RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000259365.8

TMOD1-201, Transcript of tropomodulin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMOD1, Length 3,343 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD1-201ENST00000259365 TSPEARQ8WU66 669 aa13.03□□□□□ -0.32
TMOD1-201ENST00000259365 KCNS3Q9BQ31 491 aa13.03□□□□□ -0.32
TMOD1-201ENST00000259365 HEPHQ9BQS7 1158 aa13.03□□□□□ -0.32
TMOD1-201ENST00000259365 RNF186Q9NXI6 227 aa13.03□□□□□ -0.32
TMOD1-201ENST00000259365 ACSL6Q9UKU0 697 aa13.03□□□□□ -0.32
TMOD1-201ENST00000259365 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa13.03□□□□□ -0.32
TMOD1-201ENST00000259365 TTC36A6NLP5 189 aa13.02□□□□□ -0.32
TMOD1-201ENST00000259365 SYN3O14994 580 aa13.02□□□□□ -0.32
TMOD1-201ENST00000259365 TRBC1P01850 177 aa13.02□□□□□ -0.32
TMOD1-201ENST00000259365 FABP3P05413 133 aa13.02□□□□□ -0.32
TMOD1-201ENST00000259365 LAMP1P11279 417 aa13.02□□□□□ -0.32
TMOD1-201ENST00000259365 PORP16435 677 aaPredicted RBP13.02□□□□□ -0.32
TMOD1-201ENST00000259365 CCR7P32248 378 aa13.02□□□□□ -0.32
TMOD1-201ENST00000259365 HNF4AP41235 474 aa13.02□□□□□ -0.32
TMOD1-201ENST00000259365 SERPINB10P48595 397 aa13.02□□□□□ -0.32
TMOD1-201ENST00000259365 CDH12P55289 794 aa13.02□□□□□ -0.32
TMOD1-201ENST00000259365 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP13.02□□□□□ -0.32
TMOD1-201ENST00000259365 C11orf96Q7Z7L8 435 aa13.02□□□□□ -0.32
TMOD1-201ENST00000259365 FAM217AQ8IXS0 508 aa13.02□□□□□ -0.32
TMOD1-201ENST00000259365 STX19Q8N4C7 294 aa13.02□□□□□ -0.32
TMOD1-201ENST00000259365 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP13.02□□□□□ -0.32
TMOD1-201ENST00000259365 OR8J3Q8NGG0 315 aa13.02□□□□□ -0.32
TMOD1-201ENST00000259365 SORCS1Q8WY21 1168 aa13.02□□□□□ -0.32
TMOD1-201ENST00000259365 APOL4Q9BPW4 351 aa13.02□□□□□ -0.32
TMOD1-201ENST00000259365 IMPAD1Q9NX62 359 aa13.02□□□□□ -0.32
TMOD1-201ENST00000259365 CFAP97Q9P2B7 532 aa13.02□□□□□ -0.32
TMOD1-201ENST00000259365 PPT2Q9UMR5 302 aa13.02□□□□□ -0.32
TMOD1-201ENST00000259365 Q9Y3F1 56 aa13.02□□□□□ -0.32
TMOD1-201ENST00000259365 EFCAB9A8MZ26 197 aa13.02□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 ANKRD28O15084 1053 aa13.02□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 TPST2O60704 377 aa13.02□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 MYO1DO94832 1006 aa13.02□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 EOMESO95936 686 aa13.02□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 SDC1P18827 310 aa13.02□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 CR2P20023 1033 aa13.02□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 AZGP1P25311 298 aaKnown RBP13.02□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 RRM2P31350 389 aa13.02□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 CLCA4Q14CN2 919 aa13.02□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 MED22Q15528 200 aa13.02□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 SNX20Q7Z614 316 aa13.02□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP13.02□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 HIPK1Q86Z02 1210 aa13.02□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 DPP10Q8N608 796 aa13.02□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 RAET1EQ8TD07 263 aa13.02□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 CAPSLQ8WWF8 208 aa13.02□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 LGALS12Q96DT0 336 aa13.02□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 FAM210AQ96ND0 272 aa13.02□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 INIPQ9NRY2 104 aa13.02□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 ABCB8Q9NUT2 735 aa13.02□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 USE1Q9NZ43 259 aa13.02□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 FNIP2Q9P278 1114 aa13.02□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 SNX6Q9UNH7 406 aa13.02□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 A0A0G2JMZ2 1700 aa13.01□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 LRRC37A2A6NM11 1700 aa13.01□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 SDK1Q7Z5N4 2213 aa13.01□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP13.01□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 H3BNC9 293 aa13.01□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 ADAMTS4O75173 837 aa13.01□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 CD160O95971 181 aa13.01□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 TRPC1P48995 793 aa13.01□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 TUFMP49411 452 aaKnown RBP13.01□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 PPP2R2BQ00005 443 aa13.01□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 RING1Q06587 406 aa13.01□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 CATSPEREQ5SY80 951 aa13.01□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 C6orf183Q5T699 404 aa13.01□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 GALNT7Q86SF2 657 aa13.01□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 PDPRQ8NCN5 879 aa13.01□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 TRUB1Q8WWH5 349 aaKnown RBP13.01□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP13.01□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 COPS4Q9BT78 406 aa13.01□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 ATAD3AQ9NVI7 634 aa13.01□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 THUMPD1Q9NXG2 353 aaKnown RBP13.01□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa13.01□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa13.01□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 A8MV72 311 aaPredicted RBP13.01□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 BMP4P12644 408 aa13.01□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 GABRR2P28476 465 aa13.01□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 CD70P32970 193 aa13.01□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP13.01□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 SYTL3Q4VX76 610 aa13.01□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 FAR1Q8WVX9 515 aa13.01□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 P2RY13Q9BPV8 354 aa13.01□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 NEURL2Q9BR09 285 aa13.01□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP13.01□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP13.01□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 CTPS2Q9NRF8 586 aa13.01□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 DDX28Q9NUL7 540 aaKnown RBP13.01□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 MARCH5Q9NX47 278 aa13.01□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP13.01□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa13.01□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 MAGEB17A8MXT2 336 aa13.01□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 H7C4K7 107 aa13.01□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 AIREO43918 545 aa13.01□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 SERPIND1P05546 499 aa13.01□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 MAGEA11P43364 429 aa13.01□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 CLK3P49761 638 aaKnown RBP13.01□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 IFITM3Q01628 133 aa13.01□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 LAIR1Q6GTX8 287 aa13.01□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 NOXRED1Q6NXP6 359 aa13.01□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 OR8H2Q8N162 312 aa13.01□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 81.1 ms