Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P0

Psma4, Proteasome subunit alpha type-4, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma4Q9R1P0 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psma4Q9R1P0 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Psma4Q9R1P0 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psma4Q9R1P0 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psma4Q9R1P0 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psma4Q9R1P0 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psma4Q9R1P0 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psma4Q9R1P0 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psma4Q9R1P0 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psma4Q9R1P0 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psma4Q9R1P0 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psma4Q9R1P0 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psma4Q9R1P0 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psma4Q9R1P0 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psma4Q9R1P0 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psma4Q9R1P0 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psma4Q9R1P0 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psma4Q9R1P0 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psma4Q9R1P0 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psma4Q9R1P0 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psma4Q9R1P0 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psma4Q9R1P0 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psma4Q9R1P0 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psma4Q9R1P0 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psma4Q9R1P0 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psma4Q9R1P0 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psma4Q9R1P0 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psma4Q9R1P0 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psma4Q9R1P0 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psma4Q9R1P0 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Psma4Q9R1P0 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psma4Q9R1P0 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psma4Q9R1P0 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psma4Q9R1P0 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psma4Q9R1P0 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psma4Q9R1P0 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psma4Q9R1P0 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psma4Q9R1P0 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psma4Q9R1P0 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psma4Q9R1P0 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psma4Q9R1P0 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psma4Q9R1P0 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psma4Q9R1P0 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psma4Q9R1P0 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psma4Q9R1P0 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psma4Q9R1P0 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psma4Q9R1P0 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psma4Q9R1P0 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psma4Q9R1P0 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psma4Q9R1P0 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psma4Q9R1P0 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psma4Q9R1P0 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psma4Q9R1P0 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psma4Q9R1P0 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psma4Q9R1P0 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psma4Q9R1P0 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psma4Q9R1P0 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psma4Q9R1P0 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psma4Q9R1P0 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psma4Q9R1P0 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psma4Q9R1P0 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psma4Q9R1P0 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psma4Q9R1P0 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psma4Q9R1P0 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psma4Q9R1P0 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Psma4Q9R1P0 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psma4Q9R1P0 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psma4Q9R1P0 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psma4Q9R1P0 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psma4Q9R1P0 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psma4Q9R1P0 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psma4Q9R1P0 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psma4Q9R1P0 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psma4Q9R1P0 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psma4Q9R1P0 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psma4Q9R1P0 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psma4Q9R1P0 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psma4Q9R1P0 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psma4Q9R1P0 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psma4Q9R1P0 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psma4Q9R1P0 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psma4Q9R1P0 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psma4Q9R1P0 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psma4Q9R1P0 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psma4Q9R1P0 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psma4Q9R1P0 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psma4Q9R1P0 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Psma4Q9R1P0 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psma4Q9R1P0 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psma4Q9R1P0 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psma4Q9R1P0 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psma4Q9R1P0 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psma4Q9R1P0 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Psma4Q9R1P0 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psma4Q9R1P0 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psma4Q9R1P0 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psma4Q9R1P0 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psma4Q9R1P0 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psma4Q9R1P0 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psma4Q9R1P0 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms