Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV85

Nme3, Nucleoside diphosphate kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme3Q9WV85 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nme3Q9WV85 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nme3Q9WV85 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nme3Q9WV85 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nme3Q9WV85 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Nme3Q9WV85 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nme3Q9WV85 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nme3Q9WV85 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nme3Q9WV85 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Nme3Q9WV85 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nme3Q9WV85 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nme3Q9WV85 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Nme3Q9WV85 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nme3Q9WV85 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nme3Q9WV85 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nme3Q9WV85 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nme3Q9WV85 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nme3Q9WV85 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nme3Q9WV85 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nme3Q9WV85 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Nme3Q9WV85 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nme3Q9WV85 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Nme3Q9WV85 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nme3Q9WV85 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nme3Q9WV85 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nme3Q9WV85 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nme3Q9WV85 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nme3Q9WV85 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nme3Q9WV85 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nme3Q9WV85 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nme3Q9WV85 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nme3Q9WV85 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nme3Q9WV85 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nme3Q9WV85 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nme3Q9WV85 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nme3Q9WV85 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Nme3Q9WV85 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nme3Q9WV85 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Nme3Q9WV85 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nme3Q9WV85 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nme3Q9WV85 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nme3Q9WV85 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nme3Q9WV85 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nme3Q9WV85 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nme3Q9WV85 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nme3Q9WV85 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nme3Q9WV85 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nme3Q9WV85 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nme3Q9WV85 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nme3Q9WV85 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nme3Q9WV85 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nme3Q9WV85 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nme3Q9WV85 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nme3Q9WV85 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nme3Q9WV85 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nme3Q9WV85 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nme3Q9WV85 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nme3Q9WV85 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Nme3Q9WV85 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Nme3Q9WV85 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nme3Q9WV85 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nme3Q9WV85 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nme3Q9WV85 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nme3Q9WV85 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nme3Q9WV85 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Nme3Q9WV85 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nme3Q9WV85 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nme3Q9WV85 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nme3Q9WV85 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nme3Q9WV85 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nme3Q9WV85 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nme3Q9WV85 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nme3Q9WV85 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nme3Q9WV85 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nme3Q9WV85 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nme3Q9WV85 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nme3Q9WV85 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nme3Q9WV85 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nme3Q9WV85 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Nme3Q9WV85 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nme3Q9WV85 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nme3Q9WV85 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nme3Q9WV85 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nme3Q9WV85 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nme3Q9WV85 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nme3Q9WV85 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nme3Q9WV85 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nme3Q9WV85 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nme3Q9WV85 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nme3Q9WV85 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nme3Q9WV85 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nme3Q9WV85 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nme3Q9WV85 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nme3Q9WV85 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nme3Q9WV85 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nme3Q9WV85 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nme3Q9WV85 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nme3Q9WV85 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Nme3Q9WV85 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nme3Q9WV85 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms