Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTV6

Usp18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp18Q9WTV6 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp18Q9WTV6 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp18Q9WTV6 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp18Q9WTV6 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp18Q9WTV6 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp18Q9WTV6 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Usp18Q9WTV6 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Usp18Q9WTV6 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Usp18Q9WTV6 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Usp18Q9WTV6 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp18Q9WTV6 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp18Q9WTV6 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp18Q9WTV6 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp18Q9WTV6 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp18Q9WTV6 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp18Q9WTV6 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp18Q9WTV6 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp18Q9WTV6 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp18Q9WTV6 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp18Q9WTV6 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp18Q9WTV6 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp18Q9WTV6 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp18Q9WTV6 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp18Q9WTV6 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp18Q9WTV6 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp18Q9WTV6 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp18Q9WTV6 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp18Q9WTV6 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp18Q9WTV6 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp18Q9WTV6 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp18Q9WTV6 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp18Q9WTV6 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp18Q9WTV6 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp18Q9WTV6 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp18Q9WTV6 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp18Q9WTV6 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp18Q9WTV6 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp18Q9WTV6 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp18Q9WTV6 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp18Q9WTV6 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp18Q9WTV6 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp18Q9WTV6 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp18Q9WTV6 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp18Q9WTV6 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp18Q9WTV6 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp18Q9WTV6 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp18Q9WTV6 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp18Q9WTV6 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp18Q9WTV6 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp18Q9WTV6 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp18Q9WTV6 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp18Q9WTV6 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp18Q9WTV6 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp18Q9WTV6 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp18Q9WTV6 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp18Q9WTV6 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp18Q9WTV6 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp18Q9WTV6 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp18Q9WTV6 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp18Q9WTV6 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp18Q9WTV6 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp18Q9WTV6 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp18Q9WTV6 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp18Q9WTV6 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp18Q9WTV6 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp18Q9WTV6 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp18Q9WTV6 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp18Q9WTV6 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp18Q9WTV6 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp18Q9WTV6 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp18Q9WTV6 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp18Q9WTV6 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp18Q9WTV6 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp18Q9WTV6 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp18Q9WTV6 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp18Q9WTV6 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp18Q9WTV6 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp18Q9WTV6 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp18Q9WTV6 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp18Q9WTV6 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp18Q9WTV6 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp18Q9WTV6 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp18Q9WTV6 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp18Q9WTV6 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp18Q9WTV6 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp18Q9WTV6 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp18Q9WTV6 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp18Q9WTV6 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp18Q9WTV6 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp18Q9WTV6 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp18Q9WTV6 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp18Q9WTV6 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp18Q9WTV6 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp18Q9WTV6 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp18Q9WTV6 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp18Q9WTV6 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp18Q9WTV6 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp18Q9WTV6 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp18Q9WTV6 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp18Q9WTV6 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms