RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380298.2

SLC22A23-201, Transcript of solute carrier family 22 member 23, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SLC22A23, Length 1,574 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC22A23-201ENST00000380298 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP26.68■■□□□ 1.86
SLC22A23-201ENST00000380298 SLCO6A1Q86UG4 719 aa26.68■■□□□ 1.86
SLC22A23-201ENST00000380298 ATL1Q8WXF7 558 aa26.68■■□□□ 1.86
SLC22A23-201ENST00000380298 RSC1A1Q92681 617 aa26.68■■□□□ 1.86
SLC22A23-201ENST00000380298 EPHA6Q9UF33 1036 aa26.68■■□□□ 1.86
SLC22A23-201ENST00000380298 RNF112Q9ULX5 631 aa26.68■■□□□ 1.86
SLC22A23-201ENST00000380298 ENTPD2Q9Y5L3 495 aa26.68■■□□□ 1.86
SLC22A23-201ENST00000380298 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP26.67■■□□□ 1.86
SLC22A23-201ENST00000380298 GLRBP48167 497 aa26.67■■□□□ 1.86
SLC22A23-201ENST00000380298 CCT5P48643 541 aa26.67■■□□□ 1.86
SLC22A23-201ENST00000380298 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP26.67■■□□□ 1.86
SLC22A23-201ENST00000380298 CCDC157Q569K6 752 aa26.67■■□□□ 1.86
SLC22A23-201ENST00000380298 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa26.67■■□□□ 1.86
SLC22A23-201ENST00000380298 IL17FQ96PD4 163 aa26.67■■□□□ 1.86
SLC22A23-201ENST00000380298 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP26.67■■□□□ 1.86
SLC22A23-201ENST00000380298 TWSG1Q9GZX9 223 aa26.67■■□□□ 1.86
SLC22A23-201ENST00000380298 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP26.67■■□□□ 1.86
SLC22A23-201ENST00000380298 CENPHQ9H3R5 247 aa26.67■■□□□ 1.86
SLC22A23-201ENST00000380298 ZNF358Q9NW07 568 aa26.67■■□□□ 1.86
SLC22A23-201ENST00000380298 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP26.67■■□□□ 1.86
SLC22A23-201ENST00000380298 SYCE1LA8MT33 242 aa26.67■■□□□ 1.86
SLC22A23-201ENST00000380298 ANXA5P08758 320 aa26.67■■□□□ 1.86
SLC22A23-201ENST00000380298 PNLIPRP1P54315 467 aa26.67■■□□□ 1.86
SLC22A23-201ENST00000380298 ARMC6Q6NXE6 501 aa26.67■■□□□ 1.86
SLC22A23-201ENST00000380298 PLXDC1Q8IUK5 500 aa26.67■■□□□ 1.86
SLC22A23-201ENST00000380298 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP26.67■■□□□ 1.86
SLC22A23-201ENST00000380298 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa26.67■■□□□ 1.86
SLC22A23-201ENST00000380298 ZNF480Q8WV37 535 aa26.67■■□□□ 1.86
SLC22A23-201ENST00000380298 NCSTNQ92542 709 aa26.67■■□□□ 1.86
SLC22A23-201ENST00000380298 ATOH8Q96SQ7 321 aa26.67■■□□□ 1.86
SLC22A23-201ENST00000380298 MRPL57Q9BQC6 102 aaKnown RBP26.67■■□□□ 1.86
SLC22A23-201ENST00000380298 ANKRD12Q6UB98 2062 aa26.66■■□□□ 1.86
SLC22A23-201ENST00000380298 DCDC2BA2VCK2 349 aa26.66■■□□□ 1.86
SLC22A23-201ENST00000380298 KRT87PA6NCN2 255 aa26.66■■□□□ 1.86
SLC22A23-201ENST00000380298 BTN3A3O00478 584 aa26.66■■□□□ 1.86
SLC22A23-201ENST00000380298 GLRA3O75311 464 aa26.66■■□□□ 1.86
SLC22A23-201ENST00000380298 GUCA1CO95843 209 aa26.66■■□□□ 1.86
SLC22A23-201ENST00000380298 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP26.66■■□□□ 1.86
SLC22A23-201ENST00000380298 IMPA1P29218 277 aa26.66■■□□□ 1.86
SLC22A23-201ENST00000380298 CRHR1P34998 444 aa26.66■■□□□ 1.86
SLC22A23-201ENST00000380298 HNMTP50135 292 aa26.66■■□□□ 1.86
SLC22A23-201ENST00000380298 SPIDRQ14159 915 aa26.66■■□□□ 1.86
SLC22A23-201ENST00000380298 TECRLQ5HYJ1 363 aa26.66■■□□□ 1.86
SLC22A23-201ENST00000380298 USP53Q70EK8 1073 aa26.66■■□□□ 1.86
SLC22A23-201ENST00000380298 LINC01555Q8NAE3 123 aa26.66■■□□□ 1.86
SLC22A23-201ENST00000380298 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP26.66■■□□□ 1.86
SLC22A23-201ENST00000380298 FBXL8Q96CD0 374 aa26.66■■□□□ 1.86
SLC22A23-201ENST00000380298 NRTNQ99748 197 aa26.66■■□□□ 1.86
SLC22A23-201ENST00000380298 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP26.66■■□□□ 1.86
SLC22A23-201ENST00000380298 PIPSLA2A3N6 862 aa26.65■■□□□ 1.86
SLC22A23-201ENST00000380298 COPEO14579 308 aa26.65■■□□□ 1.86
SLC22A23-201ENST00000380298 CHRM5P08912 532 aaPredicted RBP26.65■■□□□ 1.86
SLC22A23-201ENST00000380298 KCNC1P48547 511 aa26.65■■□□□ 1.86
SLC22A23-201ENST00000380298 KIR2DS3Q14952 304 aa26.65■■□□□ 1.86
SLC22A23-201ENST00000380298 TMEM71Q6P5X7 295 aa26.65■■□□□ 1.86
SLC22A23-201ENST00000380298 SYTL1Q8IYJ3 562 aa26.65■■□□□ 1.86
SLC22A23-201ENST00000380298 C4orf33Q8N1A6 199 aa26.65■■□□□ 1.86
SLC22A23-201ENST00000380298 SMPDL3AQ92484 453 aa26.65■■□□□ 1.86
SLC22A23-201ENST00000380298 SLC22A18Q96BI1 424 aa26.65■■□□□ 1.86
SLC22A23-201ENST00000380298 ZDHHC12Q96GR4 267 aa26.65■■□□□ 1.86
SLC22A23-201ENST00000380298 SCYL1Q96KG9 808 aa26.65■■□□□ 1.86
SLC22A23-201ENST00000380298 SMC6Q96SB8 1091 aa26.65■■□□□ 1.86
SLC22A23-201ENST00000380298 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP26.65■■□□□ 1.86
SLC22A23-201ENST00000380298 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa26.65■■□□□ 1.86
SLC22A23-201ENST00000380298 MKS1Q9NXB0 559 aa26.65■■□□□ 1.86
SLC22A23-201ENST00000380298 C2orf74A8MZ97 194 aa26.64■■□□□ 1.86
SLC22A23-201ENST00000380298 E7ENX8 843 aa26.64■■□□□ 1.86
SLC22A23-201ENST00000380298 MAP2K7O14733 419 aa26.64■■□□□ 1.86
SLC22A23-201ENST00000380298 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP26.64■■□□□ 1.86
SLC22A23-201ENST00000380298 TAP2Q03519 686 aa26.64■■□□□ 1.86
SLC22A23-201ENST00000380298 CFHR1Q03591 330 aa26.64■■□□□ 1.86
SLC22A23-201ENST00000380298 AGTRAPQ6RW13 159 aa26.64■■□□□ 1.86
SLC22A23-201ENST00000380298 MBOAT1Q6ZNC8 495 aa26.64■■□□□ 1.86
SLC22A23-201ENST00000380298 TCAIMQ8N3R3 496 aa26.64■■□□□ 1.86
SLC22A23-201ENST00000380298 EGFL8Q99944 293 aa26.64■■□□□ 1.86
SLC22A23-201ENST00000380298 ZMYND15Q9H091 742 aa26.64■■□□□ 1.86
SLC22A23-201ENST00000380298 NUDT4Q9NZJ9 180 aa26.64■■□□□ 1.86
SLC22A23-201ENST00000380298 GRID1Q9ULK0 1009 aa26.64■■□□□ 1.86
SLC22A23-201ENST00000380298 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP26.64■■□□□ 1.86
SLC22A23-201ENST00000380298 D6RAR5 112 aa26.63■■□□□ 1.85
SLC22A23-201ENST00000380298 AGPSO00116 658 aa26.63■■□□□ 1.85
SLC22A23-201ENST00000380298 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP26.63■■□□□ 1.85
SLC22A23-201ENST00000380298 CSF2RBP32927 897 aa26.63■■□□□ 1.85
SLC22A23-201ENST00000380298 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP26.63■■□□□ 1.85
SLC22A23-201ENST00000380298 PDPRQ8NCN5 879 aa26.63■■□□□ 1.85
SLC22A23-201ENST00000380298 OR4D9Q8NGE8 314 aa26.63■■□□□ 1.85
SLC22A23-201ENST00000380298 CD180Q99467 661 aa26.63■■□□□ 1.85
SLC22A23-201ENST00000380298 NUDT22Q9BRQ3 303 aa26.63■■□□□ 1.85
SLC22A23-201ENST00000380298 TMBIM4Q9HC24 238 aa26.63■■□□□ 1.85
SLC22A23-201ENST00000380298 CD274Q9NZQ7 290 aa26.63■■□□□ 1.85
SLC22A23-201ENST00000380298 TMEM216Q9P0N5 145 aa26.63■■□□□ 1.85
SLC22A23-201ENST00000380298 XPR1Q9UBH6 696 aa26.63■■□□□ 1.85
SLC22A23-201ENST00000380298 ACTL7BQ9Y614 415 aa26.63■■□□□ 1.85
SLC22A23-201ENST00000380298 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP26.63■■□□□ 1.85
SLC22A23-201ENST00000380298 GSAPA4D1B5 854 aa26.63■■□□□ 1.85
SLC22A23-201ENST00000380298 CASC3O15234 703 aaKnown RBP26.63■■□□□ 1.85
SLC22A23-201ENST00000380298 C9P02748 559 aa26.63■■□□□ 1.85
SLC22A23-201ENST00000380298 S100BP04271 92 aaPredicted RBP26.63■■□□□ 1.85
SLC22A23-201ENST00000380298 SULT1C3Q6IMI6 304 aa26.63■■□□□ 1.85
SLC22A23-201ENST00000380298 DHRS13Q6UX07 377 aa26.63■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.8 ms