Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0W1

Ngfr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NgfrQ9Z0W1 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
NgfrQ9Z0W1 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NgfrQ9Z0W1 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NgfrQ9Z0W1 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NgfrQ9Z0W1 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
NgfrQ9Z0W1 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NgfrQ9Z0W1 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NgfrQ9Z0W1 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NgfrQ9Z0W1 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NgfrQ9Z0W1 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
NgfrQ9Z0W1 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
NgfrQ9Z0W1 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
NgfrQ9Z0W1 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
NgfrQ9Z0W1 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
NgfrQ9Z0W1 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
NgfrQ9Z0W1 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
NgfrQ9Z0W1 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
NgfrQ9Z0W1 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
NgfrQ9Z0W1 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
NgfrQ9Z0W1 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
NgfrQ9Z0W1 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
NgfrQ9Z0W1 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
NgfrQ9Z0W1 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
NgfrQ9Z0W1 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
NgfrQ9Z0W1 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
NgfrQ9Z0W1 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
NgfrQ9Z0W1 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
NgfrQ9Z0W1 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
NgfrQ9Z0W1 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
NgfrQ9Z0W1 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
NgfrQ9Z0W1 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
NgfrQ9Z0W1 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
NgfrQ9Z0W1 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
NgfrQ9Z0W1 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
NgfrQ9Z0W1 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
NgfrQ9Z0W1 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
NgfrQ9Z0W1 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
NgfrQ9Z0W1 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
NgfrQ9Z0W1 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NgfrQ9Z0W1 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NgfrQ9Z0W1 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NgfrQ9Z0W1 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
NgfrQ9Z0W1 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NgfrQ9Z0W1 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NgfrQ9Z0W1 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
NgfrQ9Z0W1 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
NgfrQ9Z0W1 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NgfrQ9Z0W1 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NgfrQ9Z0W1 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NgfrQ9Z0W1 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NgfrQ9Z0W1 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NgfrQ9Z0W1 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
NgfrQ9Z0W1 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
NgfrQ9Z0W1 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
NgfrQ9Z0W1 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
NgfrQ9Z0W1 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
NgfrQ9Z0W1 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
NgfrQ9Z0W1 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NgfrQ9Z0W1 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NgfrQ9Z0W1 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
NgfrQ9Z0W1 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
NgfrQ9Z0W1 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
NgfrQ9Z0W1 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
NgfrQ9Z0W1 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
NgfrQ9Z0W1 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
NgfrQ9Z0W1 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
NgfrQ9Z0W1 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
NgfrQ9Z0W1 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
NgfrQ9Z0W1 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
NgfrQ9Z0W1 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
NgfrQ9Z0W1 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
NgfrQ9Z0W1 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
NgfrQ9Z0W1 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
NgfrQ9Z0W1 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
NgfrQ9Z0W1 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NgfrQ9Z0W1 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
NgfrQ9Z0W1 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
NgfrQ9Z0W1 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
NgfrQ9Z0W1 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
NgfrQ9Z0W1 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
NgfrQ9Z0W1 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NgfrQ9Z0W1 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NgfrQ9Z0W1 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NgfrQ9Z0W1 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NgfrQ9Z0W1 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NgfrQ9Z0W1 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NgfrQ9Z0W1 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
NgfrQ9Z0W1 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NgfrQ9Z0W1 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NgfrQ9Z0W1 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NgfrQ9Z0W1 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
NgfrQ9Z0W1 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NgfrQ9Z0W1 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NgfrQ9Z0W1 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NgfrQ9Z0W1 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NgfrQ9Z0W1 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NgfrQ9Z0W1 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NgfrQ9Z0W1 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NgfrQ9Z0W1 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
NgfrQ9Z0W1 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms