Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1N6

Sfrp4, Secreted frizzled-related sequence protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfrp4Q9Z1N6 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sfrp4Q9Z1N6 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sfrp4Q9Z1N6 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sfrp4Q9Z1N6 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sfrp4Q9Z1N6 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sfrp4Q9Z1N6 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sfrp4Q9Z1N6 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sfrp4Q9Z1N6 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sfrp4Q9Z1N6 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sfrp4Q9Z1N6 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sfrp4Q9Z1N6 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sfrp4Q9Z1N6 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sfrp4Q9Z1N6 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sfrp4Q9Z1N6 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sfrp4Q9Z1N6 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sfrp4Q9Z1N6 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sfrp4Q9Z1N6 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sfrp4Q9Z1N6 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sfrp4Q9Z1N6 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sfrp4Q9Z1N6 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sfrp4Q9Z1N6 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sfrp4Q9Z1N6 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sfrp4Q9Z1N6 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sfrp4Q9Z1N6 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sfrp4Q9Z1N6 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sfrp4Q9Z1N6 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sfrp4Q9Z1N6 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sfrp4Q9Z1N6 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Sfrp4Q9Z1N6 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Sfrp4Q9Z1N6 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sfrp4Q9Z1N6 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sfrp4Q9Z1N6 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sfrp4Q9Z1N6 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sfrp4Q9Z1N6 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sfrp4Q9Z1N6 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sfrp4Q9Z1N6 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sfrp4Q9Z1N6 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sfrp4Q9Z1N6 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sfrp4Q9Z1N6 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sfrp4Q9Z1N6 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sfrp4Q9Z1N6 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sfrp4Q9Z1N6 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sfrp4Q9Z1N6 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sfrp4Q9Z1N6 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sfrp4Q9Z1N6 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sfrp4Q9Z1N6 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sfrp4Q9Z1N6 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sfrp4Q9Z1N6 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sfrp4Q9Z1N6 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sfrp4Q9Z1N6 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sfrp4Q9Z1N6 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sfrp4Q9Z1N6 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sfrp4Q9Z1N6 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sfrp4Q9Z1N6 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sfrp4Q9Z1N6 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sfrp4Q9Z1N6 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Sfrp4Q9Z1N6 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sfrp4Q9Z1N6 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sfrp4Q9Z1N6 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sfrp4Q9Z1N6 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sfrp4Q9Z1N6 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sfrp4Q9Z1N6 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sfrp4Q9Z1N6 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sfrp4Q9Z1N6 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sfrp4Q9Z1N6 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Sfrp4Q9Z1N6 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sfrp4Q9Z1N6 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sfrp4Q9Z1N6 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sfrp4Q9Z1N6 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sfrp4Q9Z1N6 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sfrp4Q9Z1N6 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sfrp4Q9Z1N6 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sfrp4Q9Z1N6 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Sfrp4Q9Z1N6 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sfrp4Q9Z1N6 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sfrp4Q9Z1N6 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sfrp4Q9Z1N6 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sfrp4Q9Z1N6 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sfrp4Q9Z1N6 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sfrp4Q9Z1N6 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sfrp4Q9Z1N6 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sfrp4Q9Z1N6 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sfrp4Q9Z1N6 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sfrp4Q9Z1N6 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sfrp4Q9Z1N6 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sfrp4Q9Z1N6 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sfrp4Q9Z1N6 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sfrp4Q9Z1N6 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sfrp4Q9Z1N6 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sfrp4Q9Z1N6 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sfrp4Q9Z1N6 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sfrp4Q9Z1N6 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sfrp4Q9Z1N6 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sfrp4Q9Z1N6 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Sfrp4Q9Z1N6 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sfrp4Q9Z1N6 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sfrp4Q9Z1N6 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Sfrp4Q9Z1N6 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sfrp4Q9Z1N6 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sfrp4Q9Z1N6 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms