RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429595.1

PTPRK-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRK, Length 558 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-211ENST00000429595 SERPINB11Q96P15 392 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRK-211ENST00000429595 AGAP3Q96P47 875 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRK-211ENST00000429595 OR6C1Q96RD1 312 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRK-211ENST00000429595 TMEM109Q9BVC6 243 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRK-211ENST00000429595 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
PTPRK-211ENST00000429595 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRK-211ENST00000429595 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP6.02□□□□□ -1.45
PTPRK-211ENST00000429595 FAM204AQ9H8W3 233 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRK-211ENST00000429595 NLRC4Q9NPP4 1024 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRK-211ENST00000429595 OLAHQ9NV23 265 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRK-211ENST00000429595 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa6.02□□□□□ -1.45
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PTPRK-211ENST00000429595 HESX1Q9UBX0 185 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRK-211ENST00000429595 SH3BGRL2Q9UJC5 107 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRK-211ENST00000429595 AMFRQ9UKV5 643 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRK-211ENST00000429595 HS3ST2Q9Y278 367 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRK-211ENST00000429595 ITM2BQ9Y287 266 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRK-211ENST00000429595 PKDREJQ9NTG1 2253 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRK-211ENST00000429595 FOXO6A8MYZ6 492 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRK-211ENST00000429595 F8VZ95 297 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRK-211ENST00000429595 C19orf84I3L1E1 186 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRK-211ENST00000429595 K7ERQ8 282 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRK-211ENST00000429595 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP6.01□□□□□ -1.45
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PTPRK-211ENST00000429595 MYBL2P10244 700 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRK-211ENST00000429595 KRT13P13646 458 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRK-211ENST00000429595 CCNB1P14635 433 aa6.01□□□□□ -1.45
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PTPRK-211ENST00000429595 PIK3CGP48736 1102 aa6.01□□□□□ -1.45
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PTPRK-211ENST00000429595 CYP2J2P51589 502 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRK-211ENST00000429595 CLCN2P51788 898 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRK-211ENST00000429595 CASP5P51878 434 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRK-211ENST00000429595 NDST2P52849 883 aa6.01□□□□□ -1.45
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PTPRK-211ENST00000429595 C2orf54Q08AI8 447 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRK-211ENST00000429595 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP6.01□□□□□ -1.45
PTPRK-211ENST00000429595 ZNF805Q5CZA5 627 aa6.01□□□□□ -1.45
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PTPRK-211ENST00000429595 CES4AQ5XG92 561 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRK-211ENST00000429595 MSANTD2Q6P1R3 559 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRK-211ENST00000429595 C22orf39Q6P5X5 142 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRK-211ENST00000429595 IGFL3Q6UXB1 125 aa6.01□□□□□ -1.45
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PTPRK-211ENST00000429595 Q6ZS92 163 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRK-211ENST00000429595 SRLQ86TD4 932 aa6.01□□□□□ -1.45
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PTPRK-211ENST00000429595 PPP1R3BQ86XI6 285 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRK-211ENST00000429595 NELFCDQ8IXH7 590 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRK-211ENST00000429595 BCORP1Q8N888 145 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRK-211ENST00000429595 ANKRD52Q8NB46 1076 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRK-211ENST00000429595 XXYLT1Q8NBI6 393 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRK-211ENST00000429595 CCL4L1Q8NHW4 92 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRK-211ENST00000429595 DNAJB14Q8TBM8 379 aa6.01□□□□□ -1.45
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PTPRK-211ENST00000429595 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP6.01□□□□□ -1.45
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PTPRK-211ENST00000429595 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRK-211ENST00000429595 TXLNGYQ9BZA5 131 aa6.01□□□□□ -1.45
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PTPRK-211ENST00000429595 CYP3A43Q9HB55 503 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRK-211ENST00000429595 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRK-211ENST00000429595 ELOVL5Q9NYP7 299 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRK-211ENST00000429595 TAAR2Q9P1P5 351 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRK-211ENST00000429595 LCMT1Q9UIC8 334 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRK-211ENST00000429595 SNX7Q9UNH6 387 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRK-211ENST00000429595 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
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PTPRK-211ENST00000429595 E2F3O00716 465 aa6□□□□□ -1.45
PTPRK-211ENST00000429595 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
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PTPRK-211ENST00000429595 NUDT17P0C025 328 aa6□□□□□ -1.45
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PTPRK-211ENST00000429595 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
PTPRK-211ENST00000429595 ZNF134P52741 427 aa6□□□□□ -1.45
PTPRK-211ENST00000429595 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
PTPRK-211ENST00000429595 KCNK10P57789 538 aa6□□□□□ -1.45
PTPRK-211ENST00000429595 PTP4A2Q12974 167 aa6□□□□□ -1.45
PTPRK-211ENST00000429595 FHL1Q13642 323 aa6□□□□□ -1.45
PTPRK-211ENST00000429595 CYP1B1Q16678 543 aa6□□□□□ -1.45
PTPRK-211ENST00000429595 AWAT2Q6E213 333 aa6□□□□□ -1.45
PTPRK-211ENST00000429595 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
PTPRK-211ENST00000429595 RETSATQ6NUM9 610 aa6□□□□□ -1.45
PTPRK-211ENST00000429595 FAM199XQ6PEV8 388 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
PTPRK-211ENST00000429595 SLC30A9Q6PML9 568 aa6□□□□□ -1.45
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