Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVP6

Papolb, Poly(A) polymerase beta, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PapolbQ9WVP6 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PapolbQ9WVP6 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PapolbQ9WVP6 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PapolbQ9WVP6 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PapolbQ9WVP6 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PapolbQ9WVP6 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PapolbQ9WVP6 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PapolbQ9WVP6 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PapolbQ9WVP6 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PapolbQ9WVP6 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PapolbQ9WVP6 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PapolbQ9WVP6 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PapolbQ9WVP6 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PapolbQ9WVP6 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PapolbQ9WVP6 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PapolbQ9WVP6 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PapolbQ9WVP6 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PapolbQ9WVP6 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PapolbQ9WVP6 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PapolbQ9WVP6 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PapolbQ9WVP6 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PapolbQ9WVP6 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PapolbQ9WVP6 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PapolbQ9WVP6 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PapolbQ9WVP6 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PapolbQ9WVP6 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PapolbQ9WVP6 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PapolbQ9WVP6 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PapolbQ9WVP6 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PapolbQ9WVP6 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PapolbQ9WVP6 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PapolbQ9WVP6 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PapolbQ9WVP6 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PapolbQ9WVP6 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PapolbQ9WVP6 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PapolbQ9WVP6 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PapolbQ9WVP6 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PapolbQ9WVP6 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PapolbQ9WVP6 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PapolbQ9WVP6 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PapolbQ9WVP6 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PapolbQ9WVP6 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PapolbQ9WVP6 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PapolbQ9WVP6 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PapolbQ9WVP6 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PapolbQ9WVP6 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PapolbQ9WVP6 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PapolbQ9WVP6 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PapolbQ9WVP6 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PapolbQ9WVP6 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PapolbQ9WVP6 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PapolbQ9WVP6 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PapolbQ9WVP6 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PapolbQ9WVP6 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PapolbQ9WVP6 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PapolbQ9WVP6 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PapolbQ9WVP6 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PapolbQ9WVP6 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PapolbQ9WVP6 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PapolbQ9WVP6 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PapolbQ9WVP6 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PapolbQ9WVP6 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PapolbQ9WVP6 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PapolbQ9WVP6 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PapolbQ9WVP6 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PapolbQ9WVP6 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PapolbQ9WVP6 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PapolbQ9WVP6 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PapolbQ9WVP6 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PapolbQ9WVP6 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PapolbQ9WVP6 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PapolbQ9WVP6 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PapolbQ9WVP6 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PapolbQ9WVP6 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PapolbQ9WVP6 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PapolbQ9WVP6 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PapolbQ9WVP6 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PapolbQ9WVP6 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PapolbQ9WVP6 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PapolbQ9WVP6 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PapolbQ9WVP6 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PapolbQ9WVP6 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PapolbQ9WVP6 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PapolbQ9WVP6 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PapolbQ9WVP6 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PapolbQ9WVP6 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.26
PapolbQ9WVP6 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PapolbQ9WVP6 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PapolbQ9WVP6 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
PapolbQ9WVP6 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PapolbQ9WVP6 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PapolbQ9WVP6 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PapolbQ9WVP6 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PapolbQ9WVP6 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PapolbQ9WVP6 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PapolbQ9WVP6 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PapolbQ9WVP6 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PapolbQ9WVP6 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PapolbQ9WVP6 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PapolbQ9WVP6 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms