RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453030.5

GARNL3-210, Transcript of GTPase activating Rap/RanGAP domain like 3, humanhuman

TSL 4

Gene GARNL3, Length 536 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3-210ENST00000453030 CCNG2Q16589 344 aa11.07□□□□□ -0.64
GARNL3-210ENST00000453030 MINDY4Q4G0A6 757 aa11.07□□□□□ -0.64
GARNL3-210ENST00000453030 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa11.07□□□□□ -0.64
GARNL3-210ENST00000453030 ABHD17BQ5VST6 288 aa11.07□□□□□ -0.64
GARNL3-210ENST00000453030 GARNL3Q5VVW2 1013 aa11.07□□□□□ -0.64
GARNL3-210ENST00000453030 ZNF470Q6ECI4 717 aa11.07□□□□□ -0.64
GARNL3-210ENST00000453030 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP11.07□□□□□ -0.64
GARNL3-210ENST00000453030 CASC4Q6P4E1 433 aa11.07□□□□□ -0.64
GARNL3-210ENST00000453030 LANCL3Q6ZV70 420 aa11.07□□□□□ -0.64
GARNL3-210ENST00000453030 REXO1L1PQ8IX06 675 aa11.07□□□□□ -0.64
GARNL3-210ENST00000453030 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa11.07□□□□□ -0.64
GARNL3-210ENST00000453030 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP11.07□□□□□ -0.64
GARNL3-210ENST00000453030 GIMAP7Q8NHV1 300 aa11.07□□□□□ -0.64
GARNL3-210ENST00000453030 SUN3Q8TAQ9 357 aa11.07□□□□□ -0.64
GARNL3-210ENST00000453030 ZNF480Q8WV37 535 aa11.07□□□□□ -0.64
GARNL3-210ENST00000453030 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP11.07□□□□□ -0.64
GARNL3-210ENST00000453030 HAS2Q92819 552 aa11.07□□□□□ -0.64
GARNL3-210ENST00000453030 MOCOSQ96EN8 888 aa11.07□□□□□ -0.64
GARNL3-210ENST00000453030 CCDC120Q96HB5 630 aa11.07□□□□□ -0.64
GARNL3-210ENST00000453030 OR2A5Q96R48 311 aa11.07□□□□□ -0.64
GARNL3-210ENST00000453030 SLC30A3Q99726 388 aa11.07□□□□□ -0.64
GARNL3-210ENST00000453030 TGIF2Q9GZN2 237 aa11.07□□□□□ -0.64
GARNL3-210ENST00000453030 ZNF700Q9H0M5 742 aa11.07□□□□□ -0.64
GARNL3-210ENST00000453030 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP11.07□□□□□ -0.64
GARNL3-210ENST00000453030 SEC14L3Q9UDX4 400 aa11.07□□□□□ -0.64
GARNL3-210ENST00000453030 LOC102723996A0A087X1L8 192 aa11.06□□□□□ -0.64
GARNL3-210ENST00000453030 OR5H15A6NDH6 313 aa11.06□□□□□ -0.64
GARNL3-210ENST00000453030 ZNF839A8K0R7 811 aa11.06□□□□□ -0.64
GARNL3-210ENST00000453030 AP3B1O00203 1094 aa11.06□□□□□ -0.64
GARNL3-210ENST00000453030 CCL21O00585 134 aa11.06□□□□□ -0.64
GARNL3-210ENST00000453030 PRAMEF2O60811 474 aa11.06□□□□□ -0.64
GARNL3-210ENST00000453030 AVILO75366 819 aa11.06□□□□□ -0.64
GARNL3-210ENST00000453030 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
GARNL3-210ENST00000453030 PKMP14618 531 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
GARNL3-210ENST00000453030 OGNP20774 298 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
GARNL3-210ENST00000453030 ELAVL4P26378 380 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
GARNL3-210ENST00000453030 ST13P50502 369 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
GARNL3-210ENST00000453030 ADARP55265 1226 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
GARNL3-210ENST00000453030 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP11.06□□□□□ -0.64
GARNL3-210ENST00000453030 TTLL9Q3SXZ7 439 aa11.06□□□□□ -0.64
GARNL3-210ENST00000453030 FCRLBQ6BAA4 426 aa11.06□□□□□ -0.64
GARNL3-210ENST00000453030 TMEM205Q6UW68 189 aa11.06□□□□□ -0.64
GARNL3-210ENST00000453030 TMEM207Q6UWW9 146 aa11.06□□□□□ -0.64
GARNL3-210ENST00000453030 CENPUQ71F23 418 aa11.06□□□□□ -0.64
GARNL3-210ENST00000453030 PRSS41Q7RTY9 318 aa11.06□□□□□ -0.64
GARNL3-210ENST00000453030 CILP2Q8IUL8 1156 aa11.06□□□□□ -0.64
GARNL3-210ENST00000453030 SHISA5Q8N114 240 aa11.06□□□□□ -0.64
GARNL3-210ENST00000453030 OR9A4Q8NGU2 314 aa11.06□□□□□ -0.64
GARNL3-210ENST00000453030 RELTQ969Z4 430 aa11.06□□□□□ -0.64
GARNL3-210ENST00000453030 PHF12Q96QT6 1004 aa11.06□□□□□ -0.64
GARNL3-210ENST00000453030 TCF12Q99081 682 aa11.06□□□□□ -0.64
GARNL3-210ENST00000453030 TUBB6Q9BUF5 446 aa11.06□□□□□ -0.64
GARNL3-210ENST00000453030 TSGA10Q9BZW7 698 aa11.06□□□□□ -0.64
GARNL3-210ENST00000453030 VN1R1Q9GZP7 353 aa11.06□□□□□ -0.64
GARNL3-210ENST00000453030 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP11.06□□□□□ -0.64
GARNL3-210ENST00000453030 HCN3Q9P1Z3 774 aa11.06□□□□□ -0.64
GARNL3-210ENST00000453030 ABI3Q9P2A4 366 aa11.06□□□□□ -0.64
GARNL3-210ENST00000453030 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
GARNL3-210ENST00000453030 CTAGE9A4FU28 777 aa11.05□□□□□ -0.64
GARNL3-210ENST00000453030 A8MUI8 341 aa11.05□□□□□ -0.64
GARNL3-210ENST00000453030 E7ENX8 843 aa11.05□□□□□ -0.64
GARNL3-210ENST00000453030 CRYABP02511 175 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
GARNL3-210ENST00000453030 FGGP02679 453 aa11.05□□□□□ -0.64
GARNL3-210ENST00000453030 IL1RNP18510 177 aa11.05□□□□□ -0.64
GARNL3-210ENST00000453030 PAMP19021 973 aa11.05□□□□□ -0.64
GARNL3-210ENST00000453030 TPSB2P20231 275 aa11.05□□□□□ -0.64
GARNL3-210ENST00000453030 HSD17B2P37059 387 aa11.05□□□□□ -0.64
GARNL3-210ENST00000453030 AVPR1BP47901 424 aa11.05□□□□□ -0.64
GARNL3-210ENST00000453030 CLCN7P51798 805 aa11.05□□□□□ -0.64
GARNL3-210ENST00000453030 AP2B1P63010 937 aa11.05□□□□□ -0.64
GARNL3-210ENST00000453030 TAP2Q03519 686 aa11.05□□□□□ -0.64
GARNL3-210ENST00000453030 ART3Q13508 389 aa11.05□□□□□ -0.64
GARNL3-210ENST00000453030 TPSAB1Q15661 275 aa11.05□□□□□ -0.64
GARNL3-210ENST00000453030 NDUFA9Q16795 377 aa11.05□□□□□ -0.64
GARNL3-210ENST00000453030 BTBD16Q32M84 506 aa11.05□□□□□ -0.64
GARNL3-210ENST00000453030 MEI1Q5TIA1 1274 aa11.05□□□□□ -0.64
GARNL3-210ENST00000453030 NEPROQ6NW34 567 aa11.05□□□□□ -0.64
GARNL3-210ENST00000453030 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP11.05□□□□□ -0.64
GARNL3-210ENST00000453030 C4orf22Q6V702 233 aa11.05□□□□□ -0.64
GARNL3-210ENST00000453030 MRGPRGQ86SM5 289 aa11.05□□□□□ -0.64
GARNL3-210ENST00000453030 ZCCHC10Q8TBK6 192 aa11.05□□□□□ -0.64
GARNL3-210ENST00000453030 METTL21AQ8WXB1 218 aa11.05□□□□□ -0.64
GARNL3-210ENST00000453030 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP11.05□□□□□ -0.64
GARNL3-210ENST00000453030 MACROD1Q9BQ69 325 aa11.05□□□□□ -0.64
GARNL3-210ENST00000453030 RBCK1Q9BYM8 510 aa11.05□□□□□ -0.64
GARNL3-210ENST00000453030 RNF32Q9H0A6 362 aa11.05□□□□□ -0.64
GARNL3-210ENST00000453030 SAMD15Q9P1V8 674 aa11.05□□□□□ -0.64
GARNL3-210ENST00000453030 TEKT2Q9UIF3 430 aa11.05□□□□□ -0.64
GARNL3-210ENST00000453030 OR2W5A6NFC9 320 aa11.04□□□□□ -0.64
GARNL3-210ENST00000453030 FAM227AF5H4B4 570 aa11.04□□□□□ -0.64
GARNL3-210ENST00000453030 H7BY64 318 aa11.04□□□□□ -0.64
GARNL3-210ENST00000453030 TXNDC9O14530 226 aa11.04□□□□□ -0.64
GARNL3-210ENST00000453030 ICAM2P13598 275 aa11.04□□□□□ -0.64
GARNL3-210ENST00000453030 HTR1EP28566 365 aa11.04□□□□□ -0.64
GARNL3-210ENST00000453030 IMPA1P29218 277 aa11.04□□□□□ -0.64
GARNL3-210ENST00000453030 CA7P43166 264 aa11.04□□□□□ -0.64
GARNL3-210ENST00000453030 XCR1P46094 333 aa11.04□□□□□ -0.64
GARNL3-210ENST00000453030 TBPL1P62380 186 aa11.04□□□□□ -0.64
GARNL3-210ENST00000453030 ABATP80404 500 aa11.04□□□□□ -0.64
GARNL3-210ENST00000453030 RBPJQ06330 500 aa11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 79.3 ms