Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP7

Gm3238, MCG61407, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3238W4VSP7 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 Gm12600-201ENSMUST00000146704 708 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 Gm43489-201ENSMUST00000196810 993 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 Olfr1295-201ENSMUST00000207283 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 Gm31409-201ENSMUST00000209894 710 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 mt-Nd2-201ENSMUST00000082396 1038 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Gm3238W4VSP7 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm3238W4VSP7 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm3238W4VSP7 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm3238W4VSP7 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm3238W4VSP7 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm3238W4VSP7 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm3238W4VSP7 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm3238W4VSP7 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm3238W4VSP7 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm3238W4VSP7 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm3238W4VSP7 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm3238W4VSP7 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm3238W4VSP7 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm3238W4VSP7 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm3238W4VSP7 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm3238W4VSP7 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm3238W4VSP7 Gm13033-201ENSMUST00000117591 1057 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm3238W4VSP7 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm3238W4VSP7 Esp15-201ENSMUST00000178929 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm3238W4VSP7 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm3238W4VSP7 Gm43084-201ENSMUST00000200696 947 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm3238W4VSP7 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm3238W4VSP7 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm3238W4VSP7 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm3238W4VSP7 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm3238W4VSP7 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm3238W4VSP7 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm3238W4VSP7 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm3238W4VSP7 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm3238W4VSP7 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm3238W4VSP7 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm3238W4VSP7 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm3238W4VSP7 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm3238W4VSP7 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm3238W4VSP7 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm3238W4VSP7 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm3238W4VSP7 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm3238W4VSP7 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm3238W4VSP7 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm3238W4VSP7 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm3238W4VSP7 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm3238W4VSP7 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm3238W4VSP7 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm3238W4VSP7 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm3238W4VSP7 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm3238W4VSP7 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm3238W4VSP7 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm3238W4VSP7 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm3238W4VSP7 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm3238W4VSP7 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms