RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566784.5

PKD1-231, Transcript of polycystin 1, transient receptor potential channel interacting, human

TSL 5

Gene PKD1, Length 493 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PKD1-231	ENST00000566784	WDR47	O94967	919 aa		13.09	□□□□□ -0.31
PKD1-231	ENST00000566784	PRR35	P0CG20	571 aa		13.09	□□□□□ -0.31
PKD1-231	ENST00000566784	C8orf89	P0DMQ9	161 aa		13.09	□□□□□ -0.31
PKD1-231	ENST00000566784	ALOX12	P18054	663 aa		13.09	□□□□□ -0.31
PKD1-231	ENST00000566784	GNAZ	P19086	355 aa		13.09	□□□□□ -0.31
PKD1-231	ENST00000566784	GGT5	P36269	586 aa		13.09	□□□□□ -0.31
PKD1-231	ENST00000566784	EFNA3	P52797	238 aa		13.09	□□□□□ -0.31
PKD1-231	ENST00000566784	AP2B1	P63010	937 aa		13.09	□□□□□ -0.31
PKD1-231	ENST00000566784	EEF1A2	Q05639	463 aa	Known RBP	13.09	□□□□□ -0.31
PKD1-231	ENST00000566784	PCOLCE	Q15113	449 aa		13.09	□□□□□ -0.31
PKD1-231	ENST00000566784	INPP5J	Q15735	1006 aa	Predicted RBP	13.09	□□□□□ -0.31
PKD1-231	ENST00000566784	PLEKHN1	Q494U1	663 aa	Predicted RBP	13.09	□□□□□ -0.31
PKD1-231	ENST00000566784	SULT1C3	Q6IMI6	304 aa		13.09	□□□□□ -0.31
PKD1-231	ENST00000566784	RIPOR1	Q6ZS17	1223 aa		13.09	□□□□□ -0.31
PKD1-231	ENST00000566784	CEP128	Q6ZU80	1094 aa		13.09	□□□□□ -0.31
PKD1-231	ENST00000566784	ABHD13	Q7L211	337 aa		13.09	□□□□□ -0.31
PKD1-231	ENST00000566784	GPSM1	Q86YR5	675 aa		13.09	□□□□□ -0.31
PKD1-231	ENST00000566784	KBTBD2	Q8IY47	623 aa		13.09	□□□□□ -0.31
PKD1-231	ENST00000566784	IQCK	Q8N0W5	287 aa		13.09	□□□□□ -0.31
PKD1-231	ENST00000566784	SPATA6L	Q8N4H0	392 aa		13.09	□□□□□ -0.31
PKD1-231	ENST00000566784	ANKRD53	Q8N9V6	530 aa		13.09	□□□□□ -0.31
PKD1-231	ENST00000566784	MNS1	Q8NEH6	495 aa		13.09	□□□□□ -0.31
PKD1-231	ENST00000566784	TRPV3	Q8NET8	790 aa		13.09	□□□□□ -0.31
PKD1-231	ENST00000566784	METTL21A	Q8WXB1	218 aa		13.09	□□□□□ -0.31
PKD1-231	ENST00000566784	KIAA1191	Q96A73	305 aa		13.09	□□□□□ -0.31
PKD1-231	ENST00000566784	MOCOS	Q96EN8	888 aa		13.09	□□□□□ -0.31
PKD1-231	ENST00000566784	OR1F2P	Q96R84	312 aa		13.09	□□□□□ -0.31
PKD1-231	ENST00000566784	WDR77	Q9BQA1	342 aa	Predicted RBP	13.09	□□□□□ -0.31
PKD1-231	ENST00000566784	CAPS2	Q9BXY5	557 aa		13.09	□□□□□ -0.31
PKD1-231	ENST00000566784	UNK	Q9C0B0	810 aa	Known RBP	13.09	□□□□□ -0.31
PKD1-231	ENST00000566784	VN1R1	Q9GZP7	353 aa		13.09	□□□□□ -0.31
PKD1-231	ENST00000566784	ZNF700	Q9H0M5	742 aa		13.09	□□□□□ -0.31
PKD1-231	ENST00000566784	CNOT10	Q9H9A5	744 aa	Known RBP	13.09	□□□□□ -0.31
PKD1-231	ENST00000566784	GPRC5B	Q9NZH0	403 aa		13.09	□□□□□ -0.31
PKD1-231	ENST00000566784	HCN3	Q9P1Z3	774 aa		13.09	□□□□□ -0.31
PKD1-231	ENST00000566784	NAALAD2	Q9Y3Q0	740 aa		13.09	□□□□□ -0.31
PKD1-231	ENST00000566784	HIVEP3	Q5T1R4	2406 aa		13.09	□□□□□ -0.31
PKD1-231	ENST00000566784	HECTD1	Q9ULT8	2610 aa		13.09	□□□□□ -0.31
PKD1-231	ENST00000566784	CLEC18A	A5D8T8	446 aa		13.08	□□□□□ -0.32
PKD1-231	ENST00000566784	URAD	A6NGE7	173 aa		13.08	□□□□□ -0.32
PKD1-231	ENST00000566784	NCF1B	A6NI72	391 aa	Predicted RBP	13.08	□□□□□ -0.32
PKD1-231	ENST00000566784	NCF1C	A8MVU1	366 aa	Predicted RBP	13.08	□□□□□ -0.32
PKD1-231	ENST00000566784	GALR3	O60755	368 aa	Predicted RBP	13.08	□□□□□ -0.32
PKD1-231	ENST00000566784	VPS4B	O75351	444 aa		13.08	□□□□□ -0.32
PKD1-231	ENST00000566784	JRK	O75564	520 aa		13.08	□□□□□ -0.32
PKD1-231	ENST00000566784	SERPINA7	P05543	415 aa		13.08	□□□□□ -0.32
PKD1-231	ENST00000566784	SERPIND1	P05546	499 aa		13.08	□□□□□ -0.32
PKD1-231	ENST00000566784	SLC35E2B	P0CK96	405 aa		13.08	□□□□□ -0.32
PKD1-231	ENST00000566784	ICAM2	P13598	275 aa		13.08	□□□□□ -0.32
PKD1-231	ENST00000566784	NCF1	P14598	390 aa	Predicted RBP	13.08	□□□□□ -0.32
PKD1-231	ENST00000566784	GSTM2	P28161	218 aa		13.08	□□□□□ -0.32
PKD1-231	ENST00000566784	CRABP2	P29373	138 aa		13.08	□□□□□ -0.32
PKD1-231	ENST00000566784	GDF5	P43026	501 aa		13.08	□□□□□ -0.32
PKD1-231	ENST00000566784	CDC16	Q13042	620 aa		13.08	□□□□□ -0.32
PKD1-231	ENST00000566784	OR4D1	Q15615	310 aa		13.08	□□□□□ -0.32
PKD1-231	ENST00000566784	C18orf21	Q32NC0	220 aa	Predicted RBP	13.08	□□□□□ -0.32
PKD1-231	ENST00000566784	CRB2	Q5IJ48	1285 aa		13.08	□□□□□ -0.32
PKD1-231	ENST00000566784	FAAH2	Q6GMR7	532 aa		13.08	□□□□□ -0.32
PKD1-231	ENST00000566784	CLEC18B	Q6UXF7	455 aa		13.08	□□□□□ -0.32
PKD1-231	ENST00000566784	ISLR2	Q6UXK2	745 aa		13.08	□□□□□ -0.32
PKD1-231	ENST00000566784	SLCO4C1	Q6ZQN7	724 aa		13.08	□□□□□ -0.32
PKD1-231	ENST00000566784	CCDC91	Q7Z6B0	441 aa		13.08	□□□□□ -0.32
PKD1-231	ENST00000566784	RELL1	Q8IUW5	271 aa		13.08	□□□□□ -0.32
PKD1-231	ENST00000566784	CLEC18C	Q8NCF0	446 aa		13.08	□□□□□ -0.32
PKD1-231	ENST00000566784	PDPR	Q8NCN5	879 aa		13.08	□□□□□ -0.32
PKD1-231	ENST00000566784	ZNF592	Q92610	1267 aa		13.08	□□□□□ -0.32
PKD1-231	ENST00000566784	SEC16B	Q96JE7	1060 aa		13.08	□□□□□ -0.32
PKD1-231	ENST00000566784	LMF1	Q96S06	567 aa		13.08	□□□□□ -0.32
PKD1-231	ENST00000566784	CYTH2	Q99418	400 aa		13.08	□□□□□ -0.32
PKD1-231	ENST00000566784	TMEM79	Q9BSE2	394 aa		13.08	□□□□□ -0.32
PKD1-231	ENST00000566784	TUBB6	Q9BUF5	446 aa		13.08	□□□□□ -0.32
PKD1-231	ENST00000566784	SLC6A16	Q9GZN6	736 aa		13.08	□□□□□ -0.32
PKD1-231	ENST00000566784	PITHD1	Q9GZP4	211 aa	Predicted RBP	13.08	□□□□□ -0.32
PKD1-231	ENST00000566784	ILKAP	Q9H0C8	392 aa	Predicted RBP	13.08	□□□□□ -0.32
PKD1-231	ENST00000566784	TSPYL1	Q9H0U9	437 aa		13.08	□□□□□ -0.32
PKD1-231	ENST00000566784	EHD1	Q9H4M9	534 aa		13.08	□□□□□ -0.32
PKD1-231	ENST00000566784	EPS8L2	Q9H6S3	715 aa		13.08	□□□□□ -0.32
PKD1-231	ENST00000566784	CLK4	Q9HAZ1	481 aa	Known RBP	13.08	□□□□□ -0.32
PKD1-231	ENST00000566784	WWOX	Q9NZC7	414 aa		13.08	□□□□□ -0.32
PKD1-231	ENST00000566784	LUZP4	Q9P127	313 aa		13.08	□□□□□ -0.32
PKD1-231	ENST00000566784	COPG2	Q9UBF2	871 aa		13.08	□□□□□ -0.32
PKD1-231	ENST00000566784	C19orf25	Q9UFG5	118 aa	Predicted RBP	13.08	□□□□□ -0.32
PKD1-231	ENST00000566784	MTRF1L	Q9UGC7	380 aa	Known RBP	13.08	□□□□□ -0.32
PKD1-231	ENST00000566784	VPS4A	Q9UN37	437 aa		13.08	□□□□□ -0.32
PKD1-231	ENST00000566784	TAPBP	O15533	448 aa		13.07	□□□□□ -0.32
PKD1-231	ENST00000566784	H2AFY	O75367	372 aa	Known RBP	13.07	□□□□□ -0.32
PKD1-231	ENST00000566784	STK16	O75716	305 aa		13.07	□□□□□ -0.32
PKD1-231	ENST00000566784	SERPINA6	P08185	405 aa		13.07	□□□□□ -0.32
PKD1-231	ENST00000566784	C1GALT1C1L	P0DN25	315 aa		13.07	□□□□□ -0.32
PKD1-231	ENST00000566784	PHB	P35232	272 aa		13.07	□□□□□ -0.32
PKD1-231	ENST00000566784	SOX11	P35716	441 aa		13.07	□□□□□ -0.32
PKD1-231	ENST00000566784	AGTR2	P50052	363 aa		13.07	□□□□□ -0.32
PKD1-231	ENST00000566784	HYAL2	Q12891	473 aa		13.07	□□□□□ -0.32
PKD1-231	ENST00000566784	MFAP5	Q13361	173 aa		13.07	□□□□□ -0.32
PKD1-231	ENST00000566784	SLMAP	Q14BN4	828 aa		13.07	□□□□□ -0.32
PKD1-231	ENST00000566784	EFTUD2	Q15029	972 aa	Known RBP eCLIP	13.07	□□□□□ -0.32
PKD1-231	ENST00000566784	RBBP5	Q15291	538 aa	Known RBP	13.07	□□□□□ -0.32
PKD1-231	ENST00000566784	MINDY4	Q4G0A6	757 aa		13.07	□□□□□ -0.32
PKD1-231	ENST00000566784	DEFB134	Q4QY38	66 aa		13.07	□□□□□ -0.32
PKD1-231	ENST00000566784	GLE1	Q53GS7	698 aa	Known RBP	13.07	□□□□□ -0.32

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