Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z262

Cldn6, Claudin-6, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn6Q9Z262 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn6Q9Z262 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn6Q9Z262 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn6Q9Z262 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn6Q9Z262 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn6Q9Z262 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn6Q9Z262 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn6Q9Z262 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn6Q9Z262 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn6Q9Z262 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn6Q9Z262 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn6Q9Z262 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn6Q9Z262 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn6Q9Z262 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn6Q9Z262 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn6Q9Z262 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn6Q9Z262 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn6Q9Z262 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn6Q9Z262 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn6Q9Z262 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn6Q9Z262 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn6Q9Z262 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn6Q9Z262 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn6Q9Z262 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn6Q9Z262 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn6Q9Z262 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn6Q9Z262 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn6Q9Z262 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn6Q9Z262 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn6Q9Z262 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn6Q9Z262 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn6Q9Z262 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn6Q9Z262 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn6Q9Z262 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn6Q9Z262 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn6Q9Z262 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn6Q9Z262 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn6Q9Z262 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn6Q9Z262 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn6Q9Z262 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn6Q9Z262 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn6Q9Z262 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn6Q9Z262 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn6Q9Z262 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn6Q9Z262 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn6Q9Z262 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn6Q9Z262 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn6Q9Z262 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn6Q9Z262 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn6Q9Z262 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn6Q9Z262 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn6Q9Z262 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn6Q9Z262 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn6Q9Z262 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn6Q9Z262 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn6Q9Z262 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn6Q9Z262 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn6Q9Z262 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn6Q9Z262 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn6Q9Z262 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn6Q9Z262 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn6Q9Z262 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn6Q9Z262 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn6Q9Z262 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn6Q9Z262 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn6Q9Z262 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn6Q9Z262 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Cldn6Q9Z262 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn6Q9Z262 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn6Q9Z262 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn6Q9Z262 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn6Q9Z262 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn6Q9Z262 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn6Q9Z262 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn6Q9Z262 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn6Q9Z262 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn6Q9Z262 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn6Q9Z262 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn6Q9Z262 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn6Q9Z262 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn6Q9Z262 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn6Q9Z262 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn6Q9Z262 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn6Q9Z262 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn6Q9Z262 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn6Q9Z262 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn6Q9Z262 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn6Q9Z262 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn6Q9Z262 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn6Q9Z262 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn6Q9Z262 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn6Q9Z262 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn6Q9Z262 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn6Q9Z262 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn6Q9Z262 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn6Q9Z262 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn6Q9Z262 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn6Q9Z262 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn6Q9Z262 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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