RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498211.5

DMKN-259, Transcript of dermokine, human

TSL 1 (best)

Gene DMKN, Length 666 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DMKN-259	ENST00000498211	PPM1M	Q96MI6	270 aa		13.54	□□□□□ -0.24
DMKN-259	ENST00000498211	TTC1	Q99614	292 aa		13.54	□□□□□ -0.24
DMKN-259	ENST00000498211	COPS8	Q99627	209 aa		13.54	□□□□□ -0.24
DMKN-259	ENST00000498211	RHOXF2	Q9BQY4	288 aa		13.54	□□□□□ -0.24
DMKN-259	ENST00000498211	NAT9	Q9BTE0	207 aa		13.54	□□□□□ -0.24
DMKN-259	ENST00000498211	FANCE	Q9HB96	536 aa		13.54	□□□□□ -0.24
DMKN-259	ENST00000498211	C1GALT1	Q9NS00	363 aa		13.54	□□□□□ -0.24
DMKN-259	ENST00000498211	ZDHHC3	Q9NYG2	299 aa		13.54	□□□□□ -0.24
DMKN-259	ENST00000498211	IL1RAPL1	Q9NZN1	696 aa		13.54	□□□□□ -0.24
DMKN-259	ENST00000498211	POMT2	Q9UKY4	750 aa		13.54	□□□□□ -0.24
DMKN-259	ENST00000498211	ACSL5	Q9ULC5	683 aa		13.54	□□□□□ -0.24
DMKN-259	ENST00000498211	CHMP2B	Q9UQN3	213 aa		13.54	□□□□□ -0.24
DMKN-259	ENST00000498211	CFAP20	Q9Y6A4	193 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
DMKN-259	ENST00000498211	FBN2	P35556	2912 aa		13.54	□□□□□ -0.24
DMKN-259	ENST00000498211	ZCWPW2	A0A1B0GU75	182 aa		13.53	□□□□□ -0.24
DMKN-259	ENST00000498211	MGAT4D	A6NG13	374 aa		13.53	□□□□□ -0.24
DMKN-259	ENST00000498211	OR2AG2	A6NM03	316 aa		13.53	□□□□□ -0.24
DMKN-259	ENST00000498211	MATN2	O00339	956 aa		13.53	□□□□□ -0.24
DMKN-259	ENST00000498211	CD3EAP	O15446	510 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
DMKN-259	ENST00000498211	KLF7	O75840	302 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
DMKN-259	ENST00000498211	POLB	P06746	335 aa		13.53	□□□□□ -0.24
DMKN-259	ENST00000498211	PGAM1	P18669	254 aa		13.53	□□□□□ -0.24
DMKN-259	ENST00000498211	TNFRSF8	P28908	595 aa		13.53	□□□□□ -0.24
DMKN-259	ENST00000498211	ITIH4	Q14624	930 aa		13.53	□□□□□ -0.24
DMKN-259	ENST00000498211	DBN1	Q16643	649 aa		13.53	□□□□□ -0.24
DMKN-259	ENST00000498211	ZNF385C	Q66K41	422 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
DMKN-259	ENST00000498211	ARMC6	Q6NXE6	501 aa		13.53	□□□□□ -0.24
DMKN-259	ENST00000498211	FBXO38	Q6PIJ6	1188 aa		13.53	□□□□□ -0.24
DMKN-259	ENST00000498211	ZDHHC24	Q6UX98	284 aa		13.53	□□□□□ -0.24
DMKN-259	ENST00000498211	PACS1	Q6VY07	963 aa		13.53	□□□□□ -0.24
DMKN-259	ENST00000498211	CENPU	Q71F23	418 aa		13.53	□□□□□ -0.24
DMKN-259	ENST00000498211	LDB1	Q86U70	411 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
DMKN-259	ENST00000498211	CCDC25	Q86WR0	208 aa		13.53	□□□□□ -0.24
DMKN-259	ENST00000498211	SLC34A3	Q8N130	599 aa		13.53	□□□□□ -0.24
DMKN-259	ENST00000498211	OR2L2	Q8NH16	312 aa		13.53	□□□□□ -0.24
DMKN-259	ENST00000498211	OR1L3	Q8NH93	324 aa		13.53	□□□□□ -0.24
DMKN-259	ENST00000498211	CLIP3	Q96DZ5	547 aa		13.53	□□□□□ -0.24
DMKN-259	ENST00000498211	C12orf66	Q96MD2	445 aa		13.53	□□□□□ -0.24
DMKN-259	ENST00000498211	IP6K3	Q96PC2	410 aa		13.53	□□□□□ -0.24
DMKN-259	ENST00000498211	DHRS4	Q9BTZ2	278 aa		13.53	□□□□□ -0.24
DMKN-259	ENST00000498211	PHACTR1	Q9C0D0	580 aa		13.53	□□□□□ -0.24
DMKN-259	ENST00000498211	WWP1	Q9H0M0	922 aa		13.53	□□□□□ -0.24
DMKN-259	ENST00000498211	ACTR5	Q9H9F9	607 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
DMKN-259	ENST00000498211	SAYSD1	Q9NPB0	183 aa		13.53	□□□□□ -0.24
DMKN-259	ENST00000498211	FAM114A2	Q9NRY5	505 aa		13.53	□□□□□ -0.24
DMKN-259	ENST00000498211	CATSPERZ	Q9NTU4	200 aa		13.53	□□□□□ -0.24
DMKN-259	ENST00000498211	SOHLH2	Q9NX45	425 aa		13.53	□□□□□ -0.24
DMKN-259	ENST00000498211	MAP10	Q9P2G4	905 aa		13.53	□□□□□ -0.24
DMKN-259	ENST00000498211	ZC3H7B	Q9UGR2	993 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
DMKN-259	ENST00000498211	POLE	Q07864	2286 aa		13.52	□□□□□ -0.24
DMKN-259	ENST00000498211	ANKUB1	A6NFN9	424 aa		13.52	□□□□□ -0.25
DMKN-259	ENST00000498211	SLC9B1P1	A6NJY1	282 aa		13.52	□□□□□ -0.25
DMKN-259	ENST00000498211	CFAP99	D6REC4	459 aa		13.52	□□□□□ -0.25
DMKN-259	ENST00000498211	SGTA	O43765	313 aa		13.52	□□□□□ -0.25
DMKN-259	ENST00000498211	TTC4	O95801	387 aa		13.52	□□□□□ -0.25
DMKN-259	ENST00000498211	ATP1B2	P14415	290 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
DMKN-259	ENST00000498211	PPARG	P37231	505 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
DMKN-259	ENST00000498211	SOX8	P57073	446 aa		13.52	□□□□□ -0.25
DMKN-259	ENST00000498211	THOC5	Q13769	683 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
DMKN-259	ENST00000498211	LONRF1	Q17RB8	773 aa		13.52	□□□□□ -0.25
DMKN-259	ENST00000498211	BCL7A	Q4VC05	210 aa		13.52	□□□□□ -0.25
DMKN-259	ENST00000498211	AARS2	Q5JTZ9	985 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
DMKN-259	ENST00000498211	TEX35	Q5T0J7	233 aa		13.52	□□□□□ -0.25
DMKN-259	ENST00000498211	NEPRO	Q6NW34	567 aa		13.52	□□□□□ -0.25
DMKN-259	ENST00000498211	DUS1L	Q6P1R4	473 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
DMKN-259	ENST00000498211	MRGPRE	Q86SM8	312 aa		13.52	□□□□□ -0.25
DMKN-259	ENST00000498211	SDCCAG8	Q86SQ7	713 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
DMKN-259	ENST00000498211	RAB43	Q86YS6	212 aa		13.52	□□□□□ -0.25
DMKN-259	ENST00000498211	ZBED8	Q8IZ13	594 aa		13.52	□□□□□ -0.25
DMKN-259	ENST00000498211	CISD2	Q8N5K1	135 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
DMKN-259	ENST00000498211	SERBP1	Q8NC51	408 aa	Known RBP eCLIP	13.52	□□□□□ -0.25
DMKN-259	ENST00000498211	FBXO36	Q8NEA4	188 aa		13.52	□□□□□ -0.25
DMKN-259	ENST00000498211	SPDYE1	Q8NFV5	336 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
DMKN-259	ENST00000498211	PYROXD1	Q8WU10	500 aa		13.52	□□□□□ -0.25
DMKN-259	ENST00000498211	LINC00615	Q96LM1	132 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
DMKN-259	ENST00000498211	PITPNM3	Q9BZ71	974 aa		13.52	□□□□□ -0.25
DMKN-259	ENST00000498211	FAM129A	Q9BZQ8	928 aa		13.52	□□□□□ -0.25
DMKN-259	ENST00000498211	C20orf96	Q9NUD7	363 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
DMKN-259	ENST00000498211	MARCH4	Q9P2E8	410 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
DMKN-259	ENST00000498211	TEX264	Q9Y6I9	313 aa		13.52	□□□□□ -0.25
DMKN-259	ENST00000498211	FAM169A	Q9Y6X4	670 aa		13.52	□□□□□ -0.25
DMKN-259	ENST00000498211	COLEC10	Q9Y6Z7	277 aa		13.52	□□□□□ -0.25
DMKN-259	ENST00000498211	TMEM150C	B9EJG8	249 aa		13.51	□□□□□ -0.25
DMKN-259	ENST00000498211	EIF3H	O15372	352 aa	Known RBP eCLIP	13.51	□□□□□ -0.25
DMKN-259	ENST00000498211	OR1I1	O60431	355 aa		13.51	□□□□□ -0.25
DMKN-259	ENST00000498211	KLHL41	O60662	606 aa		13.51	□□□□□ -0.25
DMKN-259	ENST00000498211	ALPP	P05187	535 aa		13.51	□□□□□ -0.25
DMKN-259	ENST00000498211	POLR2C	P19387	275 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
DMKN-259	ENST00000498211	CYP2A7	P20853	494 aa		13.51	□□□□□ -0.25
DMKN-259	ENST00000498211	CDH3	P22223	829 aa		13.51	□□□□□ -0.25
DMKN-259	ENST00000498211	NDUFS1	P28331	727 aa		13.51	□□□□□ -0.25
DMKN-259	ENST00000498211	PBLD	P30039	288 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
DMKN-259	ENST00000498211	NSG1	P42857	185 aa		13.51	□□□□□ -0.25
DMKN-259	ENST00000498211	PREP	P48147	710 aa		13.51	□□□□□ -0.25
DMKN-259	ENST00000498211	PRLHR	P49683	370 aa		13.51	□□□□□ -0.25
DMKN-259	ENST00000498211	FRG1	Q14331	258 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
DMKN-259	ENST00000498211	SEMA3A	Q14563	771 aa		13.51	□□□□□ -0.25
DMKN-259	ENST00000498211	CRYM	Q14894	314 aa		13.51	□□□□□ -0.25
DMKN-259	ENST00000498211	MYBPC3	Q14896	1274 aa		13.51	□□□□□ -0.25
DMKN-259	ENST00000498211	FASTKD3	Q14CZ7	662 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.7 ms