Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU38

Scnn1b, Amiloride-sensitive sodium channel subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scnn1bQ9WU38 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Scnn1bQ9WU38 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Scnn1bQ9WU38 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Scnn1bQ9WU38 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Scnn1bQ9WU38 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Scnn1bQ9WU38 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Scnn1bQ9WU38 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Scnn1bQ9WU38 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Scnn1bQ9WU38 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Scnn1bQ9WU38 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Scnn1bQ9WU38 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Scnn1bQ9WU38 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Scnn1bQ9WU38 Olfr1233-203ENSMUST00000215469 1205 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Scnn1bQ9WU38 Olfr1233-204ENSMUST00000216561 1192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Scnn1bQ9WU38 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Scnn1bQ9WU38 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Scnn1bQ9WU38 Prl8a1-201ENSMUST00000006664 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Scnn1bQ9WU38 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Scnn1bQ9WU38 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Scnn1bQ9WU38 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Scnn1bQ9WU38 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Scnn1bQ9WU38 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Scnn1bQ9WU38 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Scnn1bQ9WU38 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Scnn1bQ9WU38 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Scnn1bQ9WU38 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Scnn1bQ9WU38 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Scnn1bQ9WU38 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Scnn1bQ9WU38 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Scnn1bQ9WU38 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Scnn1bQ9WU38 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Scnn1bQ9WU38 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Scnn1bQ9WU38 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Scnn1bQ9WU38 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Scnn1bQ9WU38 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Scnn1bQ9WU38 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Scnn1bQ9WU38 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Scnn1bQ9WU38 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Scnn1bQ9WU38 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Scnn1bQ9WU38 Gm14913-201ENSMUST00000120011 1093 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Scnn1bQ9WU38 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Scnn1bQ9WU38 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Scnn1bQ9WU38 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Scnn1bQ9WU38 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Scnn1bQ9WU38 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Scnn1bQ9WU38 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Scnn1bQ9WU38 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Scnn1bQ9WU38 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Scnn1bQ9WU38 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Scnn1bQ9WU38 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Scnn1bQ9WU38 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Scnn1bQ9WU38 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Scnn1bQ9WU38 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Scnn1bQ9WU38 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Scnn1bQ9WU38 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Scnn1bQ9WU38 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Scnn1bQ9WU38 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Scnn1bQ9WU38 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Scnn1bQ9WU38 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Scnn1bQ9WU38 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Scnn1bQ9WU38 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Scnn1bQ9WU38 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Scnn1bQ9WU38 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Scnn1bQ9WU38 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Scnn1bQ9WU38 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Scnn1bQ9WU38 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Scnn1bQ9WU38 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Scnn1bQ9WU38 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Scnn1bQ9WU38 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Scnn1bQ9WU38 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Scnn1bQ9WU38 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Scnn1bQ9WU38 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Scnn1bQ9WU38 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Scnn1bQ9WU38 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Scnn1bQ9WU38 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Scnn1bQ9WU38 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Scnn1bQ9WU38 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Scnn1bQ9WU38 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Scnn1bQ9WU38 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Scnn1bQ9WU38 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Scnn1bQ9WU38 Tmem150cos-201ENSMUST00000143245 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Scnn1bQ9WU38 Gm16275-201ENSMUST00000147774 712 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Scnn1bQ9WU38 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Scnn1bQ9WU38 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Scnn1bQ9WU38 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Scnn1bQ9WU38 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Scnn1bQ9WU38 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Scnn1bQ9WU38 4930405J17Rik-201ENSMUST00000214323 620 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Scnn1bQ9WU38 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Scnn1bQ9WU38 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Scnn1bQ9WU38 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Scnn1bQ9WU38 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Scnn1bQ9WU38 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Scnn1bQ9WU38 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Scnn1bQ9WU38 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Scnn1bQ9WU38 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Scnn1bQ9WU38 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Scnn1bQ9WU38 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Scnn1bQ9WU38 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Scnn1bQ9WU38 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms