RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442510.6

PTPRC-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 5,164 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-209ENST00000442510 PHKG2P15735 406 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 MYF6P23409 242 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 RARRES1P49788 294 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 LUMP51884 338 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 CD81P60033 236 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 OPCMLQ14982 345 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 OR8G1Q15617 311 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 FAM199XQ6PEV8 388 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 LIPIQ6XZB0 460 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 NUP54Q7Z3B4 507 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 PPP1R3BQ86XI6 285 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 TUSC5Q8IXB3 177 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 CMIPQ8IY22 773 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 MINDY1Q8N5J2 469 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 HTR3CQ8WXA8 447 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 OR8D1Q8WZ84 308 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 SLC38A3Q99624 504 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 ASPNQ9BXN1 380 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 SIK2Q9H0K1 926 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 MKNK2Q9HBH9 465 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 BABAM2Q9NXR7 383 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 GHRLQ9UBU3 117 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 ACSL6Q9UKU0 697 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 PLB1Q6P1J6 1458 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 TEX14Q8IWB6 1497 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 OR6C75A6NL08 312 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 ENSAO43768 121 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 POLBP06746 335 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 DCNP07585 359 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 C7P10643 843 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 ITGA6P23229 1130 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 IRS1P35568 1242 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 CRKLP46109 303 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 BIDP55957 195 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 DMRTA1Q5VZB9 504 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 SLC25A24Q6NUK1 477 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 H3F3CQ6NXT2 135 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 SCIMPQ6UWF3 145 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 GCNT7Q6ZNI0 430 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 GK5Q6ZS86 529 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 SLC29A4Q7RTT9 530 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 NLRX1Q86UT6 975 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 OR5L2Q8NGL0 311 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 BTN2A2Q8WVV5 523 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 L3HYPDHQ96EM0 354 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 MRI1Q9BV20 369 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 RHOFQ9HBH0 211 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 UBP1Q9NZI7 540 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 PDP1Q9P0J1 537 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 OAZ3Q9UMX2 235 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 D6RAR5 112 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 MATN3O15232 486 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 FABP7O15540 132 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 NOBOXO60393 691 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 T-ENOLP0DO92 83 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 AOC1P19801 751 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 KDELR1P24390 212 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 DDTP30046 118 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 TPI1P60174 286 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 IFITM2Q01629 132 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 BDH1Q02338 343 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 AIMP2Q13155 320 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 OR5I1Q13606 314 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 ODF4Q2M2E3 257 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 TMEM41BQ5BJD5 291 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 TFDP3Q5H9I0 405 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 DNM1P34Q6PK57 102 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 ALKAL2Q6UX46 152 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 CASP12Q6UXS9 341 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 VTCN1Q7Z7D3 282 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 TBC1D10CQ8IV04 446 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 ZZZ3Q8IYH5 903 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 CDK20Q8IZL9 346 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 GPR137CQ8N3F9 429 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 NAT16Q8N8M0 369 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 OR13C2Q8NGS9 318 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 RAET1EQ8TD07 263 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 ASB11Q8WXH4 323 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 ECHDC3Q96DC8 303 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 SMARCD1Q96GM5 515 aa5.45□□□□□ -1.54
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