RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000340074.9

UBE3B-201, Transcript of ubiquitin protein ligase E3B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene UBE3B, Length 1,448 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3B-201ENST00000340074 SERPINB9P50453 376 aa14.62□□□□□ -0.07
UBE3B-201ENST00000340074 UCNP55089 124 aa14.62□□□□□ -0.07
UBE3B-201ENST00000340074 TMPRSS3P57727 454 aa14.62□□□□□ -0.07
UBE3B-201ENST00000340074 VSNL1P62760 191 aa14.62□□□□□ -0.07
UBE3B-201ENST00000340074 CXADRP78310 365 aa14.62□□□□□ -0.07
UBE3B-201ENST00000340074 CDKL1Q00532 357 aa14.62□□□□□ -0.07
UBE3B-201ENST00000340074 IRF9Q00978 393 aa14.62□□□□□ -0.07
UBE3B-201ENST00000340074 GPS2Q13227 327 aa14.62□□□□□ -0.07
UBE3B-201ENST00000340074 TGFBIQ15582 683 aa14.62□□□□□ -0.07
UBE3B-201ENST00000340074 FRMPD2BQ6IN97 320 aa14.62□□□□□ -0.07
UBE3B-201ENST00000340074 ZNF425Q6IV72 752 aa14.62□□□□□ -0.07
UBE3B-201ENST00000340074 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
UBE3B-201ENST00000340074 FBXO42Q6P3S6 717 aa14.62□□□□□ -0.07
UBE3B-201ENST00000340074 CCDC81Q6ZN84 652 aa14.62□□□□□ -0.07
UBE3B-201ENST00000340074 RNF44Q7L0R7 432 aa14.62□□□□□ -0.07
UBE3B-201ENST00000340074 TAOK1Q7L7X3 1001 aa14.62□□□□□ -0.07
UBE3B-201ENST00000340074 PAQR7Q86WK9 346 aa14.62□□□□□ -0.07
UBE3B-201ENST00000340074 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
UBE3B-201ENST00000340074 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP14.62□□□□□ -0.07
UBE3B-201ENST00000340074 CLIP3Q96DZ5 547 aa14.62□□□□□ -0.07
UBE3B-201ENST00000340074 SELENOSQ9BQE4 189 aa14.62□□□□□ -0.07
UBE3B-201ENST00000340074 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa14.62□□□□□ -0.07
UBE3B-201ENST00000340074 LHX9Q9NQ69 397 aa14.62□□□□□ -0.07
UBE3B-201ENST00000340074 IGSF5Q9NSI5 407 aa14.62□□□□□ -0.07
UBE3B-201ENST00000340074 ANKMY1Q9P2S6 941 aa14.62□□□□□ -0.07
UBE3B-201ENST00000340074 ZNF180Q9UJW8 692 aa14.62□□□□□ -0.07
UBE3B-201ENST00000340074 PADI1Q9ULC6 663 aa14.62□□□□□ -0.07
UBE3B-201ENST00000340074 A0A087X1B8 175 aa14.61□□□□□ -0.07
UBE3B-201ENST00000340074 A0A096LPK6 155 aa14.61□□□□□ -0.07
UBE3B-201ENST00000340074 LOC105369274A0A096LPK9 316 aa14.61□□□□□ -0.07
UBE3B-201ENST00000340074 LOC102723532A0A0G2JNH3 316 aa14.61□□□□□ -0.07
UBE3B-201ENST00000340074 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
UBE3B-201ENST00000340074 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
UBE3B-201ENST00000340074 H7BY64 318 aa14.61□□□□□ -0.07
UBE3B-201ENST00000340074 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
UBE3B-201ENST00000340074 KRT38O76015 456 aa14.61□□□□□ -0.07
UBE3B-201ENST00000340074 LTA4HP09960 611 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
UBE3B-201ENST00000340074 NCF1P14598 390 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
UBE3B-201ENST00000340074 NPPBP16860 134 aa14.61□□□□□ -0.07
UBE3B-201ENST00000340074 WT1P19544 449 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
UBE3B-201ENST00000340074 GCAP28676 217 aa14.61□□□□□ -0.07
UBE3B-201ENST00000340074 VSX2P58304 361 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
UBE3B-201ENST00000340074 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
UBE3B-201ENST00000340074 TLDC1Q6P9B6 456 aa14.61□□□□□ -0.07
UBE3B-201ENST00000340074 FAM199XQ6PEV8 388 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
UBE3B-201ENST00000340074 LCTLQ6UWM7 567 aa14.61□□□□□ -0.07
UBE3B-201ENST00000340074 ADCK2Q7Z695 626 aa14.61□□□□□ -0.07
UBE3B-201ENST00000340074 CCDC91Q7Z6B0 441 aa14.61□□□□□ -0.07
UBE3B-201ENST00000340074 GPSM1Q86YR5 675 aa14.61□□□□□ -0.07
UBE3B-201ENST00000340074 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
UBE3B-201ENST00000340074 OR4N4Q8N0Y3 316 aa14.61□□□□□ -0.07
UBE3B-201ENST00000340074 KCTD4Q8WVF5 259 aa14.61□□□□□ -0.07
UBE3B-201ENST00000340074 KIAA1191Q96A73 305 aa14.61□□□□□ -0.07
UBE3B-201ENST00000340074 NXNL1Q96CM4 212 aa14.61□□□□□ -0.07
UBE3B-201ENST00000340074 PRAP1Q96NZ9 151 aa14.61□□□□□ -0.07
UBE3B-201ENST00000340074 OR4K3Q96R72 315 aa14.61□□□□□ -0.07
UBE3B-201ENST00000340074 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa14.61□□□□□ -0.07
UBE3B-201ENST00000340074 DHRS4Q9BTZ2 278 aa14.61□□□□□ -0.07
UBE3B-201ENST00000340074 GPN2Q9H9Y4 310 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
UBE3B-201ENST00000340074 NMRAL1Q9HBL8 299 aa14.61□□□□□ -0.07
UBE3B-201ENST00000340074 STARD5Q9NSY2 213 aa14.61□□□□□ -0.07
UBE3B-201ENST00000340074 CROTQ9UKG9 612 aa14.61□□□□□ -0.07
UBE3B-201ENST00000340074 TLK1Q9UKI8 766 aa14.61□□□□□ -0.07
UBE3B-201ENST00000340074 SNX7Q9UNH6 387 aa14.61□□□□□ -0.07
UBE3B-201ENST00000340074 AP1M2Q9Y6Q5 423 aa14.61□□□□□ -0.07
UBE3B-201ENST00000340074 MEN1O00255 615 aa14.6□□□□□ -0.07
UBE3B-201ENST00000340074 HBQ1P09105 142 aa14.6□□□□□ -0.07
UBE3B-201ENST00000340074 EZRP15311 586 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
UBE3B-201ENST00000340074 TFEBP19484 476 aa14.6□□□□□ -0.07
UBE3B-201ENST00000340074 CNTFP26441 200 aa14.6□□□□□ -0.07
UBE3B-201ENST00000340074 RORAP35398 523 aa14.6□□□□□ -0.07
UBE3B-201ENST00000340074 DLSTP36957 453 aa14.6□□□□□ -0.07
UBE3B-201ENST00000340074 SLC26A3P40879 764 aa14.6□□□□□ -0.07
UBE3B-201ENST00000340074 KCNC1P48547 511 aa14.6□□□□□ -0.07
UBE3B-201ENST00000340074 HNMTP50135 292 aa14.6□□□□□ -0.07
UBE3B-201ENST00000340074 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
UBE3B-201ENST00000340074 PTCHD3Q3KNS1 767 aa14.6□□□□□ -0.07
UBE3B-201ENST00000340074 ARHGAP40Q5TG30 622 aa14.6□□□□□ -0.07
UBE3B-201ENST00000340074 ISCA2Q86U28 154 aa14.6□□□□□ -0.07
UBE3B-201ENST00000340074 C17orf64Q86WR6 236 aa14.6□□□□□ -0.07
UBE3B-201ENST00000340074 DSELQ8IZU8 1212 aa14.6□□□□□ -0.07
UBE3B-201ENST00000340074 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
UBE3B-201ENST00000340074 ISL2Q96A47 359 aa14.6□□□□□ -0.07
UBE3B-201ENST00000340074 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
UBE3B-201ENST00000340074 RHBDF1Q96CC6 855 aa14.6□□□□□ -0.07
UBE3B-201ENST00000340074 LRFN5Q96NI6 719 aa14.6□□□□□ -0.07
UBE3B-201ENST00000340074 ZNF285Q96NJ3 590 aa14.6□□□□□ -0.07
UBE3B-201ENST00000340074 HAUS8Q9BT25 410 aa14.6□□□□□ -0.07
UBE3B-201ENST00000340074 VPS11Q9H270 941 aa14.6□□□□□ -0.07
UBE3B-201ENST00000340074 PRORYQ9H606 182 aa14.6□□□□□ -0.07
UBE3B-201ENST00000340074 ALG9Q9H6U8 611 aa14.6□□□□□ -0.07
UBE3B-201ENST00000340074 SYNPO2LQ9H987 977 aa14.6□□□□□ -0.07
UBE3B-201ENST00000340074 PCMTD2Q9NV79 361 aa14.6□□□□□ -0.07
UBE3B-201ENST00000340074 TMEM184CQ9NVA4 438 aa14.6□□□□□ -0.07
UBE3B-201ENST00000340074 SCN3AQ9NY46 2000 aa14.6□□□□□ -0.07
UBE3B-201ENST00000340074 RNF112Q9ULX5 631 aa14.6□□□□□ -0.07
UBE3B-201ENST00000340074 TRIM49D1C9J1S8 452 aa14.59□□□□□ -0.07
UBE3B-201ENST00000340074 K7ENP7 123 aa14.59□□□□□ -0.07
UBE3B-201ENST00000340074 HAT1O14929 419 aa14.59□□□□□ -0.07
UBE3B-201ENST00000340074 SRPX2O60687 465 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.2 ms