RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000598594.1

PAF1-208, Transcript of PAF1 homolog, Paf1/RNA polymerase II complex component, human

TSL 2

Gene PAF1, Length 280 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PAF1-208	ENST00000598594	ZNF461	Q8TAF7	563 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PAF1-208	ENST00000598594	GDPD5	Q8WTR4	605 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PAF1-208	ENST00000598594	GLYATL2	Q8WU03	294 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PAF1-208	ENST00000598594	PIGK	Q92643	395 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PAF1-208	ENST00000598594	ALG3	Q92685	438 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PAF1-208	ENST00000598594	OSTF1	Q92882	214 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PAF1-208	ENST00000598594	RAB1C	Q92928	201 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PAF1-208	ENST00000598594	PPP1R14B	Q96C90	147 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PAF1-208	ENST00000598594	NUDT11	Q96G61	164 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PAF1-208	ENST00000598594	HSPA12B	Q96MM6	686 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PAF1-208	ENST00000598594	MS4A10	Q96PG2	267 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PAF1-208	ENST00000598594	CCNL2	Q96S94	520 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
PAF1-208	ENST00000598594	OLFM1	Q99784	485 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PAF1-208	ENST00000598594	SLC29A1	Q99808	456 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PAF1-208	ENST00000598594	ATG101	Q9BSB4	218 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PAF1-208	ENST00000598594	ELOVL1	Q9BW60	279 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PAF1-208	ENST00000598594	VN1R3	Q9BXE9	311 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PAF1-208	ENST00000598594	ANKRD60	Q9BZ19	345 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PAF1-208	ENST00000598594	TSGA10	Q9BZW7	698 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PAF1-208	ENST00000598594	NDEL1	Q9GZM8	345 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PAF1-208	ENST00000598594	KATNBL1	Q9H079	304 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PAF1-208	ENST00000598594	TKTL2	Q9H0I9	626 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PAF1-208	ENST00000598594	WWP1	Q9H0M0	922 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PAF1-208	ENST00000598594	ZNF768	Q9H5H4	540 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
PAF1-208	ENST00000598594	GEMIN7	Q9H840	131 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
PAF1-208	ENST00000598594	SLC28A3	Q9HAS3	691 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PAF1-208	ENST00000598594	CHMP1A	Q9HD42	196 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
PAF1-208	ENST00000598594	ZNF275	Q9NSD4	429 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
PAF1-208	ENST00000598594	RHCG	Q9UBD6	479 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PAF1-208	ENST00000598594	UPB1	Q9UBR1	384 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PAF1-208	ENST00000598594	RNF14	Q9UBS8	474 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PAF1-208	ENST00000598594	NKX1-2	Q9UD57	310 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
PAF1-208	ENST00000598594		Q9UFV3	132 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PAF1-208	ENST00000598594	CDC42EP3	Q9UKI2	254 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PAF1-208	ENST00000598594	AMFR	Q9UKV5	643 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PAF1-208	ENST00000598594	RNF150	Q9ULK6	438 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PAF1-208	ENST00000598594	TBC1D24	Q9ULP9	559 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PAF1-208	ENST00000598594	DISP3	Q9P2K9	1392 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PAF1-208	ENST00000598594	NINL	Q9Y2I6	1382 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PAF1-208	ENST00000598594	MEX3A	A1L020	520 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
PAF1-208	ENST00000598594	GOLGA8IP	A6NC78	632 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PAF1-208	ENST00000598594	OR6C68	A6NDL8	312 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PAF1-208	ENST00000598594	TMEM191C	A6NGB0	347 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PAF1-208	ENST00000598594	PCP4L1	A6NKN8	68 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PAF1-208	ENST00000598594	DUXA	A6NLW8	204 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PAF1-208	ENST00000598594		H0YGN5	161 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PAF1-208	ENST00000598594	FFAR3	O14843	346 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PAF1-208	ENST00000598594	MDM4	O15151	490 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PAF1-208	ENST00000598594	GPR42	O15529	346 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PAF1-208	ENST00000598594	AP5Z1	O43299	807 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PAF1-208	ENST00000598594	TRAPPC3	O43617	180 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PAF1-208	ENST00000598594	CALU	O43852	315 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
PAF1-208	ENST00000598594	PRAMEF11	O60813	436 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PAF1-208	ENST00000598594	NDUFS6	O75380	124 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
PAF1-208	ENST00000598594	CREG1	O75629	220 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PAF1-208	ENST00000598594	BAG4	O95429	457 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
PAF1-208	ENST00000598594	ACSL3	O95573	720 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PAF1-208	ENST00000598594	NDUFB10	O96000	172 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PAF1-208	ENST00000598594	CA3	P07451	260 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PAF1-208	ENST00000598594	LYN	P07948	512 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PAF1-208	ENST00000598594	TMEM191B	P0C7N4	346 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PAF1-208	ENST00000598594	NID1	P14543	1247 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PAF1-208	ENST00000598594	CPA3	P15088	417 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PAF1-208	ENST00000598594	ZNF44	P15621	663 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PAF1-208	ENST00000598594	HOXB4	P17483	251 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
PAF1-208	ENST00000598594	MX1	P20591	662 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PAF1-208	ENST00000598594	DDX6	P26196	483 aa	Known RBP eCLIP	5.07	□□□□□ -1.6
PAF1-208	ENST00000598594	MAT2A	P31153	395 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
PAF1-208	ENST00000598594	KIR2DL3	P43628	341 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PAF1-208	ENST00000598594	CACNA2D1	P54289	1103 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PAF1-208	ENST00000598594	YWHAG	P61981	247 aa	Known RBP eCLIP	5.07	□□□□□ -1.6
PAF1-208	ENST00000598594	PPP2R2B	Q00005	443 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PAF1-208	ENST00000598594	CSTF1	Q05048	431 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
PAF1-208	ENST00000598594	ENPEP	Q07075	957 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PAF1-208	ENST00000598594	PMPCA	Q10713	525 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PAF1-208	ENST00000598594	DMP1	Q13316	513 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
PAF1-208	ENST00000598594	SELPLG	Q14242	412 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PAF1-208	ENST00000598594	UBXN2B	Q14CS0	331 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PAF1-208	ENST00000598594	SHB	Q15464	509 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PAF1-208	ENST00000598594	ALKBH6	Q3KRA9	238 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PAF1-208	ENST00000598594	ZC2HC1C	Q53FD0	456 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
PAF1-208	ENST00000598594	DCAF6	Q58WW2	860 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PAF1-208	ENST00000598594	TTC23	Q5W5X9	447 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PAF1-208	ENST00000598594	TMEM200B	Q69YZ2	307 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PAF1-208	ENST00000598594	ZSCAN25	Q6NSZ9	544 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PAF1-208	ENST00000598594	SCYL2	Q6P3W7	929 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PAF1-208	ENST00000598594	CCDC137	Q6PK04	289 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
PAF1-208	ENST00000598594	LINC00114	Q6XXX2	140 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PAF1-208	ENST00000598594	COLCA1	Q6ZS62	124 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PAF1-208	ENST00000598594	C1orf229	Q6ZS94	237 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
PAF1-208	ENST00000598594	TRPM8	Q7Z2W7	1104 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PAF1-208	ENST00000598594	CLEC14A	Q86T13	490 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PAF1-208	ENST00000598594	PAQR7	Q86WK9	346 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PAF1-208	ENST00000598594	CHERP	Q8IWX8	916 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
PAF1-208	ENST00000598594	LRRC75A-AS1	Q8N1F1	130 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PAF1-208	ENST00000598594	DTWD1	Q8N5C7	304 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PAF1-208	ENST00000598594	FITM2	Q8N6M3	262 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PAF1-208	ENST00000598594	PLA2G15	Q8NCC3	412 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PAF1-208	ENST00000598594	OR4K14	Q8NGD5	310 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PAF1-208	ENST00000598594	OR4A16	Q8NH70	328 aa		5.07	□□□□□ -1.6

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