Protein–RNA interactions for Protein: Q9R233

Tapbp, Tapasin, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TapbpQ9R233 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TapbpQ9R233 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TapbpQ9R233 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TapbpQ9R233 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TapbpQ9R233 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TapbpQ9R233 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TapbpQ9R233 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TapbpQ9R233 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
TapbpQ9R233 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TapbpQ9R233 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TapbpQ9R233 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TapbpQ9R233 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TapbpQ9R233 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TapbpQ9R233 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TapbpQ9R233 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
TapbpQ9R233 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TapbpQ9R233 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TapbpQ9R233 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TapbpQ9R233 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TapbpQ9R233 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TapbpQ9R233 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TapbpQ9R233 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TapbpQ9R233 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TapbpQ9R233 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TapbpQ9R233 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TapbpQ9R233 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TapbpQ9R233 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TapbpQ9R233 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TapbpQ9R233 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TapbpQ9R233 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TapbpQ9R233 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TapbpQ9R233 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TapbpQ9R233 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TapbpQ9R233 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TapbpQ9R233 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TapbpQ9R233 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TapbpQ9R233 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TapbpQ9R233 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
TapbpQ9R233 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TapbpQ9R233 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TapbpQ9R233 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TapbpQ9R233 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TapbpQ9R233 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TapbpQ9R233 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TapbpQ9R233 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TapbpQ9R233 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TapbpQ9R233 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TapbpQ9R233 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TapbpQ9R233 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TapbpQ9R233 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TapbpQ9R233 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
TapbpQ9R233 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TapbpQ9R233 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TapbpQ9R233 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TapbpQ9R233 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TapbpQ9R233 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TapbpQ9R233 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TapbpQ9R233 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TapbpQ9R233 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TapbpQ9R233 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TapbpQ9R233 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TapbpQ9R233 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TapbpQ9R233 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
TapbpQ9R233 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
TapbpQ9R233 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TapbpQ9R233 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TapbpQ9R233 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
TapbpQ9R233 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
TapbpQ9R233 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
TapbpQ9R233 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TapbpQ9R233 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
TapbpQ9R233 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TapbpQ9R233 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TapbpQ9R233 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TapbpQ9R233 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TapbpQ9R233 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TapbpQ9R233 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TapbpQ9R233 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
TapbpQ9R233 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TapbpQ9R233 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TapbpQ9R233 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TapbpQ9R233 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
TapbpQ9R233 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
TapbpQ9R233 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TapbpQ9R233 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TapbpQ9R233 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TapbpQ9R233 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TapbpQ9R233 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TapbpQ9R233 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TapbpQ9R233 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TapbpQ9R233 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TapbpQ9R233 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TapbpQ9R233 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TapbpQ9R233 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TapbpQ9R233 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TapbpQ9R233 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TapbpQ9R233 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TapbpQ9R233 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TapbpQ9R233 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TapbpQ9R233 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms