Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1T4

Sept6, Septin-6, mousemouse

Predictions only

Length 434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sept6Q9R1T4 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Sept6Q9R1T4 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sept6Q9R1T4 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sept6Q9R1T4 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sept6Q9R1T4 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sept6Q9R1T4 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sept6Q9R1T4 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sept6Q9R1T4 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sept6Q9R1T4 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sept6Q9R1T4 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sept6Q9R1T4 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sept6Q9R1T4 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sept6Q9R1T4 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sept6Q9R1T4 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sept6Q9R1T4 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sept6Q9R1T4 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sept6Q9R1T4 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sept6Q9R1T4 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sept6Q9R1T4 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sept6Q9R1T4 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sept6Q9R1T4 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sept6Q9R1T4 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sept6Q9R1T4 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sept6Q9R1T4 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sept6Q9R1T4 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sept6Q9R1T4 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sept6Q9R1T4 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sept6Q9R1T4 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sept6Q9R1T4 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Sept6Q9R1T4 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sept6Q9R1T4 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sept6Q9R1T4 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sept6Q9R1T4 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sept6Q9R1T4 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sept6Q9R1T4 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sept6Q9R1T4 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sept6Q9R1T4 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sept6Q9R1T4 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sept6Q9R1T4 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sept6Q9R1T4 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sept6Q9R1T4 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sept6Q9R1T4 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sept6Q9R1T4 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sept6Q9R1T4 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sept6Q9R1T4 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sept6Q9R1T4 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sept6Q9R1T4 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sept6Q9R1T4 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sept6Q9R1T4 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sept6Q9R1T4 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sept6Q9R1T4 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sept6Q9R1T4 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sept6Q9R1T4 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sept6Q9R1T4 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sept6Q9R1T4 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Sept6Q9R1T4 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sept6Q9R1T4 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sept6Q9R1T4 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sept6Q9R1T4 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sept6Q9R1T4 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sept6Q9R1T4 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sept6Q9R1T4 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sept6Q9R1T4 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sept6Q9R1T4 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sept6Q9R1T4 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sept6Q9R1T4 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sept6Q9R1T4 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sept6Q9R1T4 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sept6Q9R1T4 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sept6Q9R1T4 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sept6Q9R1T4 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sept6Q9R1T4 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sept6Q9R1T4 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sept6Q9R1T4 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sept6Q9R1T4 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sept6Q9R1T4 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sept6Q9R1T4 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sept6Q9R1T4 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sept6Q9R1T4 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Sept6Q9R1T4 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sept6Q9R1T4 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sept6Q9R1T4 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sept6Q9R1T4 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sept6Q9R1T4 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sept6Q9R1T4 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sept6Q9R1T4 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sept6Q9R1T4 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sept6Q9R1T4 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sept6Q9R1T4 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sept6Q9R1T4 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sept6Q9R1T4 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sept6Q9R1T4 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sept6Q9R1T4 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sept6Q9R1T4 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sept6Q9R1T4 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sept6Q9R1T4 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sept6Q9R1T4 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sept6Q9R1T4 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sept6Q9R1T4 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sept6Q9R1T4 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms