Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1B8

Phf1, PHD finger protein 1, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf1Q9Z1B8 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Phf1Q9Z1B8 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Phf1Q9Z1B8 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Phf1Q9Z1B8 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Phf1Q9Z1B8 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Phf1Q9Z1B8 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Phf1Q9Z1B8 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Phf1Q9Z1B8 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Phf1Q9Z1B8 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Phf1Q9Z1B8 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Phf1Q9Z1B8 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Phf1Q9Z1B8 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Phf1Q9Z1B8 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Phf1Q9Z1B8 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Phf1Q9Z1B8 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Phf1Q9Z1B8 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Phf1Q9Z1B8 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Phf1Q9Z1B8 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Phf1Q9Z1B8 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Phf1Q9Z1B8 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Phf1Q9Z1B8 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Phf1Q9Z1B8 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Phf1Q9Z1B8 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phf1Q9Z1B8 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phf1Q9Z1B8 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phf1Q9Z1B8 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phf1Q9Z1B8 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phf1Q9Z1B8 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phf1Q9Z1B8 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phf1Q9Z1B8 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Phf1Q9Z1B8 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phf1Q9Z1B8 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phf1Q9Z1B8 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phf1Q9Z1B8 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phf1Q9Z1B8 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phf1Q9Z1B8 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phf1Q9Z1B8 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phf1Q9Z1B8 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phf1Q9Z1B8 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phf1Q9Z1B8 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phf1Q9Z1B8 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phf1Q9Z1B8 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phf1Q9Z1B8 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phf1Q9Z1B8 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phf1Q9Z1B8 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phf1Q9Z1B8 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phf1Q9Z1B8 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phf1Q9Z1B8 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phf1Q9Z1B8 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phf1Q9Z1B8 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phf1Q9Z1B8 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phf1Q9Z1B8 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phf1Q9Z1B8 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phf1Q9Z1B8 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phf1Q9Z1B8 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phf1Q9Z1B8 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phf1Q9Z1B8 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phf1Q9Z1B8 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Phf1Q9Z1B8 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phf1Q9Z1B8 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Phf1Q9Z1B8 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phf1Q9Z1B8 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phf1Q9Z1B8 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phf1Q9Z1B8 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phf1Q9Z1B8 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phf1Q9Z1B8 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phf1Q9Z1B8 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phf1Q9Z1B8 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phf1Q9Z1B8 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phf1Q9Z1B8 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phf1Q9Z1B8 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phf1Q9Z1B8 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Phf1Q9Z1B8 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Phf1Q9Z1B8 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Phf1Q9Z1B8 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Phf1Q9Z1B8 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Phf1Q9Z1B8 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Phf1Q9Z1B8 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Phf1Q9Z1B8 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Phf1Q9Z1B8 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Phf1Q9Z1B8 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Phf1Q9Z1B8 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Phf1Q9Z1B8 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Phf1Q9Z1B8 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Phf1Q9Z1B8 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Phf1Q9Z1B8 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Phf1Q9Z1B8 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Phf1Q9Z1B8 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Phf1Q9Z1B8 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Phf1Q9Z1B8 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Phf1Q9Z1B8 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Phf1Q9Z1B8 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Phf1Q9Z1B8 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Phf1Q9Z1B8 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Phf1Q9Z1B8 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Phf1Q9Z1B8 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Phf1Q9Z1B8 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Phf1Q9Z1B8 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Phf1Q9Z1B8 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Phf1Q9Z1B8 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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