Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0G9

Cldn3, Claudin-3, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn3Q9Z0G9 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn3Q9Z0G9 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn3Q9Z0G9 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn3Q9Z0G9 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn3Q9Z0G9 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn3Q9Z0G9 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn3Q9Z0G9 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn3Q9Z0G9 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn3Q9Z0G9 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn3Q9Z0G9 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn3Q9Z0G9 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn3Q9Z0G9 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn3Q9Z0G9 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn3Q9Z0G9 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn3Q9Z0G9 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn3Q9Z0G9 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn3Q9Z0G9 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn3Q9Z0G9 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn3Q9Z0G9 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn3Q9Z0G9 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn3Q9Z0G9 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn3Q9Z0G9 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn3Q9Z0G9 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn3Q9Z0G9 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn3Q9Z0G9 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn3Q9Z0G9 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn3Q9Z0G9 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn3Q9Z0G9 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn3Q9Z0G9 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn3Q9Z0G9 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn3Q9Z0G9 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn3Q9Z0G9 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn3Q9Z0G9 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn3Q9Z0G9 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn3Q9Z0G9 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn3Q9Z0G9 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn3Q9Z0G9 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn3Q9Z0G9 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn3Q9Z0G9 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn3Q9Z0G9 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn3Q9Z0G9 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn3Q9Z0G9 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn3Q9Z0G9 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn3Q9Z0G9 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn3Q9Z0G9 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn3Q9Z0G9 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn3Q9Z0G9 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn3Q9Z0G9 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn3Q9Z0G9 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn3Q9Z0G9 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn3Q9Z0G9 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn3Q9Z0G9 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn3Q9Z0G9 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn3Q9Z0G9 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn3Q9Z0G9 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn3Q9Z0G9 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn3Q9Z0G9 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn3Q9Z0G9 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn3Q9Z0G9 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn3Q9Z0G9 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn3Q9Z0G9 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn3Q9Z0G9 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn3Q9Z0G9 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn3Q9Z0G9 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn3Q9Z0G9 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn3Q9Z0G9 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn3Q9Z0G9 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn3Q9Z0G9 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn3Q9Z0G9 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn3Q9Z0G9 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn3Q9Z0G9 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn3Q9Z0G9 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn3Q9Z0G9 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn3Q9Z0G9 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn3Q9Z0G9 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn3Q9Z0G9 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn3Q9Z0G9 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn3Q9Z0G9 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn3Q9Z0G9 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn3Q9Z0G9 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn3Q9Z0G9 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn3Q9Z0G9 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn3Q9Z0G9 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn3Q9Z0G9 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn3Q9Z0G9 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn3Q9Z0G9 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn3Q9Z0G9 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn3Q9Z0G9 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn3Q9Z0G9 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn3Q9Z0G9 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn3Q9Z0G9 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn3Q9Z0G9 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn3Q9Z0G9 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn3Q9Z0G9 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn3Q9Z0G9 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn3Q9Z0G9 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn3Q9Z0G9 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn3Q9Z0G9 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn3Q9Z0G9 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn3Q9Z0G9 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms