RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000607882.5

RABGEF1-209, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2

Gene RABGEF1, Length 2,654 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-209ENST00000607882 LPOP22079 712 aaPredicted RBP12.25□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 SPAM1P38567 509 aa12.25□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 TSPAN7P41732 249 aa12.25□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 CCL7P80098 99 aa12.25□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP12.25□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 NR0B2Q15466 257 aa12.25□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 GPRC6AQ5T6X5 926 aa12.25□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 CASC4Q6P4E1 433 aa12.25□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 PIANPQ8IYJ0 282 aa12.25□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa12.25□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa12.25□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 TTC1Q99614 292 aa12.25□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP12.25□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 CDH19Q9H159 772 aa12.25□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 VCXQ9H320 206 aa12.25□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP12.25□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 SCOCQ9UIL1 159 aa12.25□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 AK5Q9Y6K8 562 aa12.25□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 A0A1W2PQM1 296 aa12.24□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 FAM159BA6NKW6 160 aa12.24□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 C2orf81A6NN90 581 aa12.24□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 SNNO75324 88 aaPredicted RBP12.24□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 CIB2O75838 187 aa12.24□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 USP1O94782 785 aa12.24□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 AP2A1O95782 977 aa12.24□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 MC4RP32245 332 aa12.24□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP12.24□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 STX3Q13277 289 aa12.24□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 PEX6Q13608 980 aa12.24□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 C3orf38Q5JPI3 329 aa12.24□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 C1orf146Q5VVC0 180 aa12.24□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP12.24□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa12.24□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 MTBPQ96DY7 904 aa12.24□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 TSC22D3Q99576 134 aa12.24□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 DUSP23Q9BVJ7 150 aa12.24□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 CCDC106Q9BWC9 280 aa12.24□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 CHRAC1Q9NRG0 131 aa12.24□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 TMEM9Q9P0T7 183 aa12.24□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 CLCA2Q9UQC9 943 aa12.24□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 IGSF10Q6WRI0 2623 aa12.24□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 SPTBP11277 2137 aa12.24□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP12.24□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 SRP72O76094 671 aaKnown RBP12.24□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 BAG2O95816 211 aa12.24□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 POLBP06746 335 aa12.24□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 ATXN8OSP0DMR3 200 aa12.24□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 ITGB6P18564 788 aa12.24□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 CRHR1P34998 444 aa12.24□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 MAGEA3P43357 314 aa12.24□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 MAGEA6P43360 314 aa12.24□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 NFE2L1Q14494 772 aa12.24□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 MYBPC3Q14896 1274 aa12.24□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP12.24□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 C6orf163Q5TEZ5 329 aa12.24□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP12.24□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa12.24□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 NRSN1Q8IZ57 195 aa12.24□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 ARL14Q8N4G2 192 aa12.24□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 MCUQ8NE86 351 aa12.24□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 SLC37A2Q8TED4 501 aa12.24□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 LRRC39Q96DD0 335 aa12.24□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 DCBLD2Q96PD2 775 aa12.24□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa12.24□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP12.24□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 CIDEBQ9UHD4 219 aa12.24□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 WDR37Q9Y2I8 494 aa12.24□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP12.24□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP12.24□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 A8MU76 341 aa12.24□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 ITM2AO43736 263 aa12.24□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 KATNA1O75449 491 aa12.24□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 EPOP01588 193 aa12.24□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 SERPINA6P08185 405 aa12.24□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 UBTFL6P0CB48 400 aaPredicted RBP12.24□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP12.24□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 ACP1P24666 158 aa12.24□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 ST3GAL2Q16842 350 aa12.24□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP12.24□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 OR52E8Q6IFG1 317 aa12.24□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 TMEM220Q6QAJ8 160 aa12.24□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 IZUMO2Q6UXV1 221 aa12.24□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP12.24□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 TRAM1L1Q8N609 369 aa12.24□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 POU5F2Q8N7G0 328 aa12.24□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 BRSK1Q8TDC3 778 aa12.24□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 NUDT22Q9BRQ3 303 aa12.24□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 CRLS1Q9UJA2 301 aa12.24□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 F8W8V4 182 aa12.23□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 NUAK1O60285 661 aa12.23□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 OR1I1O60431 355 aa12.23□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 CSO75390 466 aaKnown RBP12.23□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 MT-CO3P00414 261 aa12.23□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 PCNAP12004 261 aa12.23□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 ANPEPP15144 967 aa12.23□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 TYRP1P17643 537 aa12.23□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP12.23□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 ACTR3P61158 418 aa12.23□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 B4GALNT1Q00973 533 aa12.23□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP12.23□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.9 ms