Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z321

Top3b, DNA topoisomerase 3-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3bQ9Z321 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Top3bQ9Z321 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Top3bQ9Z321 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Top3bQ9Z321 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Top3bQ9Z321 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Top3bQ9Z321 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Top3bQ9Z321 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Top3bQ9Z321 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Top3bQ9Z321 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Top3bQ9Z321 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Top3bQ9Z321 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Top3bQ9Z321 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Top3bQ9Z321 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Top3bQ9Z321 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Top3bQ9Z321 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Top3bQ9Z321 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Top3bQ9Z321 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Top3bQ9Z321 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Top3bQ9Z321 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Top3bQ9Z321 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Top3bQ9Z321 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Top3bQ9Z321 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Top3bQ9Z321 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Top3bQ9Z321 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Top3bQ9Z321 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Top3bQ9Z321 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Top3bQ9Z321 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Top3bQ9Z321 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Top3bQ9Z321 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Top3bQ9Z321 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Top3bQ9Z321 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Top3bQ9Z321 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Top3bQ9Z321 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Top3bQ9Z321 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Top3bQ9Z321 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Top3bQ9Z321 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Top3bQ9Z321 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Top3bQ9Z321 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Top3bQ9Z321 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Top3bQ9Z321 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Top3bQ9Z321 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Top3bQ9Z321 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Top3bQ9Z321 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Top3bQ9Z321 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Top3bQ9Z321 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Top3bQ9Z321 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Top3bQ9Z321 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Top3bQ9Z321 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Top3bQ9Z321 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Top3bQ9Z321 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Top3bQ9Z321 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Top3bQ9Z321 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Top3bQ9Z321 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Top3bQ9Z321 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Top3bQ9Z321 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Top3bQ9Z321 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Top3bQ9Z321 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Top3bQ9Z321 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Top3bQ9Z321 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Top3bQ9Z321 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Top3bQ9Z321 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Top3bQ9Z321 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Top3bQ9Z321 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Top3bQ9Z321 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Top3bQ9Z321 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Top3bQ9Z321 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Top3bQ9Z321 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Top3bQ9Z321 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Top3bQ9Z321 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Top3bQ9Z321 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Top3bQ9Z321 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Top3bQ9Z321 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Top3bQ9Z321 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Top3bQ9Z321 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Top3bQ9Z321 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Top3bQ9Z321 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Top3bQ9Z321 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Top3bQ9Z321 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Top3bQ9Z321 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Top3bQ9Z321 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Top3bQ9Z321 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Top3bQ9Z321 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Top3bQ9Z321 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Top3bQ9Z321 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Top3bQ9Z321 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Top3bQ9Z321 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Top3bQ9Z321 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Top3bQ9Z321 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Top3bQ9Z321 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Top3bQ9Z321 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Top3bQ9Z321 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Top3bQ9Z321 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Top3bQ9Z321 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Top3bQ9Z321 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Top3bQ9Z321 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Top3bQ9Z321 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Top3bQ9Z321 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Top3bQ9Z321 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Top3bQ9Z321 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Top3bQ9Z321 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms