Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2P8

Vamp5, Vesicle-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp5Q9Z2P8 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Vamp5Q9Z2P8 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Vamp5Q9Z2P8 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Vamp5Q9Z2P8 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Vamp5Q9Z2P8 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Vamp5Q9Z2P8 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Vamp5Q9Z2P8 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Vamp5Q9Z2P8 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Vamp5Q9Z2P8 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Vamp5Q9Z2P8 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Vamp5Q9Z2P8 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Vamp5Q9Z2P8 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Vamp5Q9Z2P8 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Vamp5Q9Z2P8 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Vamp5Q9Z2P8 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Vamp5Q9Z2P8 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Vamp5Q9Z2P8 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Vamp5Q9Z2P8 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Vamp5Q9Z2P8 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Vamp5Q9Z2P8 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Vamp5Q9Z2P8 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Vamp5Q9Z2P8 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Vamp5Q9Z2P8 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Vamp5Q9Z2P8 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Vamp5Q9Z2P8 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Vamp5Q9Z2P8 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Vamp5Q9Z2P8 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Vamp5Q9Z2P8 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Vamp5Q9Z2P8 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Vamp5Q9Z2P8 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Vamp5Q9Z2P8 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Vamp5Q9Z2P8 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Vamp5Q9Z2P8 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Vamp5Q9Z2P8 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Vamp5Q9Z2P8 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Vamp5Q9Z2P8 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Vamp5Q9Z2P8 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Vamp5Q9Z2P8 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Vamp5Q9Z2P8 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Vamp5Q9Z2P8 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Vamp5Q9Z2P8 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Vamp5Q9Z2P8 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Vamp5Q9Z2P8 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Vamp5Q9Z2P8 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Vamp5Q9Z2P8 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Vamp5Q9Z2P8 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Vamp5Q9Z2P8 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Vamp5Q9Z2P8 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Vamp5Q9Z2P8 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Vamp5Q9Z2P8 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Vamp5Q9Z2P8 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Vamp5Q9Z2P8 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Vamp5Q9Z2P8 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Vamp5Q9Z2P8 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Vamp5Q9Z2P8 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Vamp5Q9Z2P8 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Vamp5Q9Z2P8 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Vamp5Q9Z2P8 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Vamp5Q9Z2P8 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Vamp5Q9Z2P8 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Vamp5Q9Z2P8 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Vamp5Q9Z2P8 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Vamp5Q9Z2P8 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Vamp5Q9Z2P8 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Vamp5Q9Z2P8 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Vamp5Q9Z2P8 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Vamp5Q9Z2P8 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Vamp5Q9Z2P8 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Vamp5Q9Z2P8 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Vamp5Q9Z2P8 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Vamp5Q9Z2P8 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Vamp5Q9Z2P8 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Vamp5Q9Z2P8 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Vamp5Q9Z2P8 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Vamp5Q9Z2P8 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Vamp5Q9Z2P8 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Vamp5Q9Z2P8 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Vamp5Q9Z2P8 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Vamp5Q9Z2P8 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Vamp5Q9Z2P8 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Vamp5Q9Z2P8 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Vamp5Q9Z2P8 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Vamp5Q9Z2P8 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Vamp5Q9Z2P8 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vamp5Q9Z2P8 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vamp5Q9Z2P8 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vamp5Q9Z2P8 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vamp5Q9Z2P8 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vamp5Q9Z2P8 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vamp5Q9Z2P8 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vamp5Q9Z2P8 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vamp5Q9Z2P8 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vamp5Q9Z2P8 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vamp5Q9Z2P8 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vamp5Q9Z2P8 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vamp5Q9Z2P8 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vamp5Q9Z2P8 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vamp5Q9Z2P8 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vamp5Q9Z2P8 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vamp5Q9Z2P8 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms