Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV31

Arc, Activity-regulated cytoskeleton-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArcQ9WV31 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ArcQ9WV31 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ArcQ9WV31 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ArcQ9WV31 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ArcQ9WV31 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ArcQ9WV31 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ArcQ9WV31 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ArcQ9WV31 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ArcQ9WV31 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ArcQ9WV31 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ArcQ9WV31 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ArcQ9WV31 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ArcQ9WV31 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ArcQ9WV31 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ArcQ9WV31 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ArcQ9WV31 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ArcQ9WV31 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ArcQ9WV31 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ArcQ9WV31 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ArcQ9WV31 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ArcQ9WV31 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ArcQ9WV31 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ArcQ9WV31 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ArcQ9WV31 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ArcQ9WV31 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ArcQ9WV31 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ArcQ9WV31 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ArcQ9WV31 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ArcQ9WV31 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ArcQ9WV31 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ArcQ9WV31 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ArcQ9WV31 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ArcQ9WV31 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ArcQ9WV31 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ArcQ9WV31 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ArcQ9WV31 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ArcQ9WV31 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ArcQ9WV31 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ArcQ9WV31 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ArcQ9WV31 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ArcQ9WV31 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ArcQ9WV31 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ArcQ9WV31 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ArcQ9WV31 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ArcQ9WV31 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ArcQ9WV31 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ArcQ9WV31 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ArcQ9WV31 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ArcQ9WV31 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ArcQ9WV31 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ArcQ9WV31 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ArcQ9WV31 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ArcQ9WV31 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ArcQ9WV31 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ArcQ9WV31 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ArcQ9WV31 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ArcQ9WV31 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ArcQ9WV31 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ArcQ9WV31 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ArcQ9WV31 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ArcQ9WV31 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ArcQ9WV31 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ArcQ9WV31 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ArcQ9WV31 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ArcQ9WV31 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ArcQ9WV31 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ArcQ9WV31 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ArcQ9WV31 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ArcQ9WV31 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ArcQ9WV31 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ArcQ9WV31 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ArcQ9WV31 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ArcQ9WV31 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ArcQ9WV31 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ArcQ9WV31 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ArcQ9WV31 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ArcQ9WV31 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ArcQ9WV31 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ArcQ9WV31 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ArcQ9WV31 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ArcQ9WV31 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ArcQ9WV31 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ArcQ9WV31 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ArcQ9WV31 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ArcQ9WV31 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ArcQ9WV31 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ArcQ9WV31 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ArcQ9WV31 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ArcQ9WV31 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ArcQ9WV31 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ArcQ9WV31 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ArcQ9WV31 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ArcQ9WV31 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ArcQ9WV31 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ArcQ9WV31 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ArcQ9WV31 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ArcQ9WV31 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ArcQ9WV31 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ArcQ9WV31 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ArcQ9WV31 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms