RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589585.1

CTIF-207, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 4

Gene CTIF, Length 564 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-207ENST00000589585 TBPL1P62380 186 aa13.15□□□□□ -0.3
CTIF-207ENST00000589585 ABATP80404 500 aa13.15□□□□□ -0.3
CTIF-207ENST00000589585 DCDP81605 110 aaKnown RBP13.15□□□□□ -0.3
CTIF-207ENST00000589585 POU4F1Q01851 419 aa13.15□□□□□ -0.3
CTIF-207ENST00000589585 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP13.15□□□□□ -0.3
CTIF-207ENST00000589585 USP10Q14694 798 aaKnown RBP13.15□□□□□ -0.3
CTIF-207ENST00000589585 GRM7Q14831 915 aa13.15□□□□□ -0.3
CTIF-207ENST00000589585 SLC9A5Q14940 896 aa13.15□□□□□ -0.3
CTIF-207ENST00000589585 LINC00303Q3SY05 128 aa13.15□□□□□ -0.3
CTIF-207ENST00000589585 TCTE1Q5JU00 501 aa13.15□□□□□ -0.3
CTIF-207ENST00000589585 WASHC2DQ5SRD0 308 aa13.15□□□□□ -0.3
CTIF-207ENST00000589585 FAM69BQ5VUD6 431 aa13.15□□□□□ -0.3
CTIF-207ENST00000589585 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa13.15□□□□□ -0.3
CTIF-207ENST00000589585 MLIPQ5VWP3 458 aa13.15□□□□□ -0.3
CTIF-207ENST00000589585 FRMPD2BQ6IN97 320 aa13.15□□□□□ -0.3
CTIF-207ENST00000589585 FBXO42Q6P3S6 717 aa13.15□□□□□ -0.3
CTIF-207ENST00000589585 AGTRAPQ6RW13 159 aa13.15□□□□□ -0.3
CTIF-207ENST00000589585 FAM198BQ6UWH4 519 aa13.15□□□□□ -0.3
CTIF-207ENST00000589585 TTLL10Q6ZVT0 673 aa13.15□□□□□ -0.3
CTIF-207ENST00000589585 ZNF605Q86T29 641 aa13.15□□□□□ -0.3
CTIF-207ENST00000589585 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP13.15□□□□□ -0.3
CTIF-207ENST00000589585 OR4N4Q8N0Y3 316 aa13.15□□□□□ -0.3
CTIF-207ENST00000589585 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP13.15□□□□□ -0.3
CTIF-207ENST00000589585 PROKR1Q8TCW9 393 aa13.15□□□□□ -0.3
CTIF-207ENST00000589585 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP13.15□□□□□ -0.3
CTIF-207ENST00000589585 TSPAN17Q96FV3 270 aa13.15□□□□□ -0.3
CTIF-207ENST00000589585 WBP1Q96G27 269 aa13.15□□□□□ -0.3
CTIF-207ENST00000589585 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP13.15□□□□□ -0.3
CTIF-207ENST00000589585 RBBP8Q99708 897 aa13.15□□□□□ -0.3
CTIF-207ENST00000589585 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa13.15□□□□□ -0.3
CTIF-207ENST00000589585 PLCD4Q9BRC7 762 aa13.15□□□□□ -0.3
CTIF-207ENST00000589585 MCMBPQ9BTE3 642 aa13.15□□□□□ -0.3
CTIF-207ENST00000589585 NLNQ9BYT8 704 aa13.15□□□□□ -0.3
CTIF-207ENST00000589585 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP13.15□□□□□ -0.3
CTIF-207ENST00000589585 IKZF3Q9UKT9 509 aa13.15□□□□□ -0.3
CTIF-207ENST00000589585 SNX7Q9UNH6 387 aa13.15□□□□□ -0.3
CTIF-207ENST00000589585 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa13.15□□□□□ -0.31
CTIF-207ENST00000589585 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa13.14□□□□□ -0.31
CTIF-207ENST00000589585 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa13.14□□□□□ -0.31
CTIF-207ENST00000589585 H7BY64 318 aa13.14□□□□□ -0.31
CTIF-207ENST00000589585 CDC7O00311 574 aa13.14□□□□□ -0.31
CTIF-207ENST00000589585 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
CTIF-207ENST00000589585 FAM155BO75949 473 aa13.14□□□□□ -0.31
CTIF-207ENST00000589585 FURINP09958 794 aa13.14□□□□□ -0.31
CTIF-207ENST00000589585 RAB40ALP0C0E4 278 aa13.14□□□□□ -0.31
CTIF-207ENST00000589585 SPRP35270 261 aaPredicted RBP13.14□□□□□ -0.31
CTIF-207ENST00000589585 CCR10P46092 362 aa13.14□□□□□ -0.31
CTIF-207ENST00000589585 ARSFP54793 590 aa13.14□□□□□ -0.31
CTIF-207ENST00000589585 AP1S2P56377 157 aa13.14□□□□□ -0.31
CTIF-207ENST00000589585 NFKB2Q00653 900 aa13.14□□□□□ -0.31
CTIF-207ENST00000589585 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP13.14□□□□□ -0.312e-8■■■■□ 22.7
CTIF-207ENST00000589585 NKAIN1Q4KMZ8 207 aa13.14□□□□□ -0.31
CTIF-207ENST00000589585 GRTP1Q5TC63 336 aa13.14□□□□□ -0.31
CTIF-207ENST00000589585 CEP128Q6ZU80 1094 aa13.14□□□□□ -0.31
CTIF-207ENST00000589585 RNF44Q7L0R7 432 aa13.14□□□□□ -0.31
CTIF-207ENST00000589585 SYVN1Q86TM6 617 aa13.14□□□□□ -0.31
CTIF-207ENST00000589585 SPATA6LQ8N4H0 392 aa13.14□□□□□ -0.31
CTIF-207ENST00000589585 ANKRD49Q8WVL7 239 aa13.14□□□□□ -0.31
CTIF-207ENST00000589585 PRAP1Q96NZ9 151 aa13.14□□□□□ -0.31
CTIF-207ENST00000589585 GBP5Q96PP8 586 aa13.14□□□□□ -0.31
CTIF-207ENST00000589585 FMO2Q99518 471 aa13.14□□□□□ -0.31
CTIF-207ENST00000589585 FAM129AQ9BZQ8 928 aa13.14□□□□□ -0.31
CTIF-207ENST00000589585 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
CTIF-207ENST00000589585 PCBD2Q9H0N5 130 aa13.14□□□□□ -0.31
CTIF-207ENST00000589585 CUTCQ9NTM9 273 aa13.14□□□□□ -0.31
CTIF-207ENST00000589585 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP13.14□□□□□ -0.31
CTIF-207ENST00000589585 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP13.14□□□□□ -0.31
CTIF-207ENST00000589585 ANKMY1Q9P2S6 941 aa13.14□□□□□ -0.31
CTIF-207ENST00000589585 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa13.14□□□□□ -0.31
CTIF-207ENST00000589585 H0YGG7 62 aa13.13□□□□□ -0.31
CTIF-207ENST00000589585 C1QAP02745 245 aa13.13□□□□□ -0.31
CTIF-207ENST00000589585 CAPN1P07384 714 aa13.13□□□□□ -0.31
CTIF-207ENST00000589585 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
CTIF-207ENST00000589585 EZRP15311 586 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
CTIF-207ENST00000589585 STMN1P16949 149 aa13.13□□□□□ -0.31
CTIF-207ENST00000589585 CCND1P24385 295 aa13.13□□□□□ -0.31
CTIF-207ENST00000589585 PHBP35232 272 aa13.13□□□□□ -0.31
CTIF-207ENST00000589585 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
CTIF-207ENST00000589585 NCF4Q15080 339 aa13.13□□□□□ -0.31
CTIF-207ENST00000589585 TSNQ15631 228 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
CTIF-207ENST00000589585 FAM214AQ32MH5 1076 aa13.13□□□□□ -0.31
CTIF-207ENST00000589585 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
CTIF-207ENST00000589585 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
CTIF-207ENST00000589585 ZNF425Q6IV72 752 aa13.13□□□□□ -0.31
CTIF-207ENST00000589585 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
CTIF-207ENST00000589585 PAQR7Q86WK9 346 aa13.13□□□□□ -0.31
CTIF-207ENST00000589585 C17orf64Q86WR6 236 aa13.13□□□□□ -0.31
CTIF-207ENST00000589585 PLD3Q8IV08 490 aa13.13□□□□□ -0.31
CTIF-207ENST00000589585 EXD3Q8N9H8 876 aa13.13□□□□□ -0.31
CTIF-207ENST00000589585 APOBEC4Q8WW27 367 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
CTIF-207ENST00000589585 ATL1Q8WXF7 558 aa13.13□□□□□ -0.31
CTIF-207ENST00000589585 RERGQ96A58 199 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
CTIF-207ENST00000589585 PYCR2Q96C36 320 aa13.13□□□□□ -0.31
CTIF-207ENST00000589585 ZNF285Q96NJ3 590 aa13.13□□□□□ -0.31
CTIF-207ENST00000589585 GPR22Q99680 433 aa13.13□□□□□ -0.31
CTIF-207ENST00000589585 C17orf62Q9BQA9 187 aa13.13□□□□□ -0.31
CTIF-207ENST00000589585 TSPYL1Q9H0U9 437 aa13.13□□□□□ -0.31
CTIF-207ENST00000589585 POPDC3Q9HBV1 291 aa13.13□□□□□ -0.31
CTIF-207ENST00000589585 NINJ2Q9NZG7 142 aa13.13□□□□□ -0.31
CTIF-207ENST00000589585 TCFL5Q9UL49 500 aa13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35 ms