RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000582772.1

MSI2-216, Transcript of musashi RNA binding protein 2, human

TSL 3

Gene MSI2, Length 398 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MSI2-216	ENST00000582772	ETF1	P62495	437 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
MSI2-216	ENST00000582772	PLGLB1	Q02325	96 aa		4.49	□□□□□ -1.69
MSI2-216	ENST00000582772	CRYZ	Q08257	329 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
MSI2-216	ENST00000582772	STIM1	Q13586	685 aa		4.49	□□□□□ -1.69
MSI2-216	ENST00000582772	NR1I3	Q14994	352 aa		4.49	□□□□□ -1.69
MSI2-216	ENST00000582772	RAB35	Q15286	201 aa		4.49	□□□□□ -1.69
MSI2-216	ENST00000582772	FAM214A	Q32MH5	1076 aa		4.49	□□□□□ -1.69
MSI2-216	ENST00000582772	TCTE1	Q5JU00	501 aa		4.49	□□□□□ -1.69
MSI2-216	ENST00000582772	RAD9B	Q6WBX8	426 aa		4.49	□□□□□ -1.69
MSI2-216	ENST00000582772	DTHD1	Q6ZMT9	781 aa		4.49	□□□□□ -1.69
MSI2-216	ENST00000582772	CPEB2	Q7Z5Q1	589 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
MSI2-216	ENST00000582772	DAAM2	Q86T65	1068 aa		4.49	□□□□□ -1.69
MSI2-216	ENST00000582772	SRL	Q86TD4	932 aa		4.49	□□□□□ -1.69
MSI2-216	ENST00000582772	TSPAN33	Q86UF1	283 aa		4.49	□□□□□ -1.69
MSI2-216	ENST00000582772	C12orf56	Q8IXR9	622 aa		4.49	□□□□□ -1.69
MSI2-216	ENST00000582772	CYP4Z2P	Q8N1L4	340 aa		4.49	□□□□□ -1.69
MSI2-216	ENST00000582772	KIR3DL3	Q8N743	410 aa		4.49	□□□□□ -1.69
MSI2-216	ENST00000582772	C9orf106	Q8NAJ2	232 aa		4.49	□□□□□ -1.69
MSI2-216	ENST00000582772	OR4F5	Q8NH21	305 aa		4.49	□□□□□ -1.69
MSI2-216	ENST00000582772	KIF18A	Q8NI77	898 aa		4.49	□□□□□ -1.69
MSI2-216	ENST00000582772	NEIL3	Q8TAT5	605 aa		4.49	□□□□□ -1.69
MSI2-216	ENST00000582772	RAB3IL1	Q8TBN0	382 aa		4.49	□□□□□ -1.69
MSI2-216	ENST00000582772	KCTD4	Q8WVF5	259 aa		4.49	□□□□□ -1.69
MSI2-216	ENST00000582772	RAD54L	Q92698	747 aa		4.49	□□□□□ -1.69
MSI2-216	ENST00000582772	TP53INP1	Q96A56	240 aa		4.49	□□□□□ -1.69
MSI2-216	ENST00000582772	ZBTB8A	Q96BR9	441 aa		4.49	□□□□□ -1.69
MSI2-216	ENST00000582772	C3orf49	Q96BT1	292 aa		4.49	□□□□□ -1.69
MSI2-216	ENST00000582772	C10orf90	Q96M02	699 aa		4.49	□□□□□ -1.69
MSI2-216	ENST00000582772	TEKT5	Q96M29	485 aa		4.49	□□□□□ -1.69
MSI2-216	ENST00000582772	WDR24	Q96S15	920 aa		4.49	□□□□□ -1.69
MSI2-216	ENST00000582772	FGFBP2	Q9BYJ0	223 aa		4.49	□□□□□ -1.69
MSI2-216	ENST00000582772	TRIM2	Q9C040	744 aa		4.49	□□□□□ -1.69
MSI2-216	ENST00000582772	MIS12	Q9H081	205 aa		4.49	□□□□□ -1.69
MSI2-216	ENST00000582772	OR2AG1	Q9H205	316 aa		4.49	□□□□□ -1.69
MSI2-216	ENST00000582772	THAP9	Q9H5L6	903 aa		4.49	□□□□□ -1.69
MSI2-216	ENST00000582772	LDAH	Q9H6V9	325 aa		4.49	□□□□□ -1.69
MSI2-216	ENST00000582772	PDF	Q9HBH1	243 aa		4.49	□□□□□ -1.69
MSI2-216	ENST00000582772	ARNT2	Q9HBZ2	717 aa		4.49	□□□□□ -1.69
MSI2-216	ENST00000582772	MYOZ1	Q9NP98	299 aa	Predicted RBP	4.49	□□□□□ -1.69
MSI2-216	ENST00000582772	ACKR4	Q9NPB9	350 aa		4.49	□□□□□ -1.69
MSI2-216	ENST00000582772	TIMMDC1	Q9NPL8	285 aa		4.49	□□□□□ -1.69
MSI2-216	ENST00000582772	AGPAT3	Q9NRZ7	376 aa		4.49	□□□□□ -1.69
MSI2-216	ENST00000582772	TMEM248	Q9NWD8	314 aa		4.49	□□□□□ -1.69
MSI2-216	ENST00000582772	ZNF446	Q9NWS9	450 aa		4.49	□□□□□ -1.69
MSI2-216	ENST00000582772	FAM53C	Q9NYF3	392 aa		4.49	□□□□□ -1.69
MSI2-216	ENST00000582772	C19orf25	Q9UFG5	118 aa	Predicted RBP	4.49	□□□□□ -1.69
MSI2-216	ENST00000582772	KIAA1257	Q9ULG3	409 aa		4.49	□□□□□ -1.69
MSI2-216	ENST00000582772	MOK	Q9UQ07	419 aa		4.49	□□□□□ -1.69
MSI2-216	ENST00000582772	PPP2R2C	Q9Y2T4	447 aa		4.49	□□□□□ -1.69
MSI2-216	ENST00000582772	UCHL5	Q9Y5K5	329 aa	Known RBP eCLIP	4.49	□□□□□ -1.69
MSI2-216	ENST00000582772	SCIN	Q9Y6U3	715 aa		4.49	□□□□□ -1.69
MSI2-216	ENST00000582772	MAU2	Q9Y6X3	613 aa		4.49	□□□□□ -1.69
MSI2-216	ENST00000582772	LOC390937	A0A1W2PQ73	354 aa		4.48	□□□□□ -1.69
MSI2-216	ENST00000582772	FEZF1	A0PJY2	475 aa		4.48	□□□□□ -1.69
MSI2-216	ENST00000582772	CLPSL1	A2RUU4	121 aa		4.48	□□□□□ -1.69
MSI2-216	ENST00000582772		B4DSR2	109 aa		4.48	□□□□□ -1.69
MSI2-216	ENST00000582772	KIF2A	O00139	706 aa	Predicted RBP	4.48	□□□□□ -1.69
MSI2-216	ENST00000582772	FCHO1	O14526	889 aa		4.48	□□□□□ -1.69
MSI2-216	ENST00000582772	SLC16A5	O15375	505 aa		4.48	□□□□□ -1.69
MSI2-216	ENST00000582772	NDUFA7	O95182	113 aa		4.48	□□□□□ -1.69
MSI2-216	ENST00000582772	FSHB	P01225	129 aa		4.48	□□□□□ -1.69
MSI2-216	ENST00000582772	VDR	P11473	427 aa		4.48	□□□□□ -1.69
MSI2-216	ENST00000582772	H2AFX	P16104	143 aa	Predicted RBP	4.48	□□□□□ -1.69
MSI2-216	ENST00000582772	FBL	P22087	321 aa	Known RBP	4.48	□□□□□ -1.69
MSI2-216	ENST00000582772	IL2RG	P31785	369 aa		4.48	□□□□□ -1.69
MSI2-216	ENST00000582772	HOXD13	P35453	343 aa		4.48	□□□□□ -1.69
MSI2-216	ENST00000582772	CHN2	P52757	468 aa		4.48	□□□□□ -1.69
MSI2-216	ENST00000582772	STC1	P52823	247 aa		4.48	□□□□□ -1.69
MSI2-216	ENST00000582772	AP1S1	P61966	158 aa		4.48	□□□□□ -1.69
MSI2-216	ENST00000582772	NSUN2	Q08J23	767 aa	Known RBP eCLIP	4.48	□□□□□ -1.69
MSI2-216	ENST00000582772	GAB1	Q13480	694 aa		4.48	□□□□□ -1.69
MSI2-216	ENST00000582772	CPEB4	Q17RY0	729 aa	Known RBP eCLIP	4.48	□□□□□ -1.69
MSI2-216	ENST00000582772	DEFB121	Q5J5C9	76 aa		4.48	□□□□□ -1.69
MSI2-216	ENST00000582772	FNBP1L	Q5T0N5	605 aa		4.48	□□□□□ -1.69
MSI2-216	ENST00000582772	AGAP6	Q5VW22	663 aa		4.48	□□□□□ -1.69
MSI2-216	ENST00000582772	LRRC66	Q68CR7	880 aa		4.48	□□□□□ -1.69
MSI2-216	ENST00000582772	KCTD11	Q693B1	232 aa		4.48	□□□□□ -1.69
MSI2-216	ENST00000582772	DENND5A	Q6IQ26	1287 aa		4.48	□□□□□ -1.69
MSI2-216	ENST00000582772	KLHL10	Q6JEL2	608 aa		4.48	□□□□□ -1.69
MSI2-216	ENST00000582772	ZNF474	Q6S9Z5	364 aa	Predicted RBP	4.48	□□□□□ -1.69
MSI2-216	ENST00000582772	ARHGEF18	Q6ZSZ5	1173 aa		4.48	□□□□□ -1.69
MSI2-216	ENST00000582772	ADGRF3	Q8IZF5	1079 aa		4.48	□□□□□ -1.69
MSI2-216	ENST00000582772	BEND7	Q8N7W2	519 aa	Predicted RBP	4.48	□□□□□ -1.69
MSI2-216	ENST00000582772	NETO2	Q8NC67	525 aa		4.48	□□□□□ -1.69
MSI2-216	ENST00000582772	ACVR1C	Q8NER5	493 aa		4.48	□□□□□ -1.69
MSI2-216	ENST00000582772	ZNF397	Q8NF99	534 aa	Predicted RBP	4.48	□□□□□ -1.69
MSI2-216	ENST00000582772	OR4E2	Q8NGC2	313 aa		4.48	□□□□□ -1.69
MSI2-216	ENST00000582772	FLVCR1-AS1	Q8TAF5	88 aa		4.48	□□□□□ -1.69
MSI2-216	ENST00000582772	ADAMTS15	Q8TE58	950 aa		4.48	□□□□□ -1.69
MSI2-216	ENST00000582772	TMEM186	Q96B77	213 aa		4.48	□□□□□ -1.69
MSI2-216	ENST00000582772	DNAJC19	Q96DA6	116 aa		4.48	□□□□□ -1.69
MSI2-216	ENST00000582772	EEF2KMT	Q96G04	330 aa		4.48	□□□□□ -1.69
MSI2-216	ENST00000582772	MAP6	Q96JE9	813 aa		4.48	□□□□□ -1.69
MSI2-216	ENST00000582772	UCN2	Q96RP3	112 aa		4.48	□□□□□ -1.69
MSI2-216	ENST00000582772	INSM2	Q96T92	566 aa	Predicted RBP	4.48	□□□□□ -1.69
MSI2-216	ENST00000582772	PLIN2	Q99541	437 aa		4.48	□□□□□ -1.69
MSI2-216	ENST00000582772	DESI2	Q9BSY9	194 aa		4.48	□□□□□ -1.69
MSI2-216	ENST00000582772	SRMS	Q9H3Y6	488 aa		4.48	□□□□□ -1.69
MSI2-216	ENST00000582772	UGT1A8	Q9HAW9	530 aa		4.48	□□□□□ -1.69
MSI2-216	ENST00000582772	MKKS	Q9NPJ1	570 aa	Predicted RBP	4.48	□□□□□ -1.69

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