DO97 292 aa22.68■■□□□ 1.22
ANKRD40-201ENST00000285243 KRT85P78386 507 aa22.67■■□□□ 1.22
ANKRD40-201ENST00000285243 MINDY4BA8MYZ0 360 aa22.67■■□□□ 1.22
ANKRD40-201ENST00000285243 PDE1AP54750 535 aa22.67■■□□□ 1.22
ANKRD40-201ENST00000285243 KDM5DQ9BY66 1539 aa22.67■■□□□ 1.22
ANKRD40-201ENST00000285243 TMX3Q96JJ7 454 aa22.67■■□□□ 1.22
ANKRD40-201ENST00000285243 LMBR1LQ6UX01 489 aa22.66■■□□□ 1.22
ANKRD40-201ENST00000285243 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
ANKRD40-201ENST00000285243 ERCC6L2Q5T890 1561 aa22.66■■□□□ 1.22
ANKRD40-201ENST00000285243 KINO60870 393 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
ANKRD40-201ENST00000285243 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa22.66■■□□□ 1.22
ANKRD40-201ENST00000285243 TPM3P06753 285 aa22.66■■□□□ 1.22
ANKRD40-201ENST00000285243 PIK3R4Q99570 1358 aa22.65■■□□□ 1.22
ANKRD40-201ENST00000285243 NPHP3Q7Z494 1330 aa22.65■■□□□ 1.22
ANKRD40-201ENST00000285243 LRRC2Q9BYS8 371 aa22.65■■□□□ 1.22
ANKRD40-201ENST00000285243 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
ANKRD40-201ENST00000285243 CCT2P78371 535 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
ANKRD40-201ENST00000285243 AIDAQ96BJ3 306 aa22.65■■□□□ 1.22
ANKRD40-201ENST00000285243 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.22
ANKRD40-201ENST00000285243 KLHDC4Q8TBB5 520 aa22.64■■□□□ 1.21
ANKRD40-201ENST00000285243 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
ANKRD40-201ENST00000285243 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.21
ANKRD40-201ENST00000285243 ABCA8O94911 1581 aa22.64■■□□□ 1.21
ANKRD40-201ENST00000285243 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa22.64■■□□□ 1.21
ANKRD40-201ENST00000285243 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
ANKRD40-201ENST00000285243 ATP10AO60312 1499 aa22.63■■□□□ 1.21
ANKRD40-201ENST00000285243 CAMK4Q16566 473 aa22.63■■□□□ 1.21
ANKRD40-201ENST00000285243 AKAP4Q5JQC9 854 aa22.63■■□□□ 1.21
ANKRD40-201ENST00000285243 CEP85Q6P2H3 762 aa22.63■■□□□ 1.21
ANKRD40-201ENST00000285243 NBPF6Q5VWK0 638 aa22.62■■□□□ 1.21
ANKRD40-201ENST00000285243 NBPF4Q96M43 638 aa22.62■■□□□ 1.21
ANKRD40-201ENST00000285243 TNMDQ9H2S6 317 aa22.62■■□□□ 1.21
ANKRD40-201ENST00000285243 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
ANKRD40-201ENST00000285243 NACAP1Q9BZK3 213 aa22.62■■□□□ 1.21
ANKRD40-201ENST00000285243 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
ANKRD40-201ENST00000285243 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
ANKRD40-201ENST00000285243 USP25Q9UHP3 1055 aa22.61■■□□□ 1.21
ANKRD40-201ENST00000285243 MSH6P52701 1360 aa22.61■■□□□ 1.21
ANKRD40-201ENST00000285243 GRM8O00222 908 aa22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.4 ms