Protein–RNA interactions for Protein: V9GX34

Csmd2, CUB and Sushi multiple domains 2, mousemouse

Predictions only

Length 3,611 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd2V9GX34 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Csmd2V9GX34 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Csmd2V9GX34 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Csmd2V9GX34 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Csmd2V9GX34 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Csmd2V9GX34 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Csmd2V9GX34 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Csmd2V9GX34 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Csmd2V9GX34 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Csmd2V9GX34 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Csmd2V9GX34 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Csmd2V9GX34 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Csmd2V9GX34 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Csmd2V9GX34 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Csmd2V9GX34 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Csmd2V9GX34 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Csmd2V9GX34 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Csmd2V9GX34 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Csmd2V9GX34 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Csmd2V9GX34 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Csmd2V9GX34 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Csmd2V9GX34 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Csmd2V9GX34 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Csmd2V9GX34 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Csmd2V9GX34 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Csmd2V9GX34 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Csmd2V9GX34 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Csmd2V9GX34 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Csmd2V9GX34 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Csmd2V9GX34 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Csmd2V9GX34 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Csmd2V9GX34 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Csmd2V9GX34 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Csmd2V9GX34 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Csmd2V9GX34 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Csmd2V9GX34 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Csmd2V9GX34 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Csmd2V9GX34 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Csmd2V9GX34 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Csmd2V9GX34 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Csmd2V9GX34 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Csmd2V9GX34 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Csmd2V9GX34 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Csmd2V9GX34 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Csmd2V9GX34 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Csmd2V9GX34 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Csmd2V9GX34 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Csmd2V9GX34 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Csmd2V9GX34 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Csmd2V9GX34 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Csmd2V9GX34 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Csmd2V9GX34 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Csmd2V9GX34 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Csmd2V9GX34 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Csmd2V9GX34 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Csmd2V9GX34 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Csmd2V9GX34 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Csmd2V9GX34 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Csmd2V9GX34 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Csmd2V9GX34 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Csmd2V9GX34 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Csmd2V9GX34 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Csmd2V9GX34 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Csmd2V9GX34 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Csmd2V9GX34 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Csmd2V9GX34 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Csmd2V9GX34 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Csmd2V9GX34 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Csmd2V9GX34 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Csmd2V9GX34 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Csmd2V9GX34 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Csmd2V9GX34 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Csmd2V9GX34 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Csmd2V9GX34 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Csmd2V9GX34 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Csmd2V9GX34 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Csmd2V9GX34 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Csmd2V9GX34 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Csmd2V9GX34 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Csmd2V9GX34 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Csmd2V9GX34 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Csmd2V9GX34 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Csmd2V9GX34 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Csmd2V9GX34 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Csmd2V9GX34 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Csmd2V9GX34 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Csmd2V9GX34 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Csmd2V9GX34 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Csmd2V9GX34 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Csmd2V9GX34 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Csmd2V9GX34 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Csmd2V9GX34 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Csmd2V9GX34 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Csmd2V9GX34 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Csmd2V9GX34 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Csmd2V9GX34 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Csmd2V9GX34 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Csmd2V9GX34 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Csmd2V9GX34 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Csmd2V9GX34 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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