Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1X4

Ilf3, Interleukin enhancer-binding factor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ilf3Q9Z1X4 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ilf3Q9Z1X4 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ilf3Q9Z1X4 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ilf3Q9Z1X4 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ilf3Q9Z1X4 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ilf3Q9Z1X4 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ilf3Q9Z1X4 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ilf3Q9Z1X4 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ilf3Q9Z1X4 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ilf3Q9Z1X4 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ilf3Q9Z1X4 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ilf3Q9Z1X4 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ilf3Q9Z1X4 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ilf3Q9Z1X4 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ilf3Q9Z1X4 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ilf3Q9Z1X4 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ilf3Q9Z1X4 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ilf3Q9Z1X4 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ilf3Q9Z1X4 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ilf3Q9Z1X4 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ilf3Q9Z1X4 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ilf3Q9Z1X4 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ilf3Q9Z1X4 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ilf3Q9Z1X4 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ilf3Q9Z1X4 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ilf3Q9Z1X4 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ilf3Q9Z1X4 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ilf3Q9Z1X4 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ilf3Q9Z1X4 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ilf3Q9Z1X4 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ilf3Q9Z1X4 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ilf3Q9Z1X4 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ilf3Q9Z1X4 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ilf3Q9Z1X4 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ilf3Q9Z1X4 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ilf3Q9Z1X4 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ilf3Q9Z1X4 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ilf3Q9Z1X4 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ilf3Q9Z1X4 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ilf3Q9Z1X4 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ilf3Q9Z1X4 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ilf3Q9Z1X4 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ilf3Q9Z1X4 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ilf3Q9Z1X4 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ilf3Q9Z1X4 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ilf3Q9Z1X4 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ilf3Q9Z1X4 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ilf3Q9Z1X4 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ilf3Q9Z1X4 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ilf3Q9Z1X4 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ilf3Q9Z1X4 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ilf3Q9Z1X4 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ilf3Q9Z1X4 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ilf3Q9Z1X4 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ilf3Q9Z1X4 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ilf3Q9Z1X4 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ilf3Q9Z1X4 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ilf3Q9Z1X4 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ilf3Q9Z1X4 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ilf3Q9Z1X4 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ilf3Q9Z1X4 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ilf3Q9Z1X4 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ilf3Q9Z1X4 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ilf3Q9Z1X4 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ilf3Q9Z1X4 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ilf3Q9Z1X4 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ilf3Q9Z1X4 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ilf3Q9Z1X4 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ilf3Q9Z1X4 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ilf3Q9Z1X4 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ilf3Q9Z1X4 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ilf3Q9Z1X4 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ilf3Q9Z1X4 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ilf3Q9Z1X4 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ilf3Q9Z1X4 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ilf3Q9Z1X4 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ilf3Q9Z1X4 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ilf3Q9Z1X4 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ilf3Q9Z1X4 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ilf3Q9Z1X4 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ilf3Q9Z1X4 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ilf3Q9Z1X4 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ilf3Q9Z1X4 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ilf3Q9Z1X4 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ilf3Q9Z1X4 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ilf3Q9Z1X4 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ilf3Q9Z1X4 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ilf3Q9Z1X4 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ilf3Q9Z1X4 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ilf3Q9Z1X4 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ilf3Q9Z1X4 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ilf3Q9Z1X4 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ilf3Q9Z1X4 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ilf3Q9Z1X4 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ilf3Q9Z1X4 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ilf3Q9Z1X4 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ilf3Q9Z1X4 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ilf3Q9Z1X4 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ilf3Q9Z1X4 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ilf3Q9Z1X4 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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