Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVG6

Carm1, Histone-arginine methyltransferase CARM1, mousemouse

Predictions only

Length 608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carm1Q9WVG6 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Carm1Q9WVG6 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Carm1Q9WVG6 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Carm1Q9WVG6 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Carm1Q9WVG6 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Carm1Q9WVG6 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Carm1Q9WVG6 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Carm1Q9WVG6 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Carm1Q9WVG6 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Carm1Q9WVG6 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Carm1Q9WVG6 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Carm1Q9WVG6 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Carm1Q9WVG6 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Carm1Q9WVG6 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Carm1Q9WVG6 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Carm1Q9WVG6 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Carm1Q9WVG6 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Carm1Q9WVG6 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Carm1Q9WVG6 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Carm1Q9WVG6 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Carm1Q9WVG6 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Carm1Q9WVG6 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Carm1Q9WVG6 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Carm1Q9WVG6 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Carm1Q9WVG6 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Carm1Q9WVG6 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Carm1Q9WVG6 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Carm1Q9WVG6 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Carm1Q9WVG6 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Carm1Q9WVG6 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Carm1Q9WVG6 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Carm1Q9WVG6 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Carm1Q9WVG6 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Carm1Q9WVG6 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Carm1Q9WVG6 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Carm1Q9WVG6 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Carm1Q9WVG6 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Carm1Q9WVG6 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Carm1Q9WVG6 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Carm1Q9WVG6 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Carm1Q9WVG6 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Carm1Q9WVG6 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Carm1Q9WVG6 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Carm1Q9WVG6 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Carm1Q9WVG6 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Carm1Q9WVG6 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Carm1Q9WVG6 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Carm1Q9WVG6 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Carm1Q9WVG6 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Carm1Q9WVG6 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Carm1Q9WVG6 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Carm1Q9WVG6 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Carm1Q9WVG6 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Carm1Q9WVG6 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Carm1Q9WVG6 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Carm1Q9WVG6 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Carm1Q9WVG6 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Carm1Q9WVG6 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Carm1Q9WVG6 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Carm1Q9WVG6 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Carm1Q9WVG6 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Carm1Q9WVG6 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Carm1Q9WVG6 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Carm1Q9WVG6 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Carm1Q9WVG6 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Carm1Q9WVG6 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Carm1Q9WVG6 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Carm1Q9WVG6 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Carm1Q9WVG6 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Carm1Q9WVG6 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Carm1Q9WVG6 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Carm1Q9WVG6 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Carm1Q9WVG6 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Carm1Q9WVG6 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Carm1Q9WVG6 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Carm1Q9WVG6 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Carm1Q9WVG6 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Carm1Q9WVG6 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Carm1Q9WVG6 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Carm1Q9WVG6 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Carm1Q9WVG6 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Carm1Q9WVG6 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Carm1Q9WVG6 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Carm1Q9WVG6 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Carm1Q9WVG6 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Carm1Q9WVG6 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Carm1Q9WVG6 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Carm1Q9WVG6 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Carm1Q9WVG6 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Carm1Q9WVG6 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Carm1Q9WVG6 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Carm1Q9WVG6 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Carm1Q9WVG6 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Carm1Q9WVG6 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Carm1Q9WVG6 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Carm1Q9WVG6 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Carm1Q9WVG6 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Carm1Q9WVG6 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Carm1Q9WVG6 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Carm1Q9WVG6 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms