Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q5

Mrpl40, 39S ribosomal protein L40, mitochondrial, mousemouse

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Length 206 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl40Q9Z2Q5 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrpl40Q9Z2Q5 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrpl40Q9Z2Q5 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrpl40Q9Z2Q5 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrpl40Q9Z2Q5 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrpl40Q9Z2Q5 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrpl40Q9Z2Q5 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrpl40Q9Z2Q5 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrpl40Q9Z2Q5 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrpl40Q9Z2Q5 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrpl40Q9Z2Q5 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrpl40Q9Z2Q5 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrpl40Q9Z2Q5 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrpl40Q9Z2Q5 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrpl40Q9Z2Q5 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrpl40Q9Z2Q5 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrpl40Q9Z2Q5 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrpl40Q9Z2Q5 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrpl40Q9Z2Q5 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrpl40Q9Z2Q5 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrpl40Q9Z2Q5 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrpl40Q9Z2Q5 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrpl40Q9Z2Q5 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrpl40Q9Z2Q5 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrpl40Q9Z2Q5 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrpl40Q9Z2Q5 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrpl40Q9Z2Q5 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrpl40Q9Z2Q5 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrpl40Q9Z2Q5 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrpl40Q9Z2Q5 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrpl40Q9Z2Q5 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrpl40Q9Z2Q5 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrpl40Q9Z2Q5 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrpl40Q9Z2Q5 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrpl40Q9Z2Q5 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrpl40Q9Z2Q5 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrpl40Q9Z2Q5 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrpl40Q9Z2Q5 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrpl40Q9Z2Q5 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrpl40Q9Z2Q5 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrpl40Q9Z2Q5 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrpl40Q9Z2Q5 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrpl40Q9Z2Q5 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrpl40Q9Z2Q5 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrpl40Q9Z2Q5 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrpl40Q9Z2Q5 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrpl40Q9Z2Q5 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrpl40Q9Z2Q5 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrpl40Q9Z2Q5 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrpl40Q9Z2Q5 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrpl40Q9Z2Q5 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrpl40Q9Z2Q5 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Mrpl40Q9Z2Q5 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrpl40Q9Z2Q5 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrpl40Q9Z2Q5 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Mrpl40Q9Z2Q5 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrpl40Q9Z2Q5 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrpl40Q9Z2Q5 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrpl40Q9Z2Q5 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrpl40Q9Z2Q5 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrpl40Q9Z2Q5 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrpl40Q9Z2Q5 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrpl40Q9Z2Q5 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrpl40Q9Z2Q5 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrpl40Q9Z2Q5 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrpl40Q9Z2Q5 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrpl40Q9Z2Q5 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrpl40Q9Z2Q5 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrpl40Q9Z2Q5 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mrpl40Q9Z2Q5 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mrpl40Q9Z2Q5 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mrpl40Q9Z2Q5 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mrpl40Q9Z2Q5 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mrpl40Q9Z2Q5 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mrpl40Q9Z2Q5 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mrpl40Q9Z2Q5 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mrpl40Q9Z2Q5 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mrpl40Q9Z2Q5 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mrpl40Q9Z2Q5 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mrpl40Q9Z2Q5 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mrpl40Q9Z2Q5 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mrpl40Q9Z2Q5 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mrpl40Q9Z2Q5 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mrpl40Q9Z2Q5 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms