Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVD4

Clcn5, H(+)/Cl(-) exchange transporter 5, mousemouse

Predictions only

Length 746 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn5Q9WVD4 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clcn5Q9WVD4 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clcn5Q9WVD4 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clcn5Q9WVD4 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clcn5Q9WVD4 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clcn5Q9WVD4 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clcn5Q9WVD4 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clcn5Q9WVD4 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clcn5Q9WVD4 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clcn5Q9WVD4 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clcn5Q9WVD4 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clcn5Q9WVD4 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clcn5Q9WVD4 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clcn5Q9WVD4 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clcn5Q9WVD4 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clcn5Q9WVD4 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Clcn5Q9WVD4 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clcn5Q9WVD4 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clcn5Q9WVD4 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clcn5Q9WVD4 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clcn5Q9WVD4 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clcn5Q9WVD4 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clcn5Q9WVD4 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clcn5Q9WVD4 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clcn5Q9WVD4 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Clcn5Q9WVD4 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Clcn5Q9WVD4 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Clcn5Q9WVD4 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Clcn5Q9WVD4 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Clcn5Q9WVD4 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clcn5Q9WVD4 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clcn5Q9WVD4 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clcn5Q9WVD4 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clcn5Q9WVD4 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clcn5Q9WVD4 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clcn5Q9WVD4 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clcn5Q9WVD4 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Clcn5Q9WVD4 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clcn5Q9WVD4 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clcn5Q9WVD4 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clcn5Q9WVD4 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clcn5Q9WVD4 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Clcn5Q9WVD4 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clcn5Q9WVD4 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clcn5Q9WVD4 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Clcn5Q9WVD4 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clcn5Q9WVD4 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clcn5Q9WVD4 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clcn5Q9WVD4 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clcn5Q9WVD4 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clcn5Q9WVD4 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clcn5Q9WVD4 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clcn5Q9WVD4 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clcn5Q9WVD4 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clcn5Q9WVD4 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clcn5Q9WVD4 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clcn5Q9WVD4 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clcn5Q9WVD4 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clcn5Q9WVD4 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clcn5Q9WVD4 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clcn5Q9WVD4 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clcn5Q9WVD4 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clcn5Q9WVD4 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clcn5Q9WVD4 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clcn5Q9WVD4 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clcn5Q9WVD4 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clcn5Q9WVD4 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clcn5Q9WVD4 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Clcn5Q9WVD4 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clcn5Q9WVD4 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clcn5Q9WVD4 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Clcn5Q9WVD4 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Clcn5Q9WVD4 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Clcn5Q9WVD4 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clcn5Q9WVD4 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clcn5Q9WVD4 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clcn5Q9WVD4 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clcn5Q9WVD4 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clcn5Q9WVD4 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clcn5Q9WVD4 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clcn5Q9WVD4 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clcn5Q9WVD4 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clcn5Q9WVD4 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clcn5Q9WVD4 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clcn5Q9WVD4 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clcn5Q9WVD4 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Clcn5Q9WVD4 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clcn5Q9WVD4 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clcn5Q9WVD4 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clcn5Q9WVD4 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clcn5Q9WVD4 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clcn5Q9WVD4 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clcn5Q9WVD4 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clcn5Q9WVD4 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clcn5Q9WVD4 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clcn5Q9WVD4 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clcn5Q9WVD4 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clcn5Q9WVD4 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Clcn5Q9WVD4 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clcn5Q9WVD4 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms