RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497511.5

SKAP2-209, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, human

TSL 4

Gene SKAP2, Length 585 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SKAP2-209	ENST00000497511	METRNL	Q641Q3	311 aa		10.47	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	SASS6	Q6UVJ0	657 aa		10.47	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM180A	Q6UWF9	173 aa		10.47	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	NXPE1	Q8N323	547 aa		10.47	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	CNTD1	Q8N815	330 aa		10.47	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	FAR1	Q8WVX9	515 aa		10.47	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	IMP4	Q96G21	291 aa	Known RBP	10.47	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	MAGEB10	Q96LZ2	347 aa	Predicted RBP	10.47	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	BARD1	Q99728	777 aa	Known RBP	10.47	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	THAP2	Q9H0W7	228 aa		10.47	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	EPS8L2	Q9H6S3	715 aa		10.47	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	ZBTB20	Q9HC78	741 aa	Predicted RBP	10.47	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	IL26	Q9NPH9	171 aa		10.47	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	IGF2BP1	Q9NZI8	577 aa	Known RBP eCLIP	10.47	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	SUCO	Q9UBS9	1254 aa	Known RBP	10.47	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	SPO11	Q9Y5K1	396 aa		10.47	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	HEBP2	Q9Y5Z4	205 aa		10.47	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	DIDO1	Q9BTC0	2240 aa	Known RBP	10.46	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	CCDC66	A2RUB6	948 aa		10.46	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	MGAT4D	A6NG13	374 aa		10.46	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	GPR39	O43194	453 aa		10.46	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	KLF7	O75840	302 aa	Predicted RBP	10.46	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	OR2B3	O76000	313 aa		10.46	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	CBSL	P0DN79	551 aa		10.46	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	COX6B1	P14854	86 aa		10.46	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	PVR	P15151	417 aa		10.46	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	PRDX3	P30048	256 aa	Known RBP	10.46	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	CBS	P35520	551 aa		10.46	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	HMGCL	P35914	325 aa		10.46	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	DCD	P81605	110 aa	Known RBP	10.46	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	PPID	Q08752	370 aa	Known RBP	10.46	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC10A2	Q12908	348 aa	Predicted RBP	10.46	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	AIMP2	Q13155	320 aa	Known RBP	10.46	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF169	Q14929	603 aa	Predicted RBP	10.46	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF789	Q5FWF6	425 aa		10.46	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	AGAP7P	Q5VUJ5	663 aa		10.46	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	SPOCD1	Q6ZMY3	1216 aa		10.46	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	GLT6D1	Q7Z4J2	308 aa		10.46	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	CFAP206	Q8IYR0	622 aa		10.46	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC25A41	Q8N5S1	370 aa		10.46	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	DDHD1	Q8NEL9	900 aa		10.46	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	ACVR1C	Q8NER5	493 aa		10.46	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	OR2Y1	Q8NGV0	311 aa		10.46	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	SPATA22	Q8NHS9	363 aa		10.46	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM71B	Q8TC56	605 aa		10.46	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	BLOC1S5	Q8TDH9	187 aa		10.46	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	PPP4R1	Q8TF05	950 aa		10.46	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	COG1	Q8WTW3	980 aa		10.46	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	PTER	Q96BW5	349 aa		10.46	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	MISP3	Q96FF7	219 aa		10.46	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	LURAP1	Q96LR2	239 aa		10.46	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	AGAP4	Q96P64	663 aa		10.46	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	FERD3L	Q96RJ6	166 aa		10.46	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	AP1M1	Q9BXS5	423 aa		10.46	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	ISCU	Q9H1K1	167 aa		10.46	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC25A51	Q9H1U9	297 aa		10.46	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	TRABD	Q9H4I3	376 aa		10.46	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	OLAH	Q9NV23	265 aa		10.46	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	UBP1	Q9NZI7	540 aa		10.46	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	PKP3	Q9Y446	797 aa		10.46	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	CSAG2	Q9Y5P2	127 aa		10.46	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	AP1M2	Q9Y6Q5	423 aa		10.46	□□□□□ -0.73
SKAP2-209	ENST00000497511	CROCC	Q5TZA2	2017 aa		10.46	□□□□□ -0.74
SKAP2-209	ENST00000497511	POLE	Q07864	2286 aa		10.46	□□□□□ -0.74
SKAP2-209	ENST00000497511	OTOG	Q6ZRI0	2925 aa		10.46	□□□□□ -0.74
SKAP2-209	ENST00000497511		A0A1W2PQJ5	194 aa		10.45	□□□□□ -0.74
SKAP2-209	ENST00000497511	KLHL33	A6NCF5	533 aa		10.45	□□□□□ -0.74
SKAP2-209	ENST00000497511	LRRC10B	A6NIK2	292 aa		10.45	□□□□□ -0.74
SKAP2-209	ENST00000497511	C2orf74	A8MZ97	194 aa		10.45	□□□□□ -0.74
SKAP2-209	ENST00000497511	IFRD1	O00458	451 aa	Predicted RBP	10.45	□□□□□ -0.74
SKAP2-209	ENST00000497511	E2F3	O00716	465 aa		10.45	□□□□□ -0.74
SKAP2-209	ENST00000497511	PPP1R12A	O14974	1030 aa	Predicted RBP	10.45	□□□□□ -0.74
SKAP2-209	ENST00000497511	BUD23	O43709	281 aa	Known RBP	10.45	□□□□□ -0.74
SKAP2-209	ENST00000497511	PYGM	P11217	842 aa		10.45	□□□□□ -0.74
SKAP2-209	ENST00000497511	PTGER4	P35408	488 aa		10.45	□□□□□ -0.74
SKAP2-209	ENST00000497511	PRKCI	P41743	596 aa		10.45	□□□□□ -0.74
SKAP2-209	ENST00000497511	TSFM	P43897	325 aa	Known RBP	10.45	□□□□□ -0.74
SKAP2-209	ENST00000497511	ARSE	P51690	589 aa		10.45	□□□□□ -0.74
SKAP2-209	ENST00000497511	ART3	Q13508	389 aa		10.45	□□□□□ -0.74
SKAP2-209	ENST00000497511	PDK1	Q15118	436 aa		10.45	□□□□□ -0.74
SKAP2-209	ENST00000497511	FILIP1L	Q4L180	1135 aa		10.45	□□□□□ -0.74
SKAP2-209	ENST00000497511	VWA2	Q5GFL6	755 aa		10.45	□□□□□ -0.74
SKAP2-209	ENST00000497511	CDHR3	Q6ZTQ4	885 aa		10.45	□□□□□ -0.74
SKAP2-209	ENST00000497511	PQLC3	Q8N755	202 aa		10.45	□□□□□ -0.74
SKAP2-209	ENST00000497511	BCORP1	Q8N888	145 aa		10.45	□□□□□ -0.74
SKAP2-209	ENST00000497511	OR2L2	Q8NH16	312 aa		10.45	□□□□□ -0.74
SKAP2-209	ENST00000497511	DCUN1D1	Q96GG9	259 aa		10.45	□□□□□ -0.74
SKAP2-209	ENST00000497511	RBM41	Q96IZ5	413 aa	Known RBP	10.45	□□□□□ -0.74
SKAP2-209	ENST00000497511	RMDN2	Q96LZ7	410 aa		10.45	□□□□□ -0.74
SKAP2-209	ENST00000497511	MAK16	Q9BXY0	300 aa	Known RBP	10.45	□□□□□ -0.74
SKAP2-209	ENST00000497511	CHST11	Q9NPF2	352 aa		10.45	□□□□□ -0.74
SKAP2-209	ENST00000497511	ANO10	Q9NW15	660 aa		10.45	□□□□□ -0.74
SKAP2-209	ENST00000497511	AIPL1	Q9NZN9	384 aa		10.45	□□□□□ -0.74
SKAP2-209	ENST00000497511	CHMP5	Q9NZZ3	219 aa		10.45	□□□□□ -0.74
SKAP2-209	ENST00000497511	CDC23	Q9UJX2	597 aa		10.45	□□□□□ -0.74
SKAP2-209	ENST00000497511	CDYL	Q9Y232	598 aa		10.45	□□□□□ -0.74
SKAP2-209	ENST00000497511		A0A0A6YYK5	440 aa	Predicted RBP	10.44	□□□□□ -0.74
SKAP2-209	ENST00000497511	TRGV8	A0A0C4DH27	118 aa		10.44	□□□□□ -0.74
SKAP2-209	ENST00000497511	AGPS	O00116	658 aa		10.44	□□□□□ -0.74
SKAP2-209	ENST00000497511	BTN3A1	O00481	513 aa		10.44	□□□□□ -0.74

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.5 ms