Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0W3

Nup160, Nuclear pore complex protein Nup160, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup160Q9Z0W3 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nup160Q9Z0W3 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nup160Q9Z0W3 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nup160Q9Z0W3 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nup160Q9Z0W3 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nup160Q9Z0W3 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nup160Q9Z0W3 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nup160Q9Z0W3 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nup160Q9Z0W3 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nup160Q9Z0W3 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nup160Q9Z0W3 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nup160Q9Z0W3 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nup160Q9Z0W3 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nup160Q9Z0W3 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nup160Q9Z0W3 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nup160Q9Z0W3 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nup160Q9Z0W3 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nup160Q9Z0W3 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nup160Q9Z0W3 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nup160Q9Z0W3 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nup160Q9Z0W3 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nup160Q9Z0W3 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nup160Q9Z0W3 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nup160Q9Z0W3 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nup160Q9Z0W3 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Nup160Q9Z0W3 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Nup160Q9Z0W3 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Nup160Q9Z0W3 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nup160Q9Z0W3 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nup160Q9Z0W3 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nup160Q9Z0W3 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Nup160Q9Z0W3 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nup160Q9Z0W3 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Nup160Q9Z0W3 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Nup160Q9Z0W3 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Nup160Q9Z0W3 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Nup160Q9Z0W3 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Nup160Q9Z0W3 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Nup160Q9Z0W3 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Nup160Q9Z0W3 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Nup160Q9Z0W3 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Nup160Q9Z0W3 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Nup160Q9Z0W3 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Nup160Q9Z0W3 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Nup160Q9Z0W3 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Nup160Q9Z0W3 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Nup160Q9Z0W3 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Nup160Q9Z0W3 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Nup160Q9Z0W3 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Nup160Q9Z0W3 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nup160Q9Z0W3 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nup160Q9Z0W3 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nup160Q9Z0W3 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nup160Q9Z0W3 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nup160Q9Z0W3 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nup160Q9Z0W3 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nup160Q9Z0W3 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Nup160Q9Z0W3 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Nup160Q9Z0W3 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nup160Q9Z0W3 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nup160Q9Z0W3 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nup160Q9Z0W3 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nup160Q9Z0W3 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nup160Q9Z0W3 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Nup160Q9Z0W3 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nup160Q9Z0W3 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nup160Q9Z0W3 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nup160Q9Z0W3 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nup160Q9Z0W3 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nup160Q9Z0W3 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Nup160Q9Z0W3 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Nup160Q9Z0W3 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nup160Q9Z0W3 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nup160Q9Z0W3 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nup160Q9Z0W3 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nup160Q9Z0W3 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nup160Q9Z0W3 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nup160Q9Z0W3 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Nup160Q9Z0W3 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nup160Q9Z0W3 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nup160Q9Z0W3 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nup160Q9Z0W3 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nup160Q9Z0W3 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nup160Q9Z0W3 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nup160Q9Z0W3 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nup160Q9Z0W3 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Nup160Q9Z0W3 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nup160Q9Z0W3 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nup160Q9Z0W3 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nup160Q9Z0W3 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nup160Q9Z0W3 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nup160Q9Z0W3 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nup160Q9Z0W3 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Nup160Q9Z0W3 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nup160Q9Z0W3 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nup160Q9Z0W3 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nup160Q9Z0W3 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nup160Q9Z0W3 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nup160Q9Z0W3 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nup160Q9Z0W3 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms