RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000320031.12

ITGA3-202, Transcript of integrin subunit alpha 3, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene ITGA3, Length 4,888 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3-202ENST00000320031 TRAF7Q6Q0C0 670 aa16.14■□□□□ 0.17
ITGA3-202ENST00000320031 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa16.14■□□□□ 0.17
ITGA3-202ENST00000320031 NATD1Q8N6N6 113 aa16.14■□□□□ 0.17
ITGA3-202ENST00000320031 BORCS5Q969J3 196 aa16.14■□□□□ 0.17
ITGA3-202ENST00000320031 SPACA7Q96KW9 195 aa16.14■□□□□ 0.17
ITGA3-202ENST00000320031 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa16.14■□□□□ 0.17
ITGA3-202ENST00000320031 CGREF1Q99674 301 aa16.14■□□□□ 0.17
ITGA3-202ENST00000320031 RIMKLBQ9ULI2 386 aa16.14■□□□□ 0.17
ITGA3-202ENST00000320031 ERGIC3Q9Y282 383 aa16.14■□□□□ 0.17
ITGA3-202ENST00000320031 A0A1W2PP18 115 aa16.14■□□□□ 0.17
ITGA3-202ENST00000320031 GKP32189 559 aa16.14■□□□□ 0.17
ITGA3-202ENST00000320031 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.17
ITGA3-202ENST00000320031 EMX2Q04743 252 aa16.14■□□□□ 0.17
ITGA3-202ENST00000320031 KCNC3Q14003 757 aa16.14■□□□□ 0.17
ITGA3-202ENST00000320031 C6orf52Q5T4I8 152 aa16.14■□□□□ 0.17
ITGA3-202ENST00000320031 Q6ZVL8 140 aa16.14■□□□□ 0.17
ITGA3-202ENST00000320031 THOC6Q86W42 341 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.17
ITGA3-202ENST00000320031 SLC22A18Q96BI1 424 aa16.14■□□□□ 0.17
ITGA3-202ENST00000320031 CHID1Q9BWS9 393 aa16.14■□□□□ 0.17
ITGA3-202ENST00000320031 SRMSQ9H3Y6 488 aa16.14■□□□□ 0.17
ITGA3-202ENST00000320031 PRDM8Q9NQV8 689 aa16.14■□□□□ 0.17
ITGA3-202ENST00000320031 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP16.13■□□□□ 0.17
ITGA3-202ENST00000320031 TIE1P35590 1138 aa16.13■□□□□ 0.17
ITGA3-202ENST00000320031 XKR4Q5GH76 650 aa16.13■□□□□ 0.17
ITGA3-202ENST00000320031 NCEH1Q6PIU2 408 aa16.13■□□□□ 0.17
ITGA3-202ENST00000320031 TEX47Q8TBZ9 253 aa16.13■□□□□ 0.17
ITGA3-202ENST00000320031 ZBED6CLQ96FA7 236 aaPredicted RBP16.13■□□□□ 0.17
ITGA3-202ENST00000320031 SIPA1Q96FS4 1042 aa16.13■□□□□ 0.17
ITGA3-202ENST00000320031 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP16.13■□□□□ 0.17
ITGA3-202ENST00000320031 PCDHAC1Q9H158 963 aa16.13■□□□□ 0.17
ITGA3-202ENST00000320031 ELOVL2Q9NXB9 296 aa16.13■□□□□ 0.17
ITGA3-202ENST00000320031 COL24A1Q17RW2 1714 aa16.13■□□□□ 0.17
ITGA3-202ENST00000320031 ACP5P13686 325 aa16.13■□□□□ 0.17
ITGA3-202ENST00000320031 HMGCLP35914 325 aa16.13■□□□□ 0.17
ITGA3-202ENST00000320031 PRR5P85299 388 aa16.13■□□□□ 0.17
ITGA3-202ENST00000320031 FAM26DQ5JW98 314 aa16.13■□□□□ 0.17
ITGA3-202ENST00000320031 CEP97Q8IW35 865 aa16.13■□□□□ 0.17
ITGA3-202ENST00000320031 KLK6Q92876 244 aa16.13■□□□□ 0.17
ITGA3-202ENST00000320031 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa16.13■□□□□ 0.17
ITGA3-202ENST00000320031 EFCAB10A6NFE3 127 aa16.13■□□□□ 0.17
ITGA3-202ENST00000320031 MMP20O60882 483 aa16.13■□□□□ 0.17
ITGA3-202ENST00000320031 TIMP1P01033 207 aa16.13■□□□□ 0.17
ITGA3-202ENST00000320031 CDK9P50750 372 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
ITGA3-202ENST00000320031 BLKP51451 505 aa16.13■□□□□ 0.17
ITGA3-202ENST00000320031 AQP4P55087 323 aa16.13■□□□□ 0.17
ITGA3-202ENST00000320031 TAS2R41P59536 307 aa16.13■□□□□ 0.17
ITGA3-202ENST00000320031 SPATS1Q496A3 300 aa16.13■□□□□ 0.17
ITGA3-202ENST00000320031 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
ITGA3-202ENST00000320031 PAQR9Q6ZVX9 377 aa16.13■□□□□ 0.17
ITGA3-202ENST00000320031 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa16.13■□□□□ 0.17
ITGA3-202ENST00000320031 TSPEARQ8WU66 669 aa16.13■□□□□ 0.17
ITGA3-202ENST00000320031 MRPS30Q9NP92 439 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
ITGA3-202ENST00000320031 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP16.13■□□□□ 0.17
ITGA3-202ENST00000320031 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
ITGA3-202ENST00000320031 TNFRSF11BO00300 401 aa16.13■□□□□ 0.17
ITGA3-202ENST00000320031 TGM5O43548 720 aa16.13■□□□□ 0.17
ITGA3-202ENST00000320031 OR6A2O95222 327 aa16.13■□□□□ 0.17
ITGA3-202ENST00000320031 MT-ND1P03886 318 aa16.13■□□□□ 0.17
ITGA3-202ENST00000320031 AGTRAPQ6RW13 159 aa16.13■□□□□ 0.17
ITGA3-202ENST00000320031 CHMP1BQ7LBR1 199 aa16.13■□□□□ 0.17
ITGA3-202ENST00000320031 FAM20CQ8IXL6 584 aa16.13■□□□□ 0.17
ITGA3-202ENST00000320031 GPR135Q8IZ08 494 aa16.13■□□□□ 0.17
ITGA3-202ENST00000320031 KLHDC9Q8NEP7 349 aa16.13■□□□□ 0.17
ITGA3-202ENST00000320031 TRPV1Q8NER1 839 aa16.13■□□□□ 0.17
ITGA3-202ENST00000320031 SMPDL3AQ92484 453 aa16.13■□□□□ 0.17
ITGA3-202ENST00000320031 PPP1R14BQ96C90 147 aa16.13■□□□□ 0.17
ITGA3-202ENST00000320031 CLDND1Q9NY35 253 aa16.13■□□□□ 0.17
ITGA3-202ENST00000320031 CALML5Q9NZT1 146 aa16.13■□□□□ 0.17
ITGA3-202ENST00000320031 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa16.13■□□□□ 0.17
ITGA3-202ENST00000320031 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP16.13■□□□□ 0.17
ITGA3-202ENST00000320031 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa16.12■□□□□ 0.17
ITGA3-202ENST00000320031 LEFTY1O75610 366 aa16.12■□□□□ 0.17
ITGA3-202ENST00000320031 FDXRP22570 491 aa16.12■□□□□ 0.17
ITGA3-202ENST00000320031 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP16.12■□□□□ 0.17
ITGA3-202ENST00000320031 STK19P49842 368 aaPredicted RBP16.12■□□□□ 0.17
ITGA3-202ENST00000320031 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP16.12■□□□□ 0.17
ITGA3-202ENST00000320031 SLC39A11Q8N1S5 342 aa16.12■□□□□ 0.17
ITGA3-202ENST00000320031 RNFT2Q96EX2 444 aa16.12■□□□□ 0.17
ITGA3-202ENST00000320031 MGME1Q9BQP7 344 aa16.12■□□□□ 0.17
ITGA3-202ENST00000320031 DNAJB9Q9UBS3 223 aa16.12■□□□□ 0.17
ITGA3-202ENST00000320031 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa16.12■□□□□ 0.17
ITGA3-202ENST00000320031 PDPK1O15530 556 aa16.12■□□□□ 0.17
ITGA3-202ENST00000320031 OR1I1O60431 355 aa16.12■□□□□ 0.17
ITGA3-202ENST00000320031 CYP4B1P13584 511 aa16.12■□□□□ 0.17
ITGA3-202ENST00000320031 BMPR1AP36894 532 aa16.12■□□□□ 0.17
ITGA3-202ENST00000320031 GDF5P43026 501 aa16.12■□□□□ 0.17
ITGA3-202ENST00000320031 ARSDP51689 593 aa16.12■□□□□ 0.17
ITGA3-202ENST00000320031 MAPK11Q15759 364 aa16.12■□□□□ 0.17
ITGA3-202ENST00000320031 SPANXN2Q5MJ10 180 aa16.12■□□□□ 0.17
ITGA3-202ENST00000320031 TRNP1Q6NT89 227 aa16.12■□□□□ 0.17
ITGA3-202ENST00000320031 NUDT13Q86X67 352 aa16.12■□□□□ 0.17
ITGA3-202ENST00000320031 AMER2Q8N7J2 671 aa16.12■□□□□ 0.17
ITGA3-202ENST00000320031 FIBINQ8TAL6 211 aa16.12■□□□□ 0.17
ITGA3-202ENST00000320031 EURLQ9NYK6 297 aa16.12■□□□□ 0.17
ITGA3-202ENST00000320031 H3BNX3 289 aa16.12■□□□□ 0.17
ITGA3-202ENST00000320031 NPPAP01160 153 aa16.12■□□□□ 0.17
ITGA3-202ENST00000320031 DSC3Q14574 896 aa16.12■□□□□ 0.17
ITGA3-202ENST00000320031 BNIPLQ7Z465 357 aa16.12■□□□□ 0.17
ITGA3-202ENST00000320031 GJD3Q8N144 294 aa16.12■□□□□ 0.17
ITGA3-202ENST00000320031 DRGXA6NNA5 263 aa16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.3 ms