RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368671.3

CLRN3-201, Transcript of clarin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLRN3, Length 1,152 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLRN3-201ENST00000368671 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP9.79□□□□□ -0.84
CLRN3-201ENST00000368671 CRYABP02511 175 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
CLRN3-201ENST00000368671 MPC1LP0DKB6 136 aa9.79□□□□□ -0.84
CLRN3-201ENST00000368671 ICAM2P13598 275 aa9.79□□□□□ -0.84
CLRN3-201ENST00000368671 MST1P26927 711 aa9.79□□□□□ -0.84
CLRN3-201ENST00000368671 GRNP28799 593 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
CLRN3-201ENST00000368671 CLCN7P51798 805 aa9.79□□□□□ -0.84
CLRN3-201ENST00000368671 AP2B1P63010 937 aa9.79□□□□□ -0.84
CLRN3-201ENST00000368671 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
CLRN3-201ENST00000368671 ABATP80404 500 aa9.79□□□□□ -0.84
CLRN3-201ENST00000368671 SARNPP82979 210 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
CLRN3-201ENST00000368671 CDK16Q00536 496 aa9.79□□□□□ -0.84
CLRN3-201ENST00000368671 PMP22Q01453 160 aa9.79□□□□□ -0.84
CLRN3-201ENST00000368671 TAP2Q03519 686 aa9.79□□□□□ -0.84
CLRN3-201ENST00000368671 CTBP1Q13363 440 aa9.79□□□□□ -0.84
CLRN3-201ENST00000368671 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
CLRN3-201ENST00000368671 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
CLRN3-201ENST00000368671 BTBD16Q32M84 506 aa9.79□□□□□ -0.84
CLRN3-201ENST00000368671 MINDY4Q4G0A6 757 aa9.79□□□□□ -0.84
CLRN3-201ENST00000368671 FCRLBQ6BAA4 426 aa9.79□□□□□ -0.84
CLRN3-201ENST00000368671 ZNF470Q6ECI4 717 aa9.79□□□□□ -0.84
CLRN3-201ENST00000368671 NEPROQ6NW34 567 aa9.79□□□□□ -0.84
CLRN3-201ENST00000368671 TMEM205Q6UW68 189 aa9.79□□□□□ -0.84
CLRN3-201ENST00000368671 TMEM207Q6UWW9 146 aa9.79□□□□□ -0.84
CLRN3-201ENST00000368671 LANCL3Q6ZV70 420 aa9.79□□□□□ -0.84
CLRN3-201ENST00000368671 PRSS41Q7RTY9 318 aa9.79□□□□□ -0.84
CLRN3-201ENST00000368671 GAS2L3Q86XJ1 694 aa9.79□□□□□ -0.84
CLRN3-201ENST00000368671 CILP2Q8IUL8 1156 aa9.79□□□□□ -0.84
CLRN3-201ENST00000368671 DENND6AQ8IWF6 608 aa9.79□□□□□ -0.84
CLRN3-201ENST00000368671 MCEMP1Q8IX19 187 aa9.79□□□□□ -0.84
CLRN3-201ENST00000368671 SHISA5Q8N114 240 aa9.79□□□□□ -0.84
CLRN3-201ENST00000368671 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa9.79□□□□□ -0.84
CLRN3-201ENST00000368671 PRELID2Q8N945 189 aa9.79□□□□□ -0.84
CLRN3-201ENST00000368671 GIMAP7Q8NHV1 300 aa9.79□□□□□ -0.84
CLRN3-201ENST00000368671 MOCOSQ96EN8 888 aa9.79□□□□□ -0.84
CLRN3-201ENST00000368671 PRAP1Q96NZ9 151 aa9.79□□□□□ -0.84
CLRN3-201ENST00000368671 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
CLRN3-201ENST00000368671 MACROD1Q9BQ69 325 aa9.79□□□□□ -0.84
CLRN3-201ENST00000368671 TUBB6Q9BUF5 446 aa9.79□□□□□ -0.84
CLRN3-201ENST00000368671 CCDC68Q9H2F9 335 aa9.79□□□□□ -0.84
CLRN3-201ENST00000368671 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
CLRN3-201ENST00000368671 STMN3Q9NZ72 180 aa9.79□□□□□ -0.84
CLRN3-201ENST00000368671 HCN3Q9P1Z3 774 aa9.79□□□□□ -0.84
CLRN3-201ENST00000368671 ABI3Q9P2A4 366 aa9.79□□□□□ -0.84
CLRN3-201ENST00000368671 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa9.79□□□□□ -0.84
CLRN3-201ENST00000368671 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa9.79□□□□□ -0.84
CLRN3-201ENST00000368671 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa9.78□□□□□ -0.84
CLRN3-201ENST00000368671 H0YIG0 161 aa9.78□□□□□ -0.84
CLRN3-201ENST00000368671 ZBTB14O43829 449 aa9.78□□□□□ -0.84
CLRN3-201ENST00000368671 CEP104O60308 925 aa9.78□□□□□ -0.84
CLRN3-201ENST00000368671 BMP2P12643 396 aa9.78□□□□□ -0.84
CLRN3-201ENST00000368671 IL1RNP18510 177 aa9.78□□□□□ -0.84
CLRN3-201ENST00000368671 IMPA1P29218 277 aa9.78□□□□□ -0.84
CLRN3-201ENST00000368671 CDC25BP30305 580 aa9.78□□□□□ -0.84
CLRN3-201ENST00000368671 CXCR5P32302 372 aa9.78□□□□□ -0.84
CLRN3-201ENST00000368671 ST13P50502 369 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
CLRN3-201ENST00000368671 RBPJQ06330 500 aa9.78□□□□□ -0.84
CLRN3-201ENST00000368671 GPS1Q13098 491 aa9.78□□□□□ -0.84
CLRN3-201ENST00000368671 FAM53BQ14153 422 aa9.78□□□□□ -0.84
CLRN3-201ENST00000368671 LONRF1Q17RB8 773 aa9.78□□□□□ -0.84
CLRN3-201ENST00000368671 ANKRD22Q5VYY1 191 aa9.78□□□□□ -0.84
CLRN3-201ENST00000368671 ZNF549Q6P9A3 640 aa9.78□□□□□ -0.84
CLRN3-201ENST00000368671 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP9.78□□□□□ -0.84
CLRN3-201ENST00000368671 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
CLRN3-201ENST00000368671 CPEB2Q7Z5Q1 589 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
CLRN3-201ENST00000368671 MRGPRGQ86SM5 289 aa9.78□□□□□ -0.84
CLRN3-201ENST00000368671 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP9.78□□□□□ -0.84
CLRN3-201ENST00000368671 CPNE9Q8IYJ1 553 aa9.78□□□□□ -0.84
CLRN3-201ENST00000368671 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP9.78□□□□□ -0.84
CLRN3-201ENST00000368671 ZCCHC10Q8TBK6 192 aa9.78□□□□□ -0.84
CLRN3-201ENST00000368671 MCOLN3Q8TDD5 553 aa9.78□□□□□ -0.84
CLRN3-201ENST00000368671 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP9.78□□□□□ -0.84
CLRN3-201ENST00000368671 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
CLRN3-201ENST00000368671 CCDC120Q96HB5 630 aa9.78□□□□□ -0.84
CLRN3-201ENST00000368671 IMMP1LQ96LU5 166 aa9.78□□□□□ -0.84
CLRN3-201ENST00000368671 GPR21Q99679 349 aa9.78□□□□□ -0.84
CLRN3-201ENST00000368671 VN1R1Q9GZP7 353 aa9.78□□□□□ -0.84
CLRN3-201ENST00000368671 RNF32Q9H0A6 362 aa9.78□□□□□ -0.84
CLRN3-201ENST00000368671 RUBCNLQ9H714 662 aa9.78□□□□□ -0.84
CLRN3-201ENST00000368671 LZTFL1Q9NQ48 299 aa9.78□□□□□ -0.84
CLRN3-201ENST00000368671 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP9.78□□□□□ -0.84
CLRN3-201ENST00000368671 TEKT2Q9UIF3 430 aa9.78□□□□□ -0.84
CLRN3-201ENST00000368671 OR2W5A6NFC9 320 aa9.77□□□□□ -0.85
CLRN3-201ENST00000368671 GOLGA8MH3BSY2 632 aa9.77□□□□□ -0.85
CLRN3-201ENST00000368671 SGK494L7N484 410 aa9.77□□□□□ -0.85
CLRN3-201ENST00000368671 KIF5CO60282 957 aa9.77□□□□□ -0.85
CLRN3-201ENST00000368671 NSA2O95478 260 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
CLRN3-201ENST00000368671 KRT14P02533 472 aa9.77□□□□□ -0.85
CLRN3-201ENST00000368671 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
CLRN3-201ENST00000368671 MYBL2P10244 700 aa9.77□□□□□ -0.85
CLRN3-201ENST00000368671 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
CLRN3-201ENST00000368671 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
CLRN3-201ENST00000368671 SLC1A2P43004 574 aa9.77□□□□□ -0.85
CLRN3-201ENST00000368671 CA7P43166 264 aa9.77□□□□□ -0.85
CLRN3-201ENST00000368671 TBPL1P62380 186 aa9.77□□□□□ -0.85
CLRN3-201ENST00000368671 MPP1Q00013 466 aa9.77□□□□□ -0.85
CLRN3-201ENST00000368671 RELAQ04206 551 aa9.77□□□□□ -0.85
CLRN3-201ENST00000368671 ART3Q13508 389 aa9.77□□□□□ -0.85
CLRN3-201ENST00000368671 ZNF766Q5HY98 468 aa9.77□□□□□ -0.85
CLRN3-201ENST00000368671 CYHR1Q6ZMK1 362 aa9.77□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 64.8 ms