Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1L5

Cacna2d3, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d3Q9Z1L5 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cacna2d3Q9Z1L5 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cacna2d3Q9Z1L5 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cacna2d3Q9Z1L5 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cacna2d3Q9Z1L5 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cacna2d3Q9Z1L5 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cacna2d3Q9Z1L5 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cacna2d3Q9Z1L5 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacna2d3Q9Z1L5 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacna2d3Q9Z1L5 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacna2d3Q9Z1L5 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacna2d3Q9Z1L5 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacna2d3Q9Z1L5 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacna2d3Q9Z1L5 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacna2d3Q9Z1L5 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacna2d3Q9Z1L5 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacna2d3Q9Z1L5 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacna2d3Q9Z1L5 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacna2d3Q9Z1L5 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacna2d3Q9Z1L5 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacna2d3Q9Z1L5 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacna2d3Q9Z1L5 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacna2d3Q9Z1L5 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacna2d3Q9Z1L5 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cacna2d3Q9Z1L5 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cacna2d3Q9Z1L5 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cacna2d3Q9Z1L5 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cacna2d3Q9Z1L5 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Cacna2d3Q9Z1L5 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cacna2d3Q9Z1L5 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Cacna2d3Q9Z1L5 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cacna2d3Q9Z1L5 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cacna2d3Q9Z1L5 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cacna2d3Q9Z1L5 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cacna2d3Q9Z1L5 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cacna2d3Q9Z1L5 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cacna2d3Q9Z1L5 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cacna2d3Q9Z1L5 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cacna2d3Q9Z1L5 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacna2d3Q9Z1L5 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacna2d3Q9Z1L5 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacna2d3Q9Z1L5 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacna2d3Q9Z1L5 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacna2d3Q9Z1L5 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacna2d3Q9Z1L5 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacna2d3Q9Z1L5 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacna2d3Q9Z1L5 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacna2d3Q9Z1L5 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacna2d3Q9Z1L5 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacna2d3Q9Z1L5 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacna2d3Q9Z1L5 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacna2d3Q9Z1L5 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacna2d3Q9Z1L5 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacna2d3Q9Z1L5 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacna2d3Q9Z1L5 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacna2d3Q9Z1L5 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacna2d3Q9Z1L5 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacna2d3Q9Z1L5 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacna2d3Q9Z1L5 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacna2d3Q9Z1L5 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacna2d3Q9Z1L5 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacna2d3Q9Z1L5 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacna2d3Q9Z1L5 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacna2d3Q9Z1L5 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacna2d3Q9Z1L5 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cacna2d3Q9Z1L5 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cacna2d3Q9Z1L5 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cacna2d3Q9Z1L5 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cacna2d3Q9Z1L5 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cacna2d3Q9Z1L5 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cacna2d3Q9Z1L5 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cacna2d3Q9Z1L5 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cacna2d3Q9Z1L5 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cacna2d3Q9Z1L5 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cacna2d3Q9Z1L5 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cacna2d3Q9Z1L5 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cacna2d3Q9Z1L5 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cacna2d3Q9Z1L5 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cacna2d3Q9Z1L5 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cacna2d3Q9Z1L5 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cacna2d3Q9Z1L5 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cacna2d3Q9Z1L5 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cacna2d3Q9Z1L5 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cacna2d3Q9Z1L5 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cacna2d3Q9Z1L5 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cacna2d3Q9Z1L5 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cacna2d3Q9Z1L5 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cacna2d3Q9Z1L5 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cacna2d3Q9Z1L5 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cacna2d3Q9Z1L5 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cacna2d3Q9Z1L5 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms