Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z140

Cpne6, Copine-6, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne6Q9Z140 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpne6Q9Z140 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpne6Q9Z140 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpne6Q9Z140 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpne6Q9Z140 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpne6Q9Z140 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpne6Q9Z140 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpne6Q9Z140 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpne6Q9Z140 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpne6Q9Z140 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpne6Q9Z140 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpne6Q9Z140 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpne6Q9Z140 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpne6Q9Z140 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpne6Q9Z140 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpne6Q9Z140 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpne6Q9Z140 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpne6Q9Z140 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpne6Q9Z140 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpne6Q9Z140 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpne6Q9Z140 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpne6Q9Z140 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpne6Q9Z140 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpne6Q9Z140 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpne6Q9Z140 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpne6Q9Z140 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpne6Q9Z140 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpne6Q9Z140 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpne6Q9Z140 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpne6Q9Z140 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpne6Q9Z140 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpne6Q9Z140 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpne6Q9Z140 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpne6Q9Z140 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpne6Q9Z140 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpne6Q9Z140 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpne6Q9Z140 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpne6Q9Z140 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpne6Q9Z140 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpne6Q9Z140 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpne6Q9Z140 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpne6Q9Z140 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpne6Q9Z140 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpne6Q9Z140 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpne6Q9Z140 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpne6Q9Z140 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpne6Q9Z140 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpne6Q9Z140 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpne6Q9Z140 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpne6Q9Z140 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cpne6Q9Z140 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cpne6Q9Z140 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cpne6Q9Z140 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpne6Q9Z140 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpne6Q9Z140 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpne6Q9Z140 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpne6Q9Z140 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpne6Q9Z140 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpne6Q9Z140 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpne6Q9Z140 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpne6Q9Z140 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpne6Q9Z140 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpne6Q9Z140 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpne6Q9Z140 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpne6Q9Z140 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpne6Q9Z140 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpne6Q9Z140 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpne6Q9Z140 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpne6Q9Z140 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpne6Q9Z140 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpne6Q9Z140 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpne6Q9Z140 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpne6Q9Z140 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpne6Q9Z140 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpne6Q9Z140 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpne6Q9Z140 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpne6Q9Z140 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpne6Q9Z140 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpne6Q9Z140 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpne6Q9Z140 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpne6Q9Z140 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpne6Q9Z140 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpne6Q9Z140 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpne6Q9Z140 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpne6Q9Z140 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpne6Q9Z140 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpne6Q9Z140 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpne6Q9Z140 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpne6Q9Z140 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpne6Q9Z140 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpne6Q9Z140 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpne6Q9Z140 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpne6Q9Z140 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpne6Q9Z140 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpne6Q9Z140 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpne6Q9Z140 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpne6Q9Z140 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpne6Q9Z140 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpne6Q9Z140 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpne6Q9Z140 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms