Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1E3

Nfkbia, NF-kappa-B inhibitor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfkbiaQ9Z1E3 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NfkbiaQ9Z1E3 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NfkbiaQ9Z1E3 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NfkbiaQ9Z1E3 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NfkbiaQ9Z1E3 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
NfkbiaQ9Z1E3 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NfkbiaQ9Z1E3 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NfkbiaQ9Z1E3 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NfkbiaQ9Z1E3 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NfkbiaQ9Z1E3 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
NfkbiaQ9Z1E3 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NfkbiaQ9Z1E3 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NfkbiaQ9Z1E3 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NfkbiaQ9Z1E3 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NfkbiaQ9Z1E3 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
NfkbiaQ9Z1E3 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NfkbiaQ9Z1E3 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NfkbiaQ9Z1E3 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NfkbiaQ9Z1E3 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NfkbiaQ9Z1E3 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NfkbiaQ9Z1E3 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NfkbiaQ9Z1E3 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NfkbiaQ9Z1E3 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NfkbiaQ9Z1E3 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NfkbiaQ9Z1E3 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NfkbiaQ9Z1E3 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NfkbiaQ9Z1E3 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NfkbiaQ9Z1E3 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NfkbiaQ9Z1E3 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NfkbiaQ9Z1E3 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NfkbiaQ9Z1E3 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NfkbiaQ9Z1E3 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NfkbiaQ9Z1E3 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NfkbiaQ9Z1E3 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NfkbiaQ9Z1E3 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NfkbiaQ9Z1E3 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NfkbiaQ9Z1E3 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NfkbiaQ9Z1E3 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NfkbiaQ9Z1E3 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NfkbiaQ9Z1E3 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NfkbiaQ9Z1E3 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NfkbiaQ9Z1E3 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NfkbiaQ9Z1E3 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NfkbiaQ9Z1E3 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NfkbiaQ9Z1E3 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NfkbiaQ9Z1E3 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NfkbiaQ9Z1E3 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NfkbiaQ9Z1E3 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NfkbiaQ9Z1E3 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NfkbiaQ9Z1E3 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
NfkbiaQ9Z1E3 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NfkbiaQ9Z1E3 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NfkbiaQ9Z1E3 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NfkbiaQ9Z1E3 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NfkbiaQ9Z1E3 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NfkbiaQ9Z1E3 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NfkbiaQ9Z1E3 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NfkbiaQ9Z1E3 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NfkbiaQ9Z1E3 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NfkbiaQ9Z1E3 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NfkbiaQ9Z1E3 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NfkbiaQ9Z1E3 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NfkbiaQ9Z1E3 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NfkbiaQ9Z1E3 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NfkbiaQ9Z1E3 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NfkbiaQ9Z1E3 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NfkbiaQ9Z1E3 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NfkbiaQ9Z1E3 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NfkbiaQ9Z1E3 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NfkbiaQ9Z1E3 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NfkbiaQ9Z1E3 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NfkbiaQ9Z1E3 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NfkbiaQ9Z1E3 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NfkbiaQ9Z1E3 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NfkbiaQ9Z1E3 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NfkbiaQ9Z1E3 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NfkbiaQ9Z1E3 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NfkbiaQ9Z1E3 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NfkbiaQ9Z1E3 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NfkbiaQ9Z1E3 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NfkbiaQ9Z1E3 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NfkbiaQ9Z1E3 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NfkbiaQ9Z1E3 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NfkbiaQ9Z1E3 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NfkbiaQ9Z1E3 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NfkbiaQ9Z1E3 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NfkbiaQ9Z1E3 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NfkbiaQ9Z1E3 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NfkbiaQ9Z1E3 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NfkbiaQ9Z1E3 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NfkbiaQ9Z1E3 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NfkbiaQ9Z1E3 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NfkbiaQ9Z1E3 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NfkbiaQ9Z1E3 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NfkbiaQ9Z1E3 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NfkbiaQ9Z1E3 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NfkbiaQ9Z1E3 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NfkbiaQ9Z1E3 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NfkbiaQ9Z1E3 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NfkbiaQ9Z1E3 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms