Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1Q9

Atp6ap1, V-type proton ATPase subunit S1, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6ap1Q9R1Q9 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp6ap1Q9R1Q9 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp6ap1Q9R1Q9 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp6ap1Q9R1Q9 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp6ap1Q9R1Q9 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp6ap1Q9R1Q9 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp6ap1Q9R1Q9 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp6ap1Q9R1Q9 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp6ap1Q9R1Q9 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp6ap1Q9R1Q9 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp6ap1Q9R1Q9 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp6ap1Q9R1Q9 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp6ap1Q9R1Q9 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp6ap1Q9R1Q9 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp6ap1Q9R1Q9 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp6ap1Q9R1Q9 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp6ap1Q9R1Q9 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp6ap1Q9R1Q9 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp6ap1Q9R1Q9 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp6ap1Q9R1Q9 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp6ap1Q9R1Q9 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp6ap1Q9R1Q9 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp6ap1Q9R1Q9 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp6ap1Q9R1Q9 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp6ap1Q9R1Q9 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp6ap1Q9R1Q9 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp6ap1Q9R1Q9 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atp6ap1Q9R1Q9 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atp6ap1Q9R1Q9 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atp6ap1Q9R1Q9 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp6ap1Q9R1Q9 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp6ap1Q9R1Q9 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp6ap1Q9R1Q9 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp6ap1Q9R1Q9 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp6ap1Q9R1Q9 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp6ap1Q9R1Q9 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp6ap1Q9R1Q9 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp6ap1Q9R1Q9 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp6ap1Q9R1Q9 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp6ap1Q9R1Q9 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp6ap1Q9R1Q9 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp6ap1Q9R1Q9 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp6ap1Q9R1Q9 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp6ap1Q9R1Q9 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp6ap1Q9R1Q9 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp6ap1Q9R1Q9 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp6ap1Q9R1Q9 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp6ap1Q9R1Q9 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp6ap1Q9R1Q9 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp6ap1Q9R1Q9 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp6ap1Q9R1Q9 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp6ap1Q9R1Q9 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp6ap1Q9R1Q9 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp6ap1Q9R1Q9 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp6ap1Q9R1Q9 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp6ap1Q9R1Q9 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp6ap1Q9R1Q9 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp6ap1Q9R1Q9 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp6ap1Q9R1Q9 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp6ap1Q9R1Q9 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp6ap1Q9R1Q9 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp6ap1Q9R1Q9 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp6ap1Q9R1Q9 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp6ap1Q9R1Q9 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp6ap1Q9R1Q9 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp6ap1Q9R1Q9 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp6ap1Q9R1Q9 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp6ap1Q9R1Q9 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp6ap1Q9R1Q9 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp6ap1Q9R1Q9 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp6ap1Q9R1Q9 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp6ap1Q9R1Q9 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp6ap1Q9R1Q9 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp6ap1Q9R1Q9 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp6ap1Q9R1Q9 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp6ap1Q9R1Q9 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp6ap1Q9R1Q9 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp6ap1Q9R1Q9 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp6ap1Q9R1Q9 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp6ap1Q9R1Q9 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp6ap1Q9R1Q9 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp6ap1Q9R1Q9 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp6ap1Q9R1Q9 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp6ap1Q9R1Q9 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp6ap1Q9R1Q9 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp6ap1Q9R1Q9 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp6ap1Q9R1Q9 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp6ap1Q9R1Q9 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp6ap1Q9R1Q9 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp6ap1Q9R1Q9 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp6ap1Q9R1Q9 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms