RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541576.5

THBS3-210, Transcript of thrombospondin 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene THBS3, Length 3,200 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS3-210ENST00000541576 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa8.4□□□□□ -1.06
THBS3-210ENST00000541576 L3MBTL4Q8NA19 623 aa8.4□□□□□ -1.06
THBS3-210ENST00000541576 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
THBS3-210ENST00000541576 IL17FQ96PD4 163 aa8.4□□□□□ -1.06
THBS3-210ENST00000541576 OR4K3Q96R72 315 aa8.4□□□□□ -1.06
THBS3-210ENST00000541576 FERD3LQ96RJ6 166 aa8.4□□□□□ -1.06
THBS3-210ENST00000541576 NRTNQ99748 197 aa8.4□□□□□ -1.06
THBS3-210ENST00000541576 ORAI3Q9BRQ5 295 aa8.4□□□□□ -1.06
THBS3-210ENST00000541576 IER2Q9BTL4 223 aa8.4□□□□□ -1.06
THBS3-210ENST00000541576 PCED1AQ9H1Q7 454 aa8.4□□□□□ -1.06
THBS3-210ENST00000541576 PRDM8Q9NQV8 689 aa8.4□□□□□ -1.06
THBS3-210ENST00000541576 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa8.4□□□□□ -1.06
THBS3-210ENST00000541576 FARSBQ9NSD9 589 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
THBS3-210ENST00000541576 MRGBPQ9NV56 204 aa8.4□□□□□ -1.06
THBS3-210ENST00000541576 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
THBS3-210ENST00000541576 KCNE2Q9Y6J6 123 aa8.4□□□□□ -1.06
THBS3-210ENST00000541576 SDK1Q7Z5N4 2213 aa8.4□□□□□ -1.06
THBS3-210ENST00000541576 A0A1B0GTW7 788 aa8.4□□□□□ -1.07
THBS3-210ENST00000541576 METTL12A8MUP2 240 aa8.4□□□□□ -1.07
THBS3-210ENST00000541576 AXIN1O15169 862 aa8.4□□□□□ -1.07
THBS3-210ENST00000541576 SLC22A2O15244 555 aa8.4□□□□□ -1.07
THBS3-210ENST00000541576 CLPTM1O96005 669 aa8.4□□□□□ -1.07
THBS3-210ENST00000541576 KRT6AP02538 564 aa8.4□□□□□ -1.07
THBS3-210ENST00000541576 KRT6BP04259 564 aa8.4□□□□□ -1.07
THBS3-210ENST00000541576 COX4I1P13073 169 aa8.4□□□□□ -1.07
THBS3-210ENST00000541576 LBPP18428 481 aa8.4□□□□□ -1.07
THBS3-210ENST00000541576 AK4P27144 223 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.07
THBS3-210ENST00000541576 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.07
THBS3-210ENST00000541576 KRT6CP48668 564 aa8.4□□□□□ -1.07
THBS3-210ENST00000541576 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.07
THBS3-210ENST00000541576 CBX3Q13185 183 aa8.4□□□□□ -1.07
THBS3-210ENST00000541576 CLCA4Q14CN2 919 aa8.4□□□□□ -1.07
THBS3-210ENST00000541576 XKR6Q5GH73 641 aa8.4□□□□□ -1.07
THBS3-210ENST00000541576 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa8.4□□□□□ -1.07
THBS3-210ENST00000541576 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.07
THBS3-210ENST00000541576 DEFB119Q8N690 84 aa8.4□□□□□ -1.07
THBS3-210ENST00000541576 CADM4Q8NFZ8 388 aa8.4□□□□□ -1.07
THBS3-210ENST00000541576 FAM174AQ8TBP5 190 aa8.4□□□□□ -1.07
THBS3-210ENST00000541576 CMTM5Q96DZ9 223 aa8.4□□□□□ -1.07
THBS3-210ENST00000541576 SPACA7Q96KW9 195 aa8.4□□□□□ -1.07
THBS3-210ENST00000541576 SLC6A18Q96N87 628 aa8.4□□□□□ -1.07
THBS3-210ENST00000541576 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.07
THBS3-210ENST00000541576 TMEM168Q9H0V1 697 aa8.4□□□□□ -1.07
THBS3-210ENST00000541576 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.07
THBS3-210ENST00000541576 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.07
THBS3-210ENST00000541576 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa8.39□□□□□ -1.07
THBS3-210ENST00000541576 A0A0J9YVX5 310 aa8.39□□□□□ -1.07
THBS3-210ENST00000541576 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa8.39□□□□□ -1.07
THBS3-210ENST00000541576 OR52A4PA6NMU1 304 aa8.39□□□□□ -1.07
THBS3-210ENST00000541576 E7EQ34 232 aa8.39□□□□□ -1.07
THBS3-210ENST00000541576 K7ESF4 209 aa8.39□□□□□ -1.07
THBS3-210ENST00000541576 MANBAO00462 879 aa8.39□□□□□ -1.07
THBS3-210ENST00000541576 UGDHO60701 494 aa8.39□□□□□ -1.07
THBS3-210ENST00000541576 PRR35P0CG20 571 aa8.39□□□□□ -1.07
THBS3-210ENST00000541576 CD27P26842 260 aa8.39□□□□□ -1.07
THBS3-210ENST00000541576 PCSK6P29122 969 aa8.39□□□□□ -1.07
THBS3-210ENST00000541576 CPOXP36551 454 aa8.39□□□□□ -1.07
THBS3-210ENST00000541576 HSD17B2P37059 387 aa8.39□□□□□ -1.07
THBS3-210ENST00000541576 ACTR1BP42025 376 aa8.39□□□□□ -1.07
THBS3-210ENST00000541576 ACTR1AP61163 376 aa8.39□□□□□ -1.07
THBS3-210ENST00000541576 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
THBS3-210ENST00000541576 KRT33BQ14525 404 aa8.39□□□□□ -1.07
THBS3-210ENST00000541576 ARHGAP19Q14CB8 494 aa8.39□□□□□ -1.07
THBS3-210ENST00000541576 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
THBS3-210ENST00000541576 SGO1Q5FBB7 561 aa8.39□□□□□ -1.07
THBS3-210ENST00000541576 MFSD4BQ5TF39 518 aa8.39□□□□□ -1.07
THBS3-210ENST00000541576 ARPINQ7Z6K5 226 aa8.39□□□□□ -1.07
THBS3-210ENST00000541576 HPS6Q86YV9 775 aa8.39□□□□□ -1.07
THBS3-210ENST00000541576 KLHDC7BQ96G42 594 aa8.39□□□□□ -1.07
THBS3-210ENST00000541576 SGPP1Q9BX95 441 aa8.39□□□□□ -1.07
THBS3-210ENST00000541576 ELOVL6Q9H5J4 265 aa8.39□□□□□ -1.07
THBS3-210ENST00000541576 CAAP1Q9H8G2 361 aa8.39□□□□□ -1.07
THBS3-210ENST00000541576 GPRC5BQ9NZH0 403 aa8.39□□□□□ -1.07
THBS3-210ENST00000541576 TBC1D29Q9UFV1 150 aa8.39□□□□□ -1.07
THBS3-210ENST00000541576 SNX6Q9UNH7 406 aa8.39□□□□□ -1.07
THBS3-210ENST00000541576 DYRK1BQ9Y463 629 aa8.39□□□□□ -1.07
THBS3-210ENST00000541576 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa8.39□□□□□ -1.07
THBS3-210ENST00000541576 DGKBQ9Y6T7 804 aa8.39□□□□□ -1.07
THBS3-210ENST00000541576 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa8.39□□□□□ -1.07
THBS3-210ENST00000541576 KCNE1BA0A087WTH5 132 aa8.39□□□□□ -1.07
THBS3-210ENST00000541576 ZNF839A8K0R7 811 aa8.39□□□□□ -1.07
THBS3-210ENST00000541576 PI15O43692 258 aa8.39□□□□□ -1.07
THBS3-210ENST00000541576 TNFP01375 233 aa8.39□□□□□ -1.07
THBS3-210ENST00000541576 IMPDH2P12268 514 aa8.39□□□□□ -1.07
THBS3-210ENST00000541576 SQLEQ14534 574 aa8.39□□□□□ -1.07
THBS3-210ENST00000541576 RPE65Q16518 533 aa8.39□□□□□ -1.07
THBS3-210ENST00000541576 NADK2Q4G0N4 442 aa8.39□□□□□ -1.07
THBS3-210ENST00000541576 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa8.39□□□□□ -1.07
THBS3-210ENST00000541576 LIPJQ5W064 366 aa8.39□□□□□ -1.07
THBS3-210ENST00000541576 SUSD1Q6UWL2 747 aa8.39□□□□□ -1.07
THBS3-210ENST00000541576 RNF165Q6ZSG1 346 aa8.39□□□□□ -1.07
THBS3-210ENST00000541576 SNX32Q86XE0 403 aa8.39□□□□□ -1.07
THBS3-210ENST00000541576 SFRP1Q8N474 314 aa8.39□□□□□ -1.07
THBS3-210ENST00000541576 RAB42Q8N4Z0 105 aa8.39□□□□□ -1.07
THBS3-210ENST00000541576 ICA1LQ8NDH6 482 aa8.39□□□□□ -1.07
THBS3-210ENST00000541576 CCL4L1Q8NHW4 92 aa8.39□□□□□ -1.07
THBS3-210ENST00000541576 USP7Q93009 1102 aa8.39□□□□□ -1.07
THBS3-210ENST00000541576 MVB12BQ9H7P6 319 aa8.39□□□□□ -1.07
THBS3-210ENST00000541576 GPR27Q9NS67 375 aa8.39□□□□□ -1.07
THBS3-210ENST00000541576 SPATA7Q9P0W8 599 aa8.39□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.3 ms