Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUK7

Opn3, Opsin-3, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn3Q9WUK7 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Opn3Q9WUK7 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Opn3Q9WUK7 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Opn3Q9WUK7 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Opn3Q9WUK7 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Opn3Q9WUK7 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Opn3Q9WUK7 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Opn3Q9WUK7 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Opn3Q9WUK7 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Opn3Q9WUK7 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Opn3Q9WUK7 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Opn3Q9WUK7 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Opn3Q9WUK7 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Opn3Q9WUK7 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Opn3Q9WUK7 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Opn3Q9WUK7 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Opn3Q9WUK7 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Opn3Q9WUK7 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Opn3Q9WUK7 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Opn3Q9WUK7 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Opn3Q9WUK7 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Opn3Q9WUK7 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Opn3Q9WUK7 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Opn3Q9WUK7 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Opn3Q9WUK7 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Opn3Q9WUK7 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Opn3Q9WUK7 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Opn3Q9WUK7 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Opn3Q9WUK7 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Opn3Q9WUK7 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Opn3Q9WUK7 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Opn3Q9WUK7 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Opn3Q9WUK7 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Opn3Q9WUK7 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Opn3Q9WUK7 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Opn3Q9WUK7 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Opn3Q9WUK7 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Opn3Q9WUK7 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Opn3Q9WUK7 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Opn3Q9WUK7 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Opn3Q9WUK7 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Opn3Q9WUK7 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Opn3Q9WUK7 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Opn3Q9WUK7 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Opn3Q9WUK7 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Opn3Q9WUK7 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Opn3Q9WUK7 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Opn3Q9WUK7 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Opn3Q9WUK7 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Opn3Q9WUK7 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Opn3Q9WUK7 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Opn3Q9WUK7 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Opn3Q9WUK7 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Opn3Q9WUK7 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Opn3Q9WUK7 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Opn3Q9WUK7 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Opn3Q9WUK7 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Opn3Q9WUK7 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Opn3Q9WUK7 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Opn3Q9WUK7 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Opn3Q9WUK7 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Opn3Q9WUK7 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Opn3Q9WUK7 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Opn3Q9WUK7 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Opn3Q9WUK7 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Opn3Q9WUK7 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Opn3Q9WUK7 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Opn3Q9WUK7 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Opn3Q9WUK7 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Opn3Q9WUK7 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Opn3Q9WUK7 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Opn3Q9WUK7 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Opn3Q9WUK7 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Opn3Q9WUK7 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Opn3Q9WUK7 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Opn3Q9WUK7 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Opn3Q9WUK7 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Opn3Q9WUK7 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Opn3Q9WUK7 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Opn3Q9WUK7 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Opn3Q9WUK7 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Opn3Q9WUK7 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Opn3Q9WUK7 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Opn3Q9WUK7 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Opn3Q9WUK7 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Opn3Q9WUK7 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Opn3Q9WUK7 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Opn3Q9WUK7 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Opn3Q9WUK7 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Opn3Q9WUK7 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Opn3Q9WUK7 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Opn3Q9WUK7 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Opn3Q9WUK7 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Opn3Q9WUK7 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Opn3Q9WUK7 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Opn3Q9WUK7 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Opn3Q9WUK7 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Opn3Q9WUK7 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Opn3Q9WUK7 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Opn3Q9WUK7 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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