Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q2

Knop1, Lysine-rich nucleolar protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knop1Q9Z2Q2 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Knop1Q9Z2Q2 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Knop1Q9Z2Q2 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Knop1Q9Z2Q2 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Knop1Q9Z2Q2 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Knop1Q9Z2Q2 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Knop1Q9Z2Q2 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Knop1Q9Z2Q2 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Knop1Q9Z2Q2 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Knop1Q9Z2Q2 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Knop1Q9Z2Q2 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Knop1Q9Z2Q2 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Knop1Q9Z2Q2 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Knop1Q9Z2Q2 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Knop1Q9Z2Q2 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Knop1Q9Z2Q2 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Knop1Q9Z2Q2 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Knop1Q9Z2Q2 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Knop1Q9Z2Q2 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Knop1Q9Z2Q2 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Knop1Q9Z2Q2 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Knop1Q9Z2Q2 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Knop1Q9Z2Q2 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Knop1Q9Z2Q2 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Knop1Q9Z2Q2 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Knop1Q9Z2Q2 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Knop1Q9Z2Q2 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Knop1Q9Z2Q2 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Knop1Q9Z2Q2 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Knop1Q9Z2Q2 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Knop1Q9Z2Q2 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Knop1Q9Z2Q2 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Knop1Q9Z2Q2 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Knop1Q9Z2Q2 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Knop1Q9Z2Q2 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Knop1Q9Z2Q2 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Knop1Q9Z2Q2 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Knop1Q9Z2Q2 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Knop1Q9Z2Q2 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Knop1Q9Z2Q2 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Knop1Q9Z2Q2 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Knop1Q9Z2Q2 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Knop1Q9Z2Q2 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Knop1Q9Z2Q2 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Knop1Q9Z2Q2 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Knop1Q9Z2Q2 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Knop1Q9Z2Q2 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Knop1Q9Z2Q2 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Knop1Q9Z2Q2 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Knop1Q9Z2Q2 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Knop1Q9Z2Q2 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Knop1Q9Z2Q2 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Knop1Q9Z2Q2 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Knop1Q9Z2Q2 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Knop1Q9Z2Q2 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Knop1Q9Z2Q2 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Knop1Q9Z2Q2 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Knop1Q9Z2Q2 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Knop1Q9Z2Q2 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Knop1Q9Z2Q2 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Knop1Q9Z2Q2 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Knop1Q9Z2Q2 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Knop1Q9Z2Q2 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Knop1Q9Z2Q2 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Knop1Q9Z2Q2 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Knop1Q9Z2Q2 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Knop1Q9Z2Q2 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Knop1Q9Z2Q2 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Knop1Q9Z2Q2 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Knop1Q9Z2Q2 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Knop1Q9Z2Q2 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Knop1Q9Z2Q2 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Knop1Q9Z2Q2 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Knop1Q9Z2Q2 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Knop1Q9Z2Q2 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Knop1Q9Z2Q2 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Knop1Q9Z2Q2 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Knop1Q9Z2Q2 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Knop1Q9Z2Q2 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Knop1Q9Z2Q2 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Knop1Q9Z2Q2 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Knop1Q9Z2Q2 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Knop1Q9Z2Q2 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Knop1Q9Z2Q2 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Knop1Q9Z2Q2 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Knop1Q9Z2Q2 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Knop1Q9Z2Q2 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Knop1Q9Z2Q2 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Knop1Q9Z2Q2 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Knop1Q9Z2Q2 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Knop1Q9Z2Q2 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Knop1Q9Z2Q2 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Knop1Q9Z2Q2 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Knop1Q9Z2Q2 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Knop1Q9Z2Q2 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Knop1Q9Z2Q2 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Knop1Q9Z2Q2 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Knop1Q9Z2Q2 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Knop1Q9Z2Q2 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Knop1Q9Z2Q2 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms