RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515062.5

SEC31A-240, Transcript of SEC31 homolog A, COPII coat complex component, human

TSL 3

Gene SEC31A, Length 597 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SEC31A-240	ENST00000515062	PGBD5	Q8N414	524 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SEC31A-240	ENST00000515062	PRR26	Q8N8Z3	221 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SEC31A-240	ENST00000515062	CCNY	Q8ND76	341 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SEC31A-240	ENST00000515062	SPATA22	Q8NHS9	363 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SEC31A-240	ENST00000515062	FIG4	Q92562	907 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SEC31A-240	ENST00000515062	SLCO4A1	Q96BD0	722 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SEC31A-240	ENST00000515062	TMEM19	Q96HH6	336 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SEC31A-240	ENST00000515062	OXNAD1	Q96HP4	312 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SEC31A-240	ENST00000515062	EPSTI1	Q96J88	318 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SEC31A-240	ENST00000515062	ZNF385A	Q96PM9	386 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SEC31A-240	ENST00000515062	ZMYND12	Q9H0C1	365 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SEC31A-240	ENST00000515062	DDX47	Q9H0S4	455 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SEC31A-240	ENST00000515062	SDCBP2	Q9H190	292 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SEC31A-240	ENST00000515062	KCNK6	Q9Y257	313 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SEC31A-240	ENST00000515062	VDAC3	Q9Y277	283 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SEC31A-240	ENST00000515062	ZNF510	Q9Y2H8	683 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SEC31A-240	ENST00000515062	KLK4	Q9Y5K2	254 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SEC31A-240	ENST00000515062	LINC01553	A4QN01	128 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SEC31A-240	ENST00000515062	LDB3	O75112	727 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SEC31A-240	ENST00000515062	PAPSS2	O95340	614 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SEC31A-240	ENST00000515062	KRT19	P08727	400 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SEC31A-240	ENST00000515062	SLC26A5	P58743	744 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SEC31A-240	ENST00000515062	KCNJ10	P78508	379 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SEC31A-240	ENST00000515062	KLHL30	Q0D2K2	578 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SEC31A-240	ENST00000515062	PPP1R8	Q12972	351 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SEC31A-240	ENST00000515062	SRSF7	Q16629	238 aa	Known RBP eCLIP	4.87	□□□□□ -1.63
SEC31A-240	ENST00000515062	ODF3L2	Q3SX64	289 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SEC31A-240	ENST00000515062	OR4A47	Q6IF82	309 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SEC31A-240	ENST00000515062	OR7E24	Q6IFN5	339 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SEC31A-240	ENST00000515062	UNC5D	Q6UXZ4	953 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SEC31A-240	ENST00000515062	FJX1	Q86VR8	437 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SEC31A-240	ENST00000515062	ADHFE1	Q8IWW8	467 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SEC31A-240	ENST00000515062	DNAJC10	Q8IXB1	793 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SEC31A-240	ENST00000515062	MUC20	Q8N307	709 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SEC31A-240	ENST00000515062	OR52E1	Q8NGJ3	308 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SEC31A-240	ENST00000515062	SLC20A1	Q8WUM9	679 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SEC31A-240	ENST00000515062	TRIM44	Q96DX7	344 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SEC31A-240	ENST00000515062	DTD2	Q96FN9	168 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SEC31A-240	ENST00000515062	SCMH1	Q96GD3	660 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SEC31A-240	ENST00000515062	SAMD8	Q96LT4	415 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SEC31A-240	ENST00000515062	ZNF559	Q9BR84	538 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SEC31A-240	ENST00000515062	ATG10	Q9H0Y0	220 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SEC31A-240	ENST00000515062	C10orf88	Q9H8K7	445 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SEC31A-240	ENST00000515062	UBTD1	Q9HAC8	227 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SEC31A-240	ENST00000515062	GPN1	Q9HCN4	374 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SEC31A-240	ENST00000515062	MRPL17	Q9NRX2	175 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SEC31A-240	ENST00000515062	NOCT	Q9UK39	431 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SEC31A-240	ENST00000515062	DNPEP	Q9ULA0	475 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SEC31A-240	ENST00000515062	PLEKHA6	Q9Y2H5	1048 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SEC31A-240	ENST00000515062	OR2W1	Q9Y3N9	320 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SEC31A-240	ENST00000515062	TMED3	Q9Y3Q3	217 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SEC31A-240	ENST00000515062	ATP8B3	O60423	1300 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SEC31A-240	ENST00000515062	IGLV5-37	A0A075B6J1	123 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SEC31A-240	ENST00000515062	TRAV18	A0A075B6X5	111 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SEC31A-240	ENST00000515062		A0A1W2PN81	502 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SEC31A-240	ENST00000515062	TMEM129	A0AVI4	362 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SEC31A-240	ENST00000515062	PRSS46	E5RG02	174 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SEC31A-240	ENST00000515062	ZNF197	O14709	1029 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SEC31A-240	ENST00000515062	MAGEB2	O15479	319 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SEC31A-240	ENST00000515062	KDM4B	O94953	1096 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SEC31A-240	ENST00000515062	IGHD	P01880	384 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SEC31A-240	ENST00000515062	CXCL10	P02778	98 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SEC31A-240	ENST00000515062	PGK2	P07205	417 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SEC31A-240	ENST00000515062	SP9	P0CG40	484 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SEC31A-240	ENST00000515062	ACP2	P11117	423 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SEC31A-240	ENST00000515062	NR1D1	P20393	614 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SEC31A-240	ENST00000515062	ADSS	P30520	456 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SEC31A-240	ENST00000515062	CHRNA7	P36544	502 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SEC31A-240	ENST00000515062	ISL1	P61371	349 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SEC31A-240	ENST00000515062	PITX1	P78337	314 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SEC31A-240	ENST00000515062	NONO	Q15233	471 aa	Known RBP eCLIP	4.86	□□□□□ -1.63
SEC31A-240	ENST00000515062	FASTKD1	Q53R41	847 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SEC31A-240	ENST00000515062	MTX3	Q5HYI7	312 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SEC31A-240	ENST00000515062	ZNF770	Q6IQ21	691 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SEC31A-240	ENST00000515062	KLHL10	Q6JEL2	608 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SEC31A-240	ENST00000515062	GFRAL	Q6UXV0	394 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SEC31A-240	ENST00000515062	DLEU7	Q6UYE1	221 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SEC31A-240	ENST00000515062	C1orf186	Q6ZWK4	172 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SEC31A-240	ENST00000515062	TAF8	Q7Z7C8	310 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SEC31A-240	ENST00000515062	ASPG	Q86U10	573 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SEC31A-240	ENST00000515062	TMEM219	Q86XT9	240 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SEC31A-240	ENST00000515062	LAX1	Q8IWV1	398 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SEC31A-240	ENST00000515062	MMD2	Q8IY49	270 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SEC31A-240	ENST00000515062	LGI2	Q8N0V4	545 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SEC31A-240	ENST00000515062	CCDC63	Q8NA47	563 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SEC31A-240	ENST00000515062	ZNF114	Q8NC26	417 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SEC31A-240	ENST00000515062	ZNF540	Q8NDQ6	660 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SEC31A-240	ENST00000515062	DENND6B	Q8NEG7	585 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SEC31A-240	ENST00000515062	SLC24A4	Q8NFF2	622 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SEC31A-240	ENST00000515062	DDB2	Q92466	427 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SEC31A-240	ENST00000515062	TSACC	Q96A04	125 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SEC31A-240	ENST00000515062	MRPL38	Q96DV4	380 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SEC31A-240	ENST00000515062	CHFR	Q96EP1	664 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SEC31A-240	ENST00000515062	FAM20A	Q96MK3	541 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SEC31A-240	ENST00000515062	DDX50	Q9BQ39	737 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SEC31A-240	ENST00000515062	NACAP1	Q9BZK3	213 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SEC31A-240	ENST00000515062	DPH5	Q9H2P9	285 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SEC31A-240	ENST00000515062	ZDHHC6	Q9H6R6	413 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SEC31A-240	ENST00000515062	TRPC7	Q9HCX4	862 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SEC31A-240	ENST00000515062	TCF7L2	Q9NQB0	619 aa		4.86	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.7 ms